RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558550.1

EFTUD1P1-202, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD1P1, Length 418 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SLC15A2Q16348 729 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KRT24Q2M2I5 525 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CCDC87Q9NVE4 849 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 USP16Q9Y5T5 823 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 UBR3Q6ZT12 1888 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FANCIQ9NVI1 1328 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CANXP27824 592 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZNF827Q17R98 1081 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DUSP27Q5VZP5 1158 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 AKT1S1Q96B36 256 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CDCA7LQ96GN5 454 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZBED9Q6R2W3 1325 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 QSER1Q2KHR3 1735 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RPS6KA4O75676 772 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PHF14O94880 888 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 A1BGP04217 495 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SLFN5Q08AF3 891 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 C8orf58Q8NAV2 365 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NECTIN2Q92692 538 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 HOXB7P09629 217 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SMIM5Q71RC9 77 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FLAD1Q8NFF5 587 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ARXQ96QS3 562 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CHMP4AQ9BY43 222 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa9.08□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CACNA1FO60840 1977 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MYL6BP14649 208 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SSFA2P28290 1259 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RFC4P35249 363 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TRAPPC3LQ5T215 181 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TSPYL6Q8N831 410 aa9.07□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 A0A087WZG4 1122 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NBPF26B4DH59 902 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CCDC30Q5VVM6 783 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NBPF15Q8N660 670 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 STK31Q9BXU1 1019 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ERBB4Q15303 1308 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 C4AP0C0L4 1744 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 COL15A1P39059 1388 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZPR1O75312 459 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 VAMP4O75379 141 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ANXA1P04083 346 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 EIF5P55010 431 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 AMIGO3Q86WK7 504 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CHPF2Q9P2E5 772 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PDIA6Q15084 440 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PROSER3Q2NL68 480 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SLC16A10Q8TF71 515 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 HYPKQ9NX55 129 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CASZ1Q86V15 1759 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZBTB7AO95365 584 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SLC4A2P04920 1241 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KIF6Q6ZMV9 814 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NARFQ9UHQ1 456 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NUP98P52948 1817 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
EFTUD1P1-202ENST00000558550 USPL1Q5W0Q7 1092 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MSL1Q68DK7 614 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TTLL7Q6ZT98 887 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD1P1-202ENST00000558550 COPS6Q7L5N1 327 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD1P1-202ENST00000558550 XAGE3Q8WTP9 111 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MTFR1LQ9H019 292 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
EFTUD1P1-202ENST00000558550 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GYS1P13807 737 aa9.01□□□□□ -0.97
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NLGN1Q8N2Q7 840 aa9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70 ms