RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 TSPYL4Q9UJ04 414 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 COL15A1P39059 1388 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 PTGER2P43116 358 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 MIER1Q8N108 512 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 SPON1Q9HCB6 807 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 CCDC87Q9NVE4 849 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 RPS6KA4O75676 772 aa11.29□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 SGIP1Q9BQI5 828 aa11.29□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 USP16Q9Y5T5 823 aa11.29□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 NRXN2Q9P2S2 1712 aa11.29□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 CCER2I3L3R5 266 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 A1BGP04217 495 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 CANXP27824 592 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 KRT24Q2M2I5 525 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 FLAD1Q8NFF5 587 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 CACNA1SQ13698 1873 aa11.27□□□□□ -0.6
CS-211ENST00000548041 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 STARD3NLO95772 234 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 TRAPPC3LQ5T215 181 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 SLC16A10Q8TF71 515 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 CHL1O00533 1208 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 ADRA2BP18089 450 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 WWC1Q8IX03 1113 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 MBIPQ9NS73 344 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 CACNA1FO60840 1977 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 ZNF853P0CG23 659 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 GYS1P13807 737 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 RFC4P35249 363 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 CCDC27Q2M243 656 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 CFAP44Q96MT7 982 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 IFT57Q9NWB7 429 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 BABAM1Q9NWV8 329 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 DLEC1Q9Y238 1755 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 UTRNP46939 3433 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 NBPF26B4DH59 902 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 EIF5P55010 431 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 USPL1Q5W0Q7 1092 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 NBPF15Q8N660 670 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 NECTIN2Q92692 538 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 POLD1P28340 1107 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 GNAI1P63096 354 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 FKBP8Q14318 412 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 ARXQ96QS3 562 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 KLHL34Q8N239 644 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 BCL2L12Q9HB09 334 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 LAMB2P55268 1798 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 ZNF521Q96K83 1311 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 FANCIQ9NVI1 1328 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 ZPR1O75312 459 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 ANXA1P04083 346 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 MMP10P09238 476 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 MYL6BP14649 208 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 PROSER3Q2NL68 480 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-211ENST00000548041 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
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CS-211ENST00000548041 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-211ENST00000548041 IL16Q14005 1332 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-211ENST00000548041 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-211ENST00000548041 CAMTA2O94983 1202 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-211ENST00000548041 DDR1Q08345 913 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-211ENST00000548041 DUSP27Q5VZP5 1158 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-211ENST00000548041 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-211ENST00000548041 NGEFQ8N5V2 710 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-211ENST00000548041 TSPYL6Q8N831 410 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-211ENST00000548041 C8orf58Q8NAV2 365 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-211ENST00000548041 C10orf71Q711Q0 1435 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-211ENST00000548041 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-211ENST00000548041 A0A087WZG4 1122 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-211ENST00000548041 PDIA6Q15084 440 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-211ENST00000548041 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa11.19□□□□□ -0.62
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