RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522635.5

TCEA1-211, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TCEA1, Length 1,432 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-211ENST00000522635 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
TCEA1-211ENST00000522635 CHPF2Q9P2E5 772 aa30.08■■■□□ 2.41
TCEA1-211ENST00000522635 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
TCEA1-211ENST00000522635 PLSCR1O15162 318 aa30.07■■■□□ 2.4
TCEA1-211ENST00000522635 STARD3NLO95772 234 aa30.07■■■□□ 2.4
TCEA1-211ENST00000522635 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
TCEA1-211ENST00000522635 CACNA1FO60840 1977 aa30.07■■■□□ 2.4
TCEA1-211ENST00000522635 TAF1LQ8IZX4 1826 aa30.07■■■□□ 2.4
TCEA1-211ENST00000522635 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
TCEA1-211ENST00000522635 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
TCEA1-211ENST00000522635 PDIA6Q15084 440 aa30.05■■■□□ 2.4
TCEA1-211ENST00000522635 KIF16BQ96L93 1317 aa30.04■■■□□ 2.4
TCEA1-211ENST00000522635 SLC4A2P04920 1241 aa30.04■■■□□ 2.4
TCEA1-211ENST00000522635 PROSER3Q2NL68 480 aa30.04■■■□□ 2.4
TCEA1-211ENST00000522635 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP30.04■■■□□ 2.4
TCEA1-211ENST00000522635 RNF123Q5XPI4 1314 aa30.03■■■□□ 2.4
TCEA1-211ENST00000522635 KCNQ4P56696 695 aa30.03■■■□□ 2.4
TCEA1-211ENST00000522635 SLC27A3Q5K4L6 730 aa30.03■■■□□ 2.4
TCEA1-211ENST00000522635 LINC00116Q8NCU8 138 aa30.03■■■□□ 2.4
TCEA1-211ENST00000522635 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
TCEA1-211ENST00000522635 NBPF26B4DH59 902 aa30.01■■■□□ 2.39
TCEA1-211ENST00000522635 ANXA1P04083 346 aa30.01■■■□□ 2.39
TCEA1-211ENST00000522635 A1BGP04217 495 aa30.01■■■□□ 2.39
TCEA1-211ENST00000522635 TXNRD1Q16881 649 aa30.01■■■□□ 2.39
TCEA1-211ENST00000522635 NBPF14Q5TI25 921 aa30.01■■■□□ 2.39
TCEA1-211ENST00000522635 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
TCEA1-211ENST00000522635 NBPF15Q8N660 670 aa30.01■■■□□ 2.39
TCEA1-211ENST00000522635 LRRC4BQ9NT99 713 aa30.01■■■□□ 2.39
TCEA1-211ENST00000522635 RRP1P56182 461 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
TCEA1-211ENST00000522635 LRP10Q7Z4F1 713 aa30■■■□□ 2.39
TCEA1-211ENST00000522635 C4BP0C0L5 1744 aa30■■■□□ 2.39
TCEA1-211ENST00000522635 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa30■■■□□ 2.39
TCEA1-211ENST00000522635 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
TCEA1-211ENST00000522635 CRKLP46109 303 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
TCEA1-211ENST00000522635 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
TCEA1-211ENST00000522635 PROM2Q8N271 834 aa29.99■■■□□ 2.39
TCEA1-211ENST00000522635 CCDC87Q9NVE4 849 aa29.99■■■□□ 2.39
TCEA1-211ENST00000522635 HYPKQ9NX55 129 aa29.99■■■□□ 2.39
TCEA1-211ENST00000522635 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
TCEA1-211ENST00000522635 G2E3Q7L622 706 aa29.98■■■□□ 2.39
TCEA1-211ENST00000522635 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa29.98■■■□□ 2.39
TCEA1-211ENST00000522635 MYL6BP14649 208 aa29.97■■■□□ 2.39
TCEA1-211ENST00000522635 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
TCEA1-211ENST00000522635 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
TCEA1-211ENST00000522635 FLIIQ13045 1269 aa29.96■■■□□ 2.39
TCEA1-211ENST00000522635 CCDC125Q86Z20 511 aa29.96■■■□□ 2.39
TCEA1-211ENST00000522635 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
TCEA1-211ENST00000522635 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
TCEA1-211ENST00000522635 BAG6P46379 1132 aa29.95■■■□□ 2.38
TCEA1-211ENST00000522635 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
TCEA1-211ENST00000522635 CAMKK2Q96RR4 588 aa29.95■■■□□ 2.38
TCEA1-211ENST00000522635 PTPRCP08575 1304 aa29.94■■■□□ 2.38
TCEA1-211ENST00000522635 CANXP27824 592 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
TCEA1-211ENST00000522635 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
TCEA1-211ENST00000522635 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa29.94■■■□□ 2.38
TCEA1-211ENST00000522635 ILDR2Q71H61 639 aa29.94■■■□□ 2.38
TCEA1-211ENST00000522635 PLIN1O60240 522 aa29.93■■■□□ 2.38
TCEA1-211ENST00000522635 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
TCEA1-211ENST00000522635 ARHGAP45Q92619 1136 aa29.93■■■□□ 2.38
TCEA1-211ENST00000522635 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
TCEA1-211ENST00000522635 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
TCEA1-211ENST00000522635 TRIM27P14373 513 aa29.9■■■□□ 2.38
TCEA1-211ENST00000522635 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
TCEA1-211ENST00000522635 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
TCEA1-211ENST00000522635 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa29.9■■■□□ 2.38
TCEA1-211ENST00000522635 XAGE3Q8WTP9 111 aa29.9■■■□□ 2.38
TCEA1-211ENST00000522635 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
TCEA1-211ENST00000522635 DEFB132Q7Z7B7 95 aa29.89■■■□□ 2.38
TCEA1-211ENST00000522635 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
TCEA1-211ENST00000522635 NUP188Q5SRE5 1749 aa29.89■■■□□ 2.38
TCEA1-211ENST00000522635 EIF5P55010 431 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
TCEA1-211ENST00000522635 COPS6Q7L5N1 327 aa29.88■■■□□ 2.37
TCEA1-211ENST00000522635 TNNQ9UQP3 1299 aa29.88■■■□□ 2.37
TCEA1-211ENST00000522635 COL15A1P39059 1388 aa29.87■■■□□ 2.37
TCEA1-211ENST00000522635 UBR3Q6ZT12 1888 aa29.87■■■□□ 2.37
TCEA1-211ENST00000522635 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
TCEA1-211ENST00000522635 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP29.87■■■□□ 2.37
TCEA1-211ENST00000522635 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
TCEA1-211ENST00000522635 ADCY9O60503 1353 aa29.86■■■□□ 2.37
TCEA1-211ENST00000522635 GNPATO15228 680 aa29.86■■■□□ 2.37
TCEA1-211ENST00000522635 AK7Q96M32 723 aa29.86■■■□□ 2.37
TCEA1-211ENST00000522635 ABCC4O15439 1325 aa29.85■■■□□ 2.37
TCEA1-211ENST00000522635 RPS6KA4O75676 772 aa29.85■■■□□ 2.37
TCEA1-211ENST00000522635 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
TCEA1-211ENST00000522635 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa29.84■■■□□ 2.37
TCEA1-211ENST00000522635 DDX58O95786 925 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
TCEA1-211ENST00000522635 TTLL7Q6ZT98 887 aa29.84■■■□□ 2.37
TCEA1-211ENST00000522635 PXDNLA1KZ92 1463 aa29.84■■■□□ 2.37
TCEA1-211ENST00000522635 PDE3AQ14432 1141 aa29.83■■■□□ 2.37
TCEA1-211ENST00000522635 C20orf194Q5TEA3 1177 aa29.83■■■□□ 2.37
TCEA1-211ENST00000522635 PI4KAP2A4QPH2 592 aa29.82■■■□□ 2.36
TCEA1-211ENST00000522635 MS4A1P11836 297 aa29.82■■■□□ 2.36
TCEA1-211ENST00000522635 KSR2Q6VAB6 950 aa29.82■■■□□ 2.36
TCEA1-211ENST00000522635 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
TCEA1-211ENST00000522635 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa29.82■■■□□ 2.36
TCEA1-211ENST00000522635 CLUAP1Q96AJ1 413 aa29.82■■■□□ 2.36
TCEA1-211ENST00000522635 F6X3S4 739 aa29.81■■■□□ 2.36
TCEA1-211ENST00000522635 C4AP0C0L4 1744 aa29.81■■■□□ 2.36
TCEA1-211ENST00000522635 RLBP1P12271 317 aa29.81■■■□□ 2.36
TCEA1-211ENST00000522635 ZNF827Q17R98 1081 aa29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms