RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516115.1

RNA5SP408-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 408, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP408, Length 100 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP408-201ENST00000516115 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
RNA5SP408-201ENST00000516115 HOXB7P09629 217 aa14.85□□□□□ -0.03
RNA5SP408-201ENST00000516115 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
RNA5SP408-201ENST00000516115 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.85□□□□□ -0.03
RNA5SP408-201ENST00000516115 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RNA5SP408-201ENST00000516115 GNPATO15228 680 aa14.84□□□□□ -0.03
RNA5SP408-201ENST00000516115 TRAPPC3LQ5T215 181 aa14.84□□□□□ -0.03
RNA5SP408-201ENST00000516115 MTFR1LQ9H019 292 aa14.84□□□□□ -0.03
RNA5SP408-201ENST00000516115 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
RNA5SP408-201ENST00000516115 COL24A1Q17RW2 1714 aa14.83□□□□□ -0.03
RNA5SP408-201ENST00000516115 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
RNA5SP408-201ENST00000516115 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
RNA5SP408-201ENST00000516115 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.83□□□□□ -0.04
RNA5SP408-201ENST00000516115 ERBB4Q15303 1308 aa14.83□□□□□ -0.04
RNA5SP408-201ENST00000516115 LRP5O75197 1615 aa14.82□□□□□ -0.04
RNA5SP408-201ENST00000516115 SPON1Q9HCB6 807 aa14.82□□□□□ -0.04
RNA5SP408-201ENST00000516115 USP16Q9Y5T5 823 aa14.82□□□□□ -0.04
RNA5SP408-201ENST00000516115 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.81□□□□□ -0.04
RNA5SP408-201ENST00000516115 A0A087WZG4 1122 aa14.81□□□□□ -0.04
RNA5SP408-201ENST00000516115 RGL2O15211 777 aa14.81□□□□□ -0.04
RNA5SP408-201ENST00000516115 EIF5P55010 431 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
RNA5SP408-201ENST00000516115 MBIPQ9NS73 344 aa14.81□□□□□ -0.04
RNA5SP408-201ENST00000516115 ZNF521Q96K83 1311 aa14.81□□□□□ -0.04
RNA5SP408-201ENST00000516115 AMIGO3Q86WK7 504 aa14.8□□□□□ -0.04
RNA5SP408-201ENST00000516115 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
RNA5SP408-201ENST00000516115 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
RNA5SP408-201ENST00000516115 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa14.8□□□□□ -0.04
RNA5SP408-201ENST00000516115 RFC4P35249 363 aa14.79□□□□□ -0.04
RNA5SP408-201ENST00000516115 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.79□□□□□ -0.04
RNA5SP408-201ENST00000516115 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
RNA5SP408-201ENST00000516115 COL15A1P39059 1388 aa14.78□□□□□ -0.04
RNA5SP408-201ENST00000516115 NLGN1Q8N2Q7 840 aa14.78□□□□□ -0.04
RNA5SP408-201ENST00000516115 NARFQ9UHQ1 456 aa14.78□□□□□ -0.04
RNA5SP408-201ENST00000516115 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
RNA5SP408-201ENST00000516115 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.77□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 A1BGP04217 495 aa14.77□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 PTGER2P43116 358 aa14.77□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 C4AP0C0L4 1744 aa14.76□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 MSH5O43196 834 aa14.76□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 PHF14O94880 888 aa14.76□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 ZBTB7AO95365 584 aa14.76□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 CANXP27824 592 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.76□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 NBPF26B4DH59 902 aa14.75□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 ZPR1O75312 459 aa14.75□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 GYS1P13807 737 aa14.75□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 POLD1P28340 1107 aa14.75□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 DUSP27Q5VZP5 1158 aa14.75□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 NBPF15Q8N660 670 aa14.75□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 GOLGA2Q08379 1002 aa14.74□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.74□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 E9PSI1 815 aa14.73□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 PDIA6Q15084 440 aa14.73□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.72□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.72□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa14.72□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.72□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 TM4SF1P30408 202 aa14.71□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 KRT24Q2M2I5 525 aa14.71□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 USPL1Q5W0Q7 1092 aa14.71□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 SMIM5Q71RC9 77 aa14.71□□□□□ -0.05
RNA5SP408-201ENST00000516115 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.71□□□□□ -0.05
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RNA5SP408-201ENST00000516115 ARXQ96QS3 562 aa14.71□□□□□ -0.05
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RNA5SP408-201ENST00000516115 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RNA5SP408-201ENST00000516115 CCDC30Q5VVM6 783 aa14.7□□□□□ -0.06
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RNA5SP408-201ENST00000516115 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RNA5SP408-201ENST00000516115 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.7□□□□□ -0.06
RNA5SP408-201ENST00000516115 HYPKQ9NX55 129 aa14.7□□□□□ -0.06
RNA5SP408-201ENST00000516115 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.7□□□□□ -0.06
RNA5SP408-201ENST00000516115 CACNA1FO60840 1977 aa14.69□□□□□ -0.06
RNA5SP408-201ENST00000516115 SCN7AQ01118 1682 aa14.69□□□□□ -0.06
RNA5SP408-201ENST00000516115 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.69□□□□□ -0.06
RNA5SP408-201ENST00000516115 FKBP8Q14318 412 aa14.69□□□□□ -0.06
RNA5SP408-201ENST00000516115 ZNF428Q96B54 188 aa14.69□□□□□ -0.06
RNA5SP408-201ENST00000516115 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RNA5SP408-201ENST00000516115 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.69□□□□□ -0.06
RNA5SP408-201ENST00000516115 BCORQ6W2J9 1755 aa14.69□□□□□ -0.06
RNA5SP408-201ENST00000516115 VAMP4O75379 141 aa14.68□□□□□ -0.06
RNA5SP408-201ENST00000516115 KIF6Q6ZMV9 814 aa14.68□□□□□ -0.06
RNA5SP408-201ENST00000516115 TSPYL6Q8N831 410 aa14.68□□□□□ -0.06
RNA5SP408-201ENST00000516115 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa14.67□□□□□ -0.06
RNA5SP408-201ENST00000516115 MMP10P09238 476 aa14.67□□□□□ -0.06
RNA5SP408-201ENST00000516115 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RNA5SP408-201ENST00000516115 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RNA5SP408-201ENST00000516115 MSL1Q68DK7 614 aa14.67□□□□□ -0.06
RNA5SP408-201ENST00000516115 CHPF2Q9P2E5 772 aa14.67□□□□□ -0.06
RNA5SP408-201ENST00000516115 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RNA5SP408-201ENST00000516115 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
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