RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC87Q9NVE4 849 aa27.35■■□□□ 1.97
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP16Q9Y5T5 823 aa27.35■■□□□ 1.97
CCNDBP1-208ENST00000566515 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZBTB7AO95365 584 aa27.34■■□□□ 1.97
CCNDBP1-208ENST00000566515 RPS6KA4O75676 772 aa27.33■■□□□ 1.97
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF853P0CG23 659 aa27.33■■□□□ 1.97
CCNDBP1-208ENST00000566515 SSFA2P28290 1259 aa27.33■■□□□ 1.97
CCNDBP1-208ENST00000566515 IFT57Q9NWB7 429 aa27.33■■□□□ 1.97
CCNDBP1-208ENST00000566515 FLAD1Q8NFF5 587 aa27.32■■□□□ 1.96
CCNDBP1-208ENST00000566515 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
CCNDBP1-208ENST00000566515 GNAI1P63096 354 aa27.31■■□□□ 1.96
CCNDBP1-208ENST00000566515 MBIPQ9NS73 344 aa27.31■■□□□ 1.96
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa27.31■■□□□ 1.96
CCNDBP1-208ENST00000566515 A1BGP04217 495 aa27.3■■□□□ 1.96
CCNDBP1-208ENST00000566515 CANXP27824 592 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRAPPC3LQ5T215 181 aa27.3■■□□□ 1.96
CCNDBP1-208ENST00000566515 LAMB4A4D0S4 1761 aa27.3■■□□□ 1.96
CCNDBP1-208ENST00000566515 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa27.29■■□□□ 1.96
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
CCNDBP1-208ENST00000566515 KRT24Q2M2I5 525 aa27.28■■□□□ 1.96
CCNDBP1-208ENST00000566515 NGEFQ8N5V2 710 aa27.28■■□□□ 1.96
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
CCNDBP1-208ENST00000566515 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC16A10Q8TF71 515 aa27.27■■□□□ 1.96
CCNDBP1-208ENST00000566515 MTFR1LQ9H019 292 aa27.27■■□□□ 1.96
CCNDBP1-208ENST00000566515 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
CCNDBP1-208ENST00000566515 C4AP0C0L4 1744 aa27.26■■□□□ 1.95
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADRA2BP18089 450 aa27.26■■□□□ 1.95
CCNDBP1-208ENST00000566515 WDR63Q8IWG1 891 aa27.26■■□□□ 1.95
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPON1Q9HCB6 807 aa27.25■■□□□ 1.95
CCNDBP1-208ENST00000566515 IL16Q14005 1332 aa27.25■■□□□ 1.95
CCNDBP1-208ENST00000566515 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
CCNDBP1-208ENST00000566515 RFC4P35249 363 aa27.23■■□□□ 1.95
CCNDBP1-208ENST00000566515 MSL1Q68DK7 614 aa27.23■■□□□ 1.95
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
CCNDBP1-208ENST00000566515 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
CCNDBP1-208ENST00000566515 EIF5P55010 431 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
CCNDBP1-208ENST00000566515 COL15A1P39059 1388 aa27.22■■□□□ 1.95
CCNDBP1-208ENST00000566515 NBPF26B4DH59 902 aa27.21■■□□□ 1.95
CCNDBP1-208ENST00000566515 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
CCNDBP1-208ENST00000566515 NBPF15Q8N660 670 aa27.21■■□□□ 1.95
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF521Q96K83 1311 aa27.21■■□□□ 1.95
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRP5O75197 1615 aa27.2■■□□□ 1.95
CCNDBP1-208ENST00000566515 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.95
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.95
CCNDBP1-208ENST00000566515 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTGER2P43116 358 aa27.19■■□□□ 1.94
CCNDBP1-208ENST00000566515 NECTIN2Q92692 538 aa27.19■■□□□ 1.94
CCNDBP1-208ENST00000566515 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
CCNDBP1-208ENST00000566515 DUSP27Q5VZP5 1158 aa27.19■■□□□ 1.94
CCNDBP1-208ENST00000566515 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.18■■□□□ 1.94
CCNDBP1-208ENST00000566515 C8orf58Q8NAV2 365 aa27.18■■□□□ 1.94
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
CCNDBP1-208ENST00000566515 SGIP1Q9BQI5 828 aa27.17■■□□□ 1.94
CCNDBP1-208ENST00000566515 FANCIQ9NVI1 1328 aa27.17■■□□□ 1.94
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARXQ96QS3 562 aa27.16■■□□□ 1.94
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZPR1O75312 459 aa27.16■■□□□ 1.94
CCNDBP1-208ENST00000566515 GYS1P13807 737 aa27.16■■□□□ 1.94
CCNDBP1-208ENST00000566515 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
CCNDBP1-208ENST00000566515 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa27.16■■□□□ 1.94
CCNDBP1-208ENST00000566515 A0A087WZG4 1122 aa27.15■■□□□ 1.94
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYL6BP14649 208 aa27.15■■□□□ 1.94
CCNDBP1-208ENST00000566515 USPL1Q5W0Q7 1092 aa27.15■■□□□ 1.94
CCNDBP1-208ENST00000566515 NARFQ9UHQ1 456 aa27.15■■□□□ 1.94
CCNDBP1-208ENST00000566515 HOXB7P09629 217 aa27.14■■□□□ 1.94
CCNDBP1-208ENST00000566515 TSPYL6Q8N831 410 aa27.14■■□□□ 1.94
CCNDBP1-208ENST00000566515 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa27.13■■□□□ 1.93
CCNDBP1-208ENST00000566515 POLD1P28340 1107 aa27.12■■□□□ 1.93
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANXA1P04083 346 aa27.12■■□□□ 1.93
CCNDBP1-208ENST00000566515 GOLGA2Q08379 1002 aa27.12■■□□□ 1.93
CCNDBP1-208ENST00000566515 FKBP8Q14318 412 aa27.12■■□□□ 1.93
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDIA6Q15084 440 aa27.12■■□□□ 1.93
CCNDBP1-208ENST00000566515 PROSER3Q2NL68 480 aa27.12■■□□□ 1.93
CCNDBP1-208ENST00000566515 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYH16Q9H6N6 1097 aa27.12■■□□□ 1.93
CCNDBP1-208ENST00000566515 ERBB4Q15303 1308 aa27.11■■□□□ 1.93
CCNDBP1-208ENST00000566515 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.11■■□□□ 1.93
CCNDBP1-208ENST00000566515 NLGN1Q8N2Q7 840 aa27.11■■□□□ 1.93
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
CCNDBP1-208ENST00000566515 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.09■■□□□ 1.93
CCNDBP1-208ENST00000566515 CHPF2Q9P2E5 772 aa27.09■■□□□ 1.93
CCNDBP1-208ENST00000566515 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
CCNDBP1-208ENST00000566515 SCN7AQ01118 1682 aa27.08■■□□□ 1.93
CCNDBP1-208ENST00000566515 CAMTA2O94983 1202 aa27.08■■□□□ 1.93
CCNDBP1-208ENST00000566515 MMP10P09238 476 aa27.08■■□□□ 1.93
CCNDBP1-208ENST00000566515 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDCA7LQ96GN5 454 aa27.08■■□□□ 1.93
CCNDBP1-208ENST00000566515 BCORQ6W2J9 1755 aa27.07■■□□□ 1.92
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRP10Q7Z4F1 713 aa27.07■■□□□ 1.92
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP27.07■■□□□ 1.92
CCNDBP1-208ENST00000566515 TTLL7Q6ZT98 887 aa27.06■■□□□ 1.92
CCNDBP1-208ENST00000566515 E9PSI1 815 aa27.05■■□□□ 1.92
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLFN5Q08AF3 891 aa27.05■■□□□ 1.92
CCNDBP1-208ENST00000566515 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
CCNDBP1-208ENST00000566515 TM4SF1P30408 202 aa27.02■■□□□ 1.92
CCNDBP1-208ENST00000566515 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC30Q5VVM6 783 aa27.02■■□□□ 1.92
CCNDBP1-208ENST00000566515 BICDL1Q6ZP65 573 aa27.02■■□□□ 1.92
CCNDBP1-208ENST00000566515 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms