RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 ADRA2BP18089 450 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-218ENST00000511185 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-218ENST00000511185 NEFMP07197 916 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-218ENST00000511185 GYS1P13807 737 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-218ENST00000511185 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-218ENST00000511185 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-218ENST00000511185 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-218ENST00000511185 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
SH3BP2-218ENST00000511185 MMP10P09238 476 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP2-218ENST00000511185 RFC4P35249 363 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP2-218ENST00000511185 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP2-218ENST00000511185 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-218ENST00000511185 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC184Q52MB2 194 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP2-218ENST00000511185 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SH3BP2-218ENST00000511185 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
SH3BP2-218ENST00000511185 FKBP8Q14318 412 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3BP2-218ENST00000511185 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
SH3BP2-218ENST00000511185 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3BP2-218ENST00000511185 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP2-218ENST00000511185 DLEC1Q9Y238 1755 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP2-218ENST00000511185 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP2-218ENST00000511185 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
SH3BP2-218ENST00000511185 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP2-218ENST00000511185 RIPK4P57078 832 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP2-218ENST00000511185 DDR1Q08345 913 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP2-218ENST00000511185 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SH3BP2-218ENST00000511185 STARD3NLO95772 234 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2-218ENST00000511185 A1BGP04217 495 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2-218ENST00000511185 NLGN1Q8N2Q7 840 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2-218ENST00000511185 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2-218ENST00000511185 USP16Q9Y5T5 823 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-218ENST00000511185 RUNDC1Q96C34 613 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-218ENST00000511185 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-218ENST00000511185 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-218ENST00000511185 NEUROD2Q15784 382 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP2-218ENST00000511185 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SH3BP2-218ENST00000511185 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP2-218ENST00000511185 NUP98P52948 1817 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP2-218ENST00000511185 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2-218ENST00000511185 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2-218ENST00000511185 NARFQ9UHQ1 456 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2-218ENST00000511185 CACNA1SQ13698 1873 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2-218ENST00000511185 ZPR1O75312 459 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP2-218ENST00000511185 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
SH3BP2-218ENST00000511185 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP2-218ENST00000511185 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP2-218ENST00000511185 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR162Q16538 588 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP2-218ENST00000511185 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP2-218ENST00000511185 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-218ENST00000511185 NBPF26B4DH59 902 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-218ENST00000511185 NFIXQ14938 502 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-218ENST00000511185 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-218ENST00000511185 NBPF15Q8N660 670 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-218ENST00000511185 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-218ENST00000511185 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-218ENST00000511185 TM4SF1P30408 202 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-218ENST00000511185 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-218ENST00000511185 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2-218ENST00000511185 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2-218ENST00000511185 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP2-218ENST00000511185 ANP32CO43423 234 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP2-218ENST00000511185 CAMTA2O94983 1202 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2-218ENST00000511185 YY1P25490 414 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A087WZG4 1122 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-218ENST00000511185 APAF1O14727 1248 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-218ENST00000511185 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-218ENST00000511185 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-218ENST00000511185 MRS2Q9HD23 443 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-218ENST00000511185 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-218ENST00000511185 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-218ENST00000511185 KRT24Q2M2I5 525 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A0G2JLW4 131 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-218ENST00000511185 DPEP1P16444 411 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-218ENST00000511185 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-218ENST00000511185 SERPINB2P05120 415 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2-218ENST00000511185 CHL1O00533 1208 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNA3P22001 575 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP2-218ENST00000511185 CHRNA5P30532 468 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP2-218ENST00000511185 TGFB2P61812 414 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP2-218ENST00000511185 SBF1O95248 1867 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP2-218ENST00000511185 MYL6BP14649 208 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP2-218ENST00000511185 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP2-218ENST00000511185 NGEFQ8N5V2 710 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP2-218ENST00000511185 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP2-218ENST00000511185 PROSER3Q2NL68 480 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP2-218ENST00000511185 ANXA1P04083 346 aa24.46■■□□□ 1.51
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