RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PBRM1Q86U86 1689 aa20.03■□□□□ 0.8
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CEP131Q9UPN4 1083 aa20.03■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIF5CO60282 957 aa20.02■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.02■□□□□ 0.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CKAP2LQ8IYA6 745 aa20.01■□□□□ 0.79
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PIBF1Q8WXW3 757 aa20■□□□□ 0.79
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa20■□□□□ 0.79
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CEP126Q9P2H0 1117 aa20■□□□□ 0.79
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20■□□□□ 0.79
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa20■□□□□ 0.79
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMX1Q9H3N1 280 aa19.99■□□□□ 0.79
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DISP1Q96F81 1524 aa19.99■□□□□ 0.79
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRERF1Q96PN7 1200 aa19.98■□□□□ 0.79
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MCM5P33992 734 aa19.98■□□□□ 0.79
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WWC2Q6AWC2 1192 aa19.97■□□□□ 0.79
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa19.97■□□□□ 0.79
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MCM3P25205 808 aa19.96■□□□□ 0.79
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GUCY1B3Q02153 619 aa19.96■□□□□ 0.79
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPDYE4A6NLX3 237 aa19.96■□□□□ 0.79
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NEMFO60524 1076 aa19.96■□□□□ 0.79
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IDH1O75874 414 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa19.96■□□□□ 0.79
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AIDAQ96BJ3 306 aa19.95■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAI14Q9P0K7 980 aa19.95■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP19.95■□□□□ 0.781e-7■■■■□ 25.2
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADAMTS2O95450 1211 aa19.95■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BOLA2Q9H3K6 86 aa19.95■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C8orf76Q96K31 380 aa19.94■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DYNC1I1O14576 645 aa19.94■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa19.93■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DYDC1Q8WWB3 177 aa19.93■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa19.93■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMC6Q7Z403 805 aa19.93■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC113Q9H0I3 377 aa19.93■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRP2BPQ9P2M1 347 aa19.93■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa19.93■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GSDMDP57764 484 aa19.93■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FKBP15Q5T1M5 1219 aa19.93■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRT28Q7Z3Y7 464 aa19.93■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 USHBP1Q8N6Y0 703 aa19.93■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GJB2P29033 226 aa19.92■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CPLX3Q8WVH0 158 aa19.92■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CEP170Q5SW79 1584 aa19.92■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FSIP1Q8NA03 581 aa19.92■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TBC1D32Q96NH3 1257 aa19.92■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PAF1Q8N7H5 531 aa19.91■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STX1AQ16623 288 aa19.91■□□□□ 0.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KLHL40Q2TBA0 621 aa19.91■□□□□ 0.78
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