RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 STARD3NLO95772 234 aa15.87■□□□□ 0.13
NISCH-214ENST00000490425 GYS1P13807 737 aa15.87■□□□□ 0.13
NISCH-214ENST00000490425 CANXP27824 592 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
NISCH-214ENST00000490425 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
NISCH-214ENST00000490425 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
NISCH-214ENST00000490425 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa15.86■□□□□ 0.13
NISCH-214ENST00000490425 MMP10P09238 476 aa15.86■□□□□ 0.13
NISCH-214ENST00000490425 TMPOP42166 694 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
NISCH-214ENST00000490425 RIPK4P57078 832 aa15.86■□□□□ 0.13
NISCH-214ENST00000490425 DCAF8L1A6NGE4 600 aa15.85■□□□□ 0.13
NISCH-214ENST00000490425 NEUROD2Q15784 382 aa15.85■□□□□ 0.13
NISCH-214ENST00000490425 CCDC184Q52MB2 194 aa15.85■□□□□ 0.13
NISCH-214ENST00000490425 NLGN1Q8N2Q7 840 aa15.85■□□□□ 0.13
NISCH-214ENST00000490425 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
NISCH-214ENST00000490425 A1BGP04217 495 aa15.84■□□□□ 0.13
NISCH-214ENST00000490425 FKBP8Q14318 412 aa15.84■□□□□ 0.13
NISCH-214ENST00000490425 RUNDC1Q96C34 613 aa15.84■□□□□ 0.13
NISCH-214ENST00000490425 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
NISCH-214ENST00000490425 COL15A1P39059 1388 aa15.84■□□□□ 0.13
NISCH-214ENST00000490425 USPL1Q5W0Q7 1092 aa15.83■□□□□ 0.12
NISCH-214ENST00000490425 USP16Q9Y5T5 823 aa15.83■□□□□ 0.12
NISCH-214ENST00000490425 ZPR1O75312 459 aa15.82■□□□□ 0.12
NISCH-214ENST00000490425 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
NISCH-214ENST00000490425 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
NISCH-214ENST00000490425 EIF5P55010 431 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
NISCH-214ENST00000490425 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
NISCH-214ENST00000490425 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
NISCH-214ENST00000490425 CD2APQ9Y5K6 639 aa15.82■□□□□ 0.12
NISCH-214ENST00000490425 ANP32CO43423 234 aa15.81■□□□□ 0.12
NISCH-214ENST00000490425 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
NISCH-214ENST00000490425 NARFQ9UHQ1 456 aa15.81■□□□□ 0.12
NISCH-214ENST00000490425 PARP3Q9Y6F1 533 aa15.81■□□□□ 0.12
NISCH-214ENST00000490425 KDM3BQ7LBC6 1761 aa15.8■□□□□ 0.12
NISCH-214ENST00000490425 DDR1Q08345 913 aa15.8■□□□□ 0.12
NISCH-214ENST00000490425 GPR162Q16538 588 aa15.8■□□□□ 0.12
NISCH-214ENST00000490425 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
NISCH-214ENST00000490425 LMOD3Q0VAK6 560 aa15.79■□□□□ 0.12
NISCH-214ENST00000490425 BCL2L12Q9HB09 334 aa15.79■□□□□ 0.12
NISCH-214ENST00000490425 TSPYL4Q9UJ04 414 aa15.79■□□□□ 0.12
NISCH-214ENST00000490425 TRIM35Q9UPQ4 493 aa15.79■□□□□ 0.12
NISCH-214ENST00000490425 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa15.79■□□□□ 0.12
NISCH-214ENST00000490425 A0A087WZG4 1122 aa15.78■□□□□ 0.12
NISCH-214ENST00000490425 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
NISCH-214ENST00000490425 WWC3Q9ULE0 1092 aa15.78■□□□□ 0.12
NISCH-214ENST00000490425 APAF1O14727 1248 aa15.77■□□□□ 0.12
NISCH-214ENST00000490425 TM4SF1P30408 202 aa15.77■□□□□ 0.12
NISCH-214ENST00000490425 NBPF26B4DH59 902 aa15.76■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP15.76■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 NFIXQ14938 502 aa15.76■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 NBPF15Q8N660 670 aa15.76■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 MRS2Q9HD23 443 aa15.76■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 C10orf71Q711Q0 1435 aa15.76■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.75■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 BICDL1Q6ZP65 573 aa15.75■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 YY1P25490 414 aa15.74■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 KIF13BQ9NQT8 1826 aa15.73■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 PXDNLA1KZ92 1463 aa15.73■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 LAMB4A4D0S4 1761 aa15.73■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 A0A0G2JLW4 131 aa15.73■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 CAMTA2O94983 1202 aa15.73■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 TBC1D9BQ66K14 1250 aa15.73■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 SCN7AQ01118 1682 aa15.73■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 CHL1O00533 1208 aa15.72■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 DPEP1P16444 411 aa15.72■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 NGEFQ8N5V2 710 aa15.72■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 BABAM1Q9NWV8 329 aa15.72■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa15.71■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 SERPINB2P05120 415 aa15.71■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 TGFB2P61812 414 aa15.71■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 KRT24Q2M2I5 525 aa15.71■□□□□ 0.11
NISCH-214ENST00000490425 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.1
NISCH-214ENST00000490425 MYL6BP14649 208 aa15.7■□□□□ 0.1
NISCH-214ENST00000490425 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
NISCH-214ENST00000490425 GRIN3BO60391 1043 aa15.69■□□□□ 0.1
NISCH-214ENST00000490425 NECTIN2Q92692 538 aa15.69■□□□□ 0.1
NISCH-214ENST00000490425 BCORQ6W2J9 1755 aa15.69■□□□□ 0.1
NISCH-214ENST00000490425 KCNA3P22001 575 aa15.68■□□□□ 0.1
NISCH-214ENST00000490425 CHRNA5P30532 468 aa15.68■□□□□ 0.1
NISCH-214ENST00000490425 TTLL7Q6ZT98 887 aa15.68■□□□□ 0.1
NISCH-214ENST00000490425 CCDC24Q8N4L8 307 aa15.68■□□□□ 0.1
NISCH-214ENST00000490425 CFAP44Q96MT7 982 aa15.68■□□□□ 0.1
NISCH-214ENST00000490425 NRXN2Q9P2S2 1712 aa15.68■□□□□ 0.1
NISCH-214ENST00000490425 CHD4Q14839 1912 aa15.67■□□□□ 0.1
NISCH-214ENST00000490425 CARMIL3Q8ND23 1372 aa15.67■□□□□ 0.1
NISCH-214ENST00000490425 ANXA1P04083 346 aa15.67■□□□□ 0.1
NISCH-214ENST00000490425 HLFQ16534 295 aa15.67■□□□□ 0.1
NISCH-214ENST00000490425 SETDB2Q96T68 719 aa15.67■□□□□ 0.1
NISCH-214ENST00000490425 MBIPQ9NS73 344 aa15.67■□□□□ 0.1
NISCH-214ENST00000490425 BCS1LQ9Y276 419 aa15.67■□□□□ 0.1
NISCH-214ENST00000490425 ZNF853P0CG23 659 aa15.66■□□□□ 0.1
NISCH-214ENST00000490425 PROSER3Q2NL68 480 aa15.66■□□□□ 0.1
NISCH-214ENST00000490425 ZNF652Q9Y2D9 606 aa15.66■□□□□ 0.1
NISCH-214ENST00000490425 PDIA6Q15084 440 aa15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms