RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583841.1

TSPOAP1-AS1-210, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSPOAP1-AS1, Length 840 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 STARD3NLO95772 234 aa20.25■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HOXB7P09629 217 aa20.25■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.24■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.24■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 VAMP4O75379 141 aa20.23■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 UBR3Q6ZT12 1888 aa20.23■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 A1BGP04217 495 aa20.22■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CACNA1FO60840 1977 aa20.22■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.21■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.21■□□□□ 0.83
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 AK7Q96M32 723 aa20.2■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa20.2■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF827Q17R98 1081 aa20.19■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.19■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.19■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GNPATO15228 680 aa20.18■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NBPF26B4DH59 902 aa20.17■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ANXA1P04083 346 aa20.17■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MYL6BP14649 208 aa20.17■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PROSER3Q2NL68 480 aa20.17■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NBPF14Q5TI25 921 aa20.17■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NBPF15Q8N660 670 aa20.17■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.17■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ERBB4Q15303 1308 aa20.17■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 C4AP0C0L4 1744 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 QSER1Q2KHR3 1735 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SMIM5Q71RC9 77 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 AKT1S1Q96B36 256 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 STK31Q9BXU1 1019 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SOCS7O14512 581 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PDIA6Q15084 440 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.821e-7■□□□□ 8.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 STK32BQ9NY57 414 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PHF14O94880 888 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF428Q96B54 188 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 COL15A1P39059 1388 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RPS6KA4O75676 772 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SLC15A2Q16348 729 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SLC4A2P04920 1241 aa20.12■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 EIF5P55010 431 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.11■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.11■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HYPKQ9NX55 129 aa20.11■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 BCORQ6W2J9 1755 aa20.11■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 G2E3Q7L622 706 aa20.1■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ARXQ96QS3 562 aa20.1■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.1■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SCN7AQ01118 1682 aa20.1■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SSFA2P28290 1259 aa20.09■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.09■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.08■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa20.08■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 BCAR3O75815 825 aa20.08■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.08■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 COPS6Q7L5N1 327 aa20.08■□□□□ 0.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NUP98P52948 1817 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ADRA2BP18089 450 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FLIIQ13045 1269 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 A0A087WZG4 1122 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MSH5O43196 834 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RFC4P35249 363 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FLAD1Q8NFF5 587 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CASZ1Q86V15 1759 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms