RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526317.5

CSRP1-208, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, human

TSL 3

Gene CSRP1, Length 374 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSRP1-208	ENST00000526317	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSRP1-208	ENST00000526317	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSRP1-208	ENST00000526317	CCER2	I3L3R5	266 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSRP1-208	ENST00000526317	CHL1	O00533	1208 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSRP1-208	ENST00000526317	A1BG	P04217	495 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSRP1-208	ENST00000526317	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSRP1-208	ENST00000526317	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSRP1-208	ENST00000526317	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CSRP1-208	ENST00000526317	ADRA2B	P18089	450 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CSRP1-208	ENST00000526317	MIER1	Q8N108	512 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CSRP1-208	ENST00000526317	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CSRP1-208	ENST00000526317	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CSRP1-208	ENST00000526317	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CSRP1-208	ENST00000526317	RFC4	P35249	363 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CSRP1-208	ENST00000526317	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CSRP1-208	ENST00000526317	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CSRP1-208	ENST00000526317	CCDC27	Q2M243	656 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	MSL1	Q68DK7	614 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	CFAP44	Q96MT7	982 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	LRP5	O75197	1615 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	ZNF853	P0CG23	659 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	WWC1	Q8IX03	1113 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	ARX	Q96QS3	562 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	NBPF26	B4DH59	902 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	GYS1	P13807	737 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	POLD1	P28340	1107 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	GNAI1	P63096	354 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	NBPF15	Q8N660	670 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	IFT57	Q9NWB7	429 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	KRT24	Q2M2I5	525 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	MBIP	Q9NS73	344 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	NARF	Q9UHQ1	456 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317		A0A087WZG4	1122 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	ZPR1	O75312	459 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	FKBP8	Q14318	412 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CSRP1-208	ENST00000526317	COL15A1	P39059	1388 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	TM4SF1	P30408	202 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	WDR63	Q8IWG1	891 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	NGEF	Q8N5V2	710 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	MMP10	P09238	476 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	SYT17	Q9BSW7	474 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	IL16	Q14005	1332 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	PDIA6	Q15084	440 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	NECTIN2	Q92692	538 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	C4A	P0C0L4	1744 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	CAMTA2	O94983	1202 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	MYL6B	P14649	208 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	HOXB7	P09629	217 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	ERBB4	Q15303	1308 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	NFIX	Q14938	502 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	KLHL34	Q8N239	644 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	TSPYL6	Q8N831	410 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		13.58	□□□□□ -0.23
CSRP1-208	ENST00000526317	ANXA1	P04083	346 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CSRP1-208	ENST00000526317	DDR1	Q08345	913 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CSRP1-208	ENST00000526317	PROSER3	Q2NL68	480 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CSRP1-208	ENST00000526317	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CSRP1-208	ENST00000526317	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CSRP1-208	ENST00000526317	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CSRP1-208	ENST00000526317	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
CSRP1-208	ENST00000526317	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CSRP1-208	ENST00000526317	ZNF521	Q96K83	1311 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CSRP1-208	ENST00000526317	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CSRP1-208	ENST00000526317	HLF	Q16534	295 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CSRP1-208	ENST00000526317	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CSRP1-208	ENST00000526317	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSRP1-208	ENST00000526317	SERPINB2	P05120	415 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSRP1-208	ENST00000526317	GOLGA2	Q08379	1002 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSRP1-208	ENST00000526317	COPS6	Q7L5N1	327 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CSRP1-208	ENST00000526317	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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