RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566243.5

EDC3-211, Transcript of enhancer of mRNA decapping 3, humanhuman

TSL 3

Gene EDC3, Length 711 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3-211ENST00000566243 STARD3NLO95772 234 aa25.15■■□□□ 1.62
EDC3-211ENST00000566243 GYS1P13807 737 aa25.14■■□□□ 1.62
EDC3-211ENST00000566243 KLHL34Q8N239 644 aa25.14■■□□□ 1.62
EDC3-211ENST00000566243 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
EDC3-211ENST00000566243 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.13■■□□□ 1.61
EDC3-211ENST00000566243 NEUROD2Q15784 382 aa25.13■■□□□ 1.61
EDC3-211ENST00000566243 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
EDC3-211ENST00000566243 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
EDC3-211ENST00000566243 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
EDC3-211ENST00000566243 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
EDC3-211ENST00000566243 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.11■■□□□ 1.61
EDC3-211ENST00000566243 MMP10P09238 476 aa25.1■■□□□ 1.61
EDC3-211ENST00000566243 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
EDC3-211ENST00000566243 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.1■■□□□ 1.61
EDC3-211ENST00000566243 NLGN1Q8N2Q7 840 aa25.1■■□□□ 1.61
EDC3-211ENST00000566243 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.1■■□□□ 1.61
EDC3-211ENST00000566243 USP16Q9Y5T5 823 aa25.1■■□□□ 1.61
EDC3-211ENST00000566243 COL15A1P39059 1388 aa25.09■■□□□ 1.61
EDC3-211ENST00000566243 A1BGP04217 495 aa25.09■■□□□ 1.61
EDC3-211ENST00000566243 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
EDC3-211ENST00000566243 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.08■■□□□ 1.61
EDC3-211ENST00000566243 FKBP8Q14318 412 aa25.07■■□□□ 1.6
EDC3-211ENST00000566243 MRS2Q9HD23 443 aa25.07■■□□□ 1.6
EDC3-211ENST00000566243 APAF1O14727 1248 aa25.06■■□□□ 1.6
EDC3-211ENST00000566243 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
EDC3-211ENST00000566243 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.06■■□□□ 1.6
EDC3-211ENST00000566243 C4AP0C0L4 1744 aa25.06■■□□□ 1.6
EDC3-211ENST00000566243 NARFQ9UHQ1 456 aa25.05■■□□□ 1.6
EDC3-211ENST00000566243 ZPR1O75312 459 aa25.04■■□□□ 1.6
EDC3-211ENST00000566243 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
EDC3-211ENST00000566243 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
EDC3-211ENST00000566243 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.04■■□□□ 1.6
EDC3-211ENST00000566243 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.04■■□□□ 1.6
EDC3-211ENST00000566243 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.03■■□□□ 1.6
EDC3-211ENST00000566243 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
EDC3-211ENST00000566243 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
EDC3-211ENST00000566243 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.01■■□□□ 1.59
EDC3-211ENST00000566243 DDR1Q08345 913 aa25.01■■□□□ 1.59
EDC3-211ENST00000566243 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.01■■□□□ 1.59
EDC3-211ENST00000566243 A0A087WZG4 1122 aa25■■□□□ 1.59
EDC3-211ENST00000566243 NBPF26B4DH59 902 aa25■■□□□ 1.59
EDC3-211ENST00000566243 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
EDC3-211ENST00000566243 NBPF15Q8N660 670 aa25■■□□□ 1.59
EDC3-211ENST00000566243 UTRNP46939 3433 aa24.99■■□□□ 1.59
EDC3-211ENST00000566243 TM4SF1P30408 202 aa24.99■■□□□ 1.59
EDC3-211ENST00000566243 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.99■■□□□ 1.59
EDC3-211ENST00000566243 CHL1O00533 1208 aa24.98■■□□□ 1.59
EDC3-211ENST00000566243 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.98■■□□□ 1.59
EDC3-211ENST00000566243 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.97■■□□□ 1.59
EDC3-211ENST00000566243 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.96■■□□□ 1.59
EDC3-211ENST00000566243 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
EDC3-211ENST00000566243 NFIXQ14938 502 aa24.96■■□□□ 1.59
EDC3-211ENST00000566243 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
EDC3-211ENST00000566243 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
EDC3-211ENST00000566243 CAMTA2O94983 1202 aa24.95■■□□□ 1.58
EDC3-211ENST00000566243 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.95■■□□□ 1.58
EDC3-211ENST00000566243 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
EDC3-211ENST00000566243 KRT24Q2M2I5 525 aa24.93■■□□□ 1.58
EDC3-211ENST00000566243 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
EDC3-211ENST00000566243 GPR162Q16538 588 aa24.92■■□□□ 1.58
EDC3-211ENST00000566243 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
EDC3-211ENST00000566243 CFAP44Q96MT7 982 aa24.92■■□□□ 1.58
EDC3-211ENST00000566243 ZNF853P0CG23 659 aa24.91■■□□□ 1.58
EDC3-211ENST00000566243 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.91■■□□□ 1.58
EDC3-211ENST00000566243 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.91■■□□□ 1.58
EDC3-211ENST00000566243 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
EDC3-211ENST00000566243 MBIPQ9NS73 344 aa24.89■■□□□ 1.58
EDC3-211ENST00000566243 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.89■■□□□ 1.58
EDC3-211ENST00000566243 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.89■■□□□ 1.57
EDC3-211ENST00000566243 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.88■■□□□ 1.57
EDC3-211ENST00000566243 SERPINB2P05120 415 aa24.88■■□□□ 1.57
EDC3-211ENST00000566243 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
EDC3-211ENST00000566243 IFT57Q9NWB7 429 aa24.88■■□□□ 1.57
EDC3-211ENST00000566243 MYL6BP14649 208 aa24.87■■□□□ 1.57
EDC3-211ENST00000566243 TGFB2P61812 414 aa24.87■■□□□ 1.57
EDC3-211ENST00000566243 PDIA6Q15084 440 aa24.87■■□□□ 1.57
EDC3-211ENST00000566243 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.87■■□□□ 1.57
EDC3-211ENST00000566243 NGEFQ8N5V2 710 aa24.87■■□□□ 1.57
EDC3-211ENST00000566243 SCN7AQ01118 1682 aa24.87■■□□□ 1.57
EDC3-211ENST00000566243 A0A0G2JLW4 131 aa24.86■■□□□ 1.57
EDC3-211ENST00000566243 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
EDC3-211ENST00000566243 CCDC27Q2M243 656 aa24.86■■□□□ 1.57
EDC3-211ENST00000566243 ERBB4Q15303 1308 aa24.86■■□□□ 1.57
EDC3-211ENST00000566243 DPEP1P16444 411 aa24.85■■□□□ 1.57
EDC3-211ENST00000566243 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.85■■□□□ 1.57
EDC3-211ENST00000566243 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.85■■□□□ 1.57
EDC3-211ENST00000566243 WWC1Q8IX03 1113 aa24.85■■□□□ 1.57
EDC3-211ENST00000566243 GNAI1P63096 354 aa24.84■■□□□ 1.57
EDC3-211ENST00000566243 PROSER3Q2NL68 480 aa24.84■■□□□ 1.57
EDC3-211ENST00000566243 NECTIN2Q92692 538 aa24.84■■□□□ 1.57
EDC3-211ENST00000566243 ANXA1P04083 346 aa24.83■■□□□ 1.57
EDC3-211ENST00000566243 HLFQ16534 295 aa24.83■■□□□ 1.57
EDC3-211ENST00000566243 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.83■■□□□ 1.57
EDC3-211ENST00000566243 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.82■■□□□ 1.56
EDC3-211ENST00000566243 KCNA3P22001 575 aa24.82■■□□□ 1.56
EDC3-211ENST00000566243 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
EDC3-211ENST00000566243 SETDB2Q96T68 719 aa24.82■■□□□ 1.56
EDC3-211ENST00000566243 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.82■■□□□ 1.56
EDC3-211ENST00000566243 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.81■■□□□ 1.56
EDC3-211ENST00000566243 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.81■■□□□ 1.56
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