RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543125.5

PGA3-207, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PGA3, Length 968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-207ENST00000543125 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 VSIG10Q8N0Z9 540 aa11.91□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 FMNL2Q96PY5 1086 aa11.91□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 MIS18AQ9NYP9 233 aa11.91□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PGA3-207ENST00000543125 HEG1Q9ULI3 1381 aa11.91□□□□□ -0.5
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PGA3-207ENST00000543125 EIF5P55010 431 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PGA3-207ENST00000543125 WWC1Q8IX03 1113 aa11.81□□□□□ -0.52
PGA3-207ENST00000543125 NLGN1Q8N2Q7 840 aa11.81□□□□□ -0.52
PGA3-207ENST00000543125 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
PGA3-207ENST00000543125 USPL1Q5W0Q7 1092 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-207ENST00000543125 KLHL34Q8N239 644 aa11.8□□□□□ -0.52
PGA3-207ENST00000543125 MBIPQ9NS73 344 aa11.8□□□□□ -0.52
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PGA3-207ENST00000543125 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PGA3-207ENST00000543125 KRT24Q2M2I5 525 aa11.79□□□□□ -0.52
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PGA3-207ENST00000543125 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
PGA3-207ENST00000543125 IL16Q14005 1332 aa11.78□□□□□ -0.52
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PGA3-207ENST00000543125 PARP3Q9Y6F1 533 aa11.77□□□□□ -0.53
PGA3-207ENST00000543125 ERBB4Q15303 1308 aa11.77□□□□□ -0.53
PGA3-207ENST00000543125 SCN7AQ01118 1682 aa11.77□□□□□ -0.53
PGA3-207ENST00000543125 HOXB7P09629 217 aa11.76□□□□□ -0.53
PGA3-207ENST00000543125 DUSP27Q5VZP5 1158 aa11.76□□□□□ -0.53
PGA3-207ENST00000543125 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PGA3-207ENST00000543125 BCL2L12Q9HB09 334 aa11.76□□□□□ -0.53
PGA3-207ENST00000543125 BCORQ6W2J9 1755 aa11.76□□□□□ -0.53
PGA3-207ENST00000543125 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
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