RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475241.1

PKDCC-204, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 3

Gene PKDCC, Length 773 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-204ENST00000475241 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.17■■□□□ 1.14
PKDCC-204ENST00000475241 MRS2Q9HD23 443 aa22.16■■□□□ 1.14
PKDCC-204ENST00000475241 MSL1Q68DK7 614 aa22.15■■□□□ 1.14
PKDCC-204ENST00000475241 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PKDCC-204ENST00000475241 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PKDCC-204ENST00000475241 SYT17Q9BSW7 474 aa22.14■■□□□ 1.13
PKDCC-204ENST00000475241 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.14■■□□□ 1.13
PKDCC-204ENST00000475241 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.14■■□□□ 1.13
PKDCC-204ENST00000475241 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PKDCC-204ENST00000475241 NEUROD2Q15784 382 aa22.13■■□□□ 1.13
PKDCC-204ENST00000475241 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.13■■□□□ 1.13
PKDCC-204ENST00000475241 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-204ENST00000475241 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-204ENST00000475241 A0A087WZG4 1122 aa22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-204ENST00000475241 GYS1P13807 737 aa22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-204ENST00000475241 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-204ENST00000475241 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-204ENST00000475241 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-204ENST00000475241 APAF1O14727 1248 aa22.11■■□□□ 1.13
PKDCC-204ENST00000475241 NARFQ9UHQ1 456 aa22.11■■□□□ 1.13
PKDCC-204ENST00000475241 USP16Q9Y5T5 823 aa22.11■■□□□ 1.13
PKDCC-204ENST00000475241 C4AP0C0L4 1744 aa22.11■■□□□ 1.13
PKDCC-204ENST00000475241 COL15A1P39059 1388 aa22.11■■□□□ 1.13
PKDCC-204ENST00000475241 ZPR1O75312 459 aa22.1■■□□□ 1.13
PKDCC-204ENST00000475241 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PKDCC-204ENST00000475241 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PKDCC-204ENST00000475241 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.1■■□□□ 1.13
PKDCC-204ENST00000475241 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PKDCC-204ENST00000475241 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PKDCC-204ENST00000475241 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.09■■□□□ 1.13
PKDCC-204ENST00000475241 CHL1O00533 1208 aa22.08■■□□□ 1.13
PKDCC-204ENST00000475241 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PKDCC-204ENST00000475241 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.07■■□□□ 1.12
PKDCC-204ENST00000475241 A1BGP04217 495 aa22.07■■□□□ 1.12
PKDCC-204ENST00000475241 MMP10P09238 476 aa22.07■■□□□ 1.12
PKDCC-204ENST00000475241 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.06■■□□□ 1.12
PKDCC-204ENST00000475241 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PKDCC-204ENST00000475241 CCDC27Q2M243 656 aa22.05■■□□□ 1.12
PKDCC-204ENST00000475241 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.05■■□□□ 1.12
PKDCC-204ENST00000475241 CFAP44Q96MT7 982 aa22.05■■□□□ 1.12
PKDCC-204ENST00000475241 FKBP8Q14318 412 aa22.04■■□□□ 1.12
PKDCC-204ENST00000475241 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.04■■□□□ 1.12
PKDCC-204ENST00000475241 RGL2O15211 777 aa22.03■■□□□ 1.12
PKDCC-204ENST00000475241 TM4SF1P30408 202 aa22.03■■□□□ 1.12
PKDCC-204ENST00000475241 ERBB4Q15303 1308 aa22.03■■□□□ 1.12
PKDCC-204ENST00000475241 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.02■■□□□ 1.12
PKDCC-204ENST00000475241 KLHL34Q8N239 644 aa22.02■■□□□ 1.12
PKDCC-204ENST00000475241 ZNF853P0CG23 659 aa22.01■■□□□ 1.11
PKDCC-204ENST00000475241 IFT57Q9NWB7 429 aa22.01■■□□□ 1.11
PKDCC-204ENST00000475241 NBPF26B4DH59 902 aa22■■□□□ 1.11
PKDCC-204ENST00000475241 GNAI1P63096 354 aa22■■□□□ 1.11
PKDCC-204ENST00000475241 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PKDCC-204ENST00000475241 NGEFQ8N5V2 710 aa22■■□□□ 1.11
PKDCC-204ENST00000475241 NBPF15Q8N660 670 aa22■■□□□ 1.11
PKDCC-204ENST00000475241 BCL2L12Q9HB09 334 aa22■■□□□ 1.11
PKDCC-204ENST00000475241 HOXB7P09629 217 aa21.99■■□□□ 1.11
PKDCC-204ENST00000475241 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.99■■□□□ 1.11
PKDCC-204ENST00000475241 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PKDCC-204ENST00000475241 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PKDCC-204ENST00000475241 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.98■■□□□ 1.11
PKDCC-204ENST00000475241 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PKDCC-204ENST00000475241 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PKDCC-204ENST00000475241 CAMTA2O94983 1202 aa21.97■■□□□ 1.11
PKDCC-204ENST00000475241 TGFB2P61812 414 aa21.97■■□□□ 1.11
PKDCC-204ENST00000475241 DDR1Q08345 913 aa21.97■■□□□ 1.11
PKDCC-204ENST00000475241 NFIXQ14938 502 aa21.97■■□□□ 1.11
PKDCC-204ENST00000475241 NLGN2Q8NFZ4 835 aa21.97■■□□□ 1.11
PKDCC-204ENST00000475241 CCER2I3L3R5 266 aa21.96■■□□□ 1.11
PKDCC-204ENST00000475241 WWC1Q8IX03 1113 aa21.96■■□□□ 1.11
PKDCC-204ENST00000475241 MBIPQ9NS73 344 aa21.96■■□□□ 1.11
PKDCC-204ENST00000475241 KIF13BQ9NQT8 1826 aa21.96■■□□□ 1.11
PKDCC-204ENST00000475241 C10orf71Q711Q0 1435 aa21.96■■□□□ 1.11
PKDCC-204ENST00000475241 SCN7AQ01118 1682 aa21.95■■□□□ 1.1
PKDCC-204ENST00000475241 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PKDCC-204ENST00000475241 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.95■■□□□ 1.1
PKDCC-204ENST00000475241 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.95■■□□□ 1.1
PKDCC-204ENST00000475241 IL16Q14005 1332 aa21.95■■□□□ 1.1
PKDCC-204ENST00000475241 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.93■■□□□ 1.1
PKDCC-204ENST00000475241 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.93■■□□□ 1.1
PKDCC-204ENST00000475241 SERPINB2P05120 415 aa21.92■■□□□ 1.1
PKDCC-204ENST00000475241 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PKDCC-204ENST00000475241 WDR63Q8IWG1 891 aa21.92■■□□□ 1.1
PKDCC-204ENST00000475241 BCORQ6W2J9 1755 aa21.92■■□□□ 1.1
PKDCC-204ENST00000475241 PDIA6Q15084 440 aa21.91■■□□□ 1.1
PKDCC-204ENST00000475241 GPR162Q16538 588 aa21.91■■□□□ 1.1
PKDCC-204ENST00000475241 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.91■■□□□ 1.1
PKDCC-204ENST00000475241 SETDB2Q96T68 719 aa21.91■■□□□ 1.1
PKDCC-204ENST00000475241 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.91■■□□□ 1.1
PKDCC-204ENST00000475241 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.9■■□□□ 1.1
PKDCC-204ENST00000475241 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.9■■□□□ 1.1
PKDCC-204ENST00000475241 GRIN3BO60391 1043 aa21.89■■□□□ 1.09
PKDCC-204ENST00000475241 MYL6BP14649 208 aa21.89■■□□□ 1.09
PKDCC-204ENST00000475241 KRT24Q2M2I5 525 aa21.89■■□□□ 1.09
PKDCC-204ENST00000475241 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.89■■□□□ 1.09
PKDCC-204ENST00000475241 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.89■■□□□ 1.09
PKDCC-204ENST00000475241 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
PKDCC-204ENST00000475241 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.88■■□□□ 1.09
PKDCC-204ENST00000475241 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.88■■□□□ 1.09
PKDCC-204ENST00000475241 PXDNLA1KZ92 1463 aa21.88■■□□□ 1.09
PKDCC-204ENST00000475241 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.87■■□□□ 1.09
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