RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511362.5

ATXN3-211, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 3

Gene ATXN3, Length 591 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 FAM117AQ9C073 453 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 LAMC2Q13753 1193 aa6.56□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 ADGRE1Q14246 886 aa6.56□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 RNF112Q9ULX5 631 aa6.56□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.56□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 C9orf172C9J069 976 aa6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 GNRH1P01148 92 aa6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 TNP2Q05952 138 aa6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 MBTPS1Q14703 1052 aa6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 RSPH6AQ9H0K4 717 aa6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 DCDC2BA2VCK2 349 aa6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 RNF20Q5VTR2 975 aa6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 TXNRD3Q86VQ6 643 aa6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 ELOA3Q8NG57 546 aa6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 TP53INP1Q96A56 240 aa6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 ALAS2P22557 587 aa6.53□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 IRAK1P51617 712 aa6.53□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 NLRP8Q86W28 1048 aa6.53□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 XAGE2Q96GT9 111 aa6.53□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.53□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.53□□□□□ -1.36
ATXN3-211ENST00000511362 M0R082 166 aa6.52□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.52□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 RNF114Q9Y508 228 aa6.52□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 SELPP16109 830 aa6.51□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.51□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.51□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 MDFIQ99750 246 aa6.51□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.51□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 AP1G2O75843 785 aa6.5□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 DDRGK1Q96HY6 314 aa6.5□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 ATP4AP20648 1035 aa6.49□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 PLA2G4AP47712 749 aa6.49□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 SH3D19Q5HYK7 790 aa6.49□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.49□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 NID1P14543 1247 aa6.48□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
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ATXN3-211ENST00000511362 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.48□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.48□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 ALBP02768 609 aa6.47□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 NEUROD2Q15784 382 aa6.47□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 SYT9Q86SS6 491 aa6.47□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.47□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 IL27Q8NEV9 243 aa6.47□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.47□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 STRN4Q9NRL3 753 aa6.47□□□□□ -1.37
ATXN3-211ENST00000511362 A0A1W2PNR3 127 aa6.46□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 ZBBXA8MT70 800 aa6.46□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.46□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 TRAPPC3LQ5T215 181 aa6.46□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.45□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 FAM157BP0CG42 384 aa6.45□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 SSTR4P31391 388 aa6.45□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.45□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 MARK1Q9P0L2 795 aa6.45□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 FBXO45P0C2W1 286 aa6.44□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 ESCO1Q5FWF5 840 aa6.44□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 AIDAQ96BJ3 306 aa6.44□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 A0A0A0MRY4 1105 aa6.43□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 SIN3BO75182 1162 aa6.43□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 USP17L8P0C7I0 530 aa6.43□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 JAG1P78504 1218 aa6.43□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 ABCC9O60706 1549 aa6.43□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 NISCHQ9Y2I1 1504 aa6.43□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 MYCP01106 439 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 TLR1Q15399 786 aa6.42□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.42□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 EFSO43281 561 aa6.41□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.41□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 USP21Q9UK80 565 aa6.41□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 RFC5P40937 340 aa6.4□□□□□ -1.38
ATXN3-211ENST00000511362 CD97P48960 835 aa6.4□□□□□ -1.38
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