RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568104.5

BBS2-218, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene BBS2, Length 2,623 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2-218ENST00000568104 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.15■□□□□ 0.82
BBS2-218ENST00000568104 ERBB3P21860 1342 aa20.14■□□□□ 0.82
BBS2-218ENST00000568104 HEG1Q9ULI3 1381 aa20.14■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 CHMLP26374 656 aa20.14■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 PTMSP20962 102 aa20.13■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.13■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 LMTK3Q96Q04 1460 aa20.13■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.12■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 ALS2Q96Q42 1657 aa20.12■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.12■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.12■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 RGPD5Q99666 1765 aa20.11■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 ATF3P18847 181 aa20.11■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 SSFA2P28290 1259 aa20.11■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.11■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 MCCP23508 829 aa20.11■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 FSD2A1L4K1 749 aa20.1■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 ALDH1L1O75891 902 aa20.1■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 PROSER3Q2NL68 480 aa20.1■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.1■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 KSR2Q6VAB6 950 aa20.1■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 UNC5CLQ8IV45 518 aa20.1■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 CLEC17AQ6ZS10 378 aa20.1■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.1■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 HYPKQ9NX55 129 aa20.1■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.09■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 NUCB2P80303 420 aa20.09■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa20.09■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.09■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
BBS2-218ENST00000568104 MTX1Q13505 466 aa20.08■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.08■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.07■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.07■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 TMEM94Q12767 1356 aa20.07■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 ANAPC15P60006 121 aa20.07■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 PI4K2BQ8TCG2 481 aa20.07■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 NEK4P51957 841 aa20.06■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 DCCP43146 1447 aa20.06■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.05■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 ARXQ96QS3 562 aa20.05■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 SPG7Q9UQ90 795 aa20.05■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 MCM2P49736 904 aa20.05■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 ZNF790Q6PG37 636 aa20.05■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.05■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.04■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 LINS1Q8NG48 757 aa20.04■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 PALD1Q9ULE6 856 aa20.04■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 PHKG2P15735 406 aa20.03■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 CNTROBQ8N137 903 aa20.03■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.82e-6■□□□□ 10.1
BBS2-218ENST00000568104 PDIA6Q15084 440 aa20.03■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 IL17RAQ96F46 866 aa20.03■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 SLC39A6Q13433 755 aa20.02■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 TTC41PQ6P2S7 1318 aa20.02■□□□□ 0.8
BBS2-218ENST00000568104 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.02■□□□□ 0.79
BBS2-218ENST00000568104 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
BBS2-218ENST00000568104 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.02■□□□□ 0.79
BBS2-218ENST00000568104 GRM8O00222 908 aa20.01■□□□□ 0.79
BBS2-218ENST00000568104 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
BBS2-218ENST00000568104 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.01■□□□□ 0.79
BBS2-218ENST00000568104 TMX3Q96JJ7 454 aa20.01■□□□□ 0.79
BBS2-218ENST00000568104 AK9Q5TCS8 1911 aa20.01■□□□□ 0.79
BBS2-218ENST00000568104 MEGF6O75095 1541 aa20.01■□□□□ 0.79
BBS2-218ENST00000568104 MRE11P49959 708 aa20.01■□□□□ 0.79
BBS2-218ENST00000568104 CADPS2Q86UW7 1296 aa20.01■□□□□ 0.79
BBS2-218ENST00000568104 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.01■□□□□ 0.79
BBS2-218ENST00000568104 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.01■□□□□ 0.79
BBS2-218ENST00000568104 IL25Q9H293 177 aa20.01■□□□□ 0.79
BBS2-218ENST00000568104 UTYO14607 1347 aa20■□□□□ 0.79
BBS2-218ENST00000568104 COL18A1P39060 1754 aa20■□□□□ 0.79
BBS2-218ENST00000568104 PKP1Q13835 747 aa20■□□□□ 0.79
BBS2-218ENST00000568104 CABLES1Q8TDN4 633 aa20■□□□□ 0.79
BBS2-218ENST00000568104 ABCC6O95255 1503 aa20■□□□□ 0.79
BBS2-218ENST00000568104 STRCP1A6NGW2 1772 aa20■□□□□ 0.79
BBS2-218ENST00000568104 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
BBS2-218ENST00000568104 TNS3Q68CZ2 1445 aa20■□□□□ 0.79
BBS2-218ENST00000568104 SGSM2O43147 1006 aa19.99■□□□□ 0.79
BBS2-218ENST00000568104 HSPA4P34932 840 aa19.99■□□□□ 0.79
BBS2-218ENST00000568104 RIC3Q7Z5B4 369 aa19.99■□□□□ 0.79
BBS2-218ENST00000568104 SUCLG2Q96I99 432 aa19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms