RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580814.1

TSG101-211, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

TSL 2

Gene TSG101, Length 441 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101-211ENST00000580814 CHMP3Q9Y3E7 222 aa10.03□□□□□ -0.8
TSG101-211ENST00000580814 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa10.03□□□□□ -0.8
TSG101-211ENST00000580814 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
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TSG101-211ENST00000580814 NOS2P35228 1153 aa10.02□□□□□ -0.81
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TSG101-211ENST00000580814 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa9.95□□□□□ -0.82
TSG101-211ENST00000580814 PARP3Q9Y6F1 533 aa9.95□□□□□ -0.82
TSG101-211ENST00000580814 PLA2G4AP47712 749 aa9.94□□□□□ -0.82
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TSG101-211ENST00000580814 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.82
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TSG101-211ENST00000580814 SENP2Q9HC62 589 aa9.94□□□□□ -0.82
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TSG101-211ENST00000580814 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
TSG101-211ENST00000580814 SAP130Q9H0E3 1048 aa9.92□□□□□ -0.82
TSG101-211ENST00000580814 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa9.92□□□□□ -0.82
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TSG101-211ENST00000580814 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
TSG101-211ENST00000580814 A0A1B0GTH6 734 aa9.91□□□□□ -0.82
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TSG101-211ENST00000580814 NPR3P17342 541 aa9.91□□□□□ -0.82
TSG101-211ENST00000580814 TXLNAP40222 546 aa9.91□□□□□ -0.82
TSG101-211ENST00000580814 AIDAQ96BJ3 306 aa9.91□□□□□ -0.82
TSG101-211ENST00000580814 RHOQP17081 205 aa9.9□□□□□ -0.82
TSG101-211ENST00000580814 NGLY1Q96IV0 654 aa9.9□□□□□ -0.82
TSG101-211ENST00000580814 LRFN2Q9ULH4 789 aa9.9□□□□□ -0.82
TSG101-211ENST00000580814 DYRK1BQ9Y463 629 aa9.9□□□□□ -0.82
TSG101-211ENST00000580814 TATP17735 454 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TSG101-211ENST00000580814 C11orf91Q3C1V1 193 aa9.89□□□□□ -0.83
TSG101-211ENST00000580814 TRIM47Q96LD4 638 aa9.89□□□□□ -0.83
TSG101-211ENST00000580814 TNFRSF10BO14763 440 aa9.88□□□□□ -0.83
TSG101-211ENST00000580814 MSX1P28360 303 aa9.88□□□□□ -0.83
TSG101-211ENST00000580814 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
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TSG101-211ENST00000580814 STIM2Q9P246 746 aa9.88□□□□□ -0.83
TSG101-211ENST00000580814 FAM13AO94988 1023 aa9.87□□□□□ -0.83
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TSG101-211ENST00000580814 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.87□□□□□ -0.83
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TSG101-211ENST00000580814 F11P03951 625 aa9.86□□□□□ -0.83
TSG101-211ENST00000580814 GLYCTKQ8IVS8 523 aa9.86□□□□□ -0.83
TSG101-211ENST00000580814 RHPN1Q8TCX5 695 aa9.86□□□□□ -0.83
TSG101-211ENST00000580814 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TSG101-211ENST00000580814 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa9.85□□□□□ -0.83
TSG101-211ENST00000580814 H3BRB1 525 aa9.85□□□□□ -0.83
TSG101-211ENST00000580814 LCE2BO14633 110 aa9.85□□□□□ -0.83
TSG101-211ENST00000580814 DGKZQ13574 1117 aa9.85□□□□□ -0.83
TSG101-211ENST00000580814 MTMR3Q13615 1198 aa9.85□□□□□ -0.83
TSG101-211ENST00000580814 ZIC5Q96T25 663 aa9.85□□□□□ -0.83
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