RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.84■■□□□ 1.57
SYF2-203ENST00000474160 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.83■■□□□ 1.57
SYF2-203ENST00000474160 A0A087WZG4 1122 aa24.82■■□□□ 1.56
SYF2-203ENST00000474160 CCDC184Q52MB2 194 aa24.82■■□□□ 1.56
SYF2-203ENST00000474160 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SYF2-203ENST00000474160 COL15A1P39059 1388 aa24.81■■□□□ 1.56
SYF2-203ENST00000474160 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SYF2-203ENST00000474160 MSL1Q68DK7 614 aa24.81■■□□□ 1.56
SYF2-203ENST00000474160 SMIM5Q71RC9 77 aa24.81■■□□□ 1.56
SYF2-203ENST00000474160 SYT17Q9BSW7 474 aa24.81■■□□□ 1.56
SYF2-203ENST00000474160 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SYF2-203ENST00000474160 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SYF2-203ENST00000474160 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.81■■□□□ 1.56
SYF2-203ENST00000474160 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SYF2-203ENST00000474160 C4AP0C0L4 1744 aa24.81■■□□□ 1.56
SYF2-203ENST00000474160 GYS1P13807 737 aa24.8■■□□□ 1.56
SYF2-203ENST00000474160 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SYF2-203ENST00000474160 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SYF2-203ENST00000474160 NEUROD2Q15784 382 aa24.8■■□□□ 1.56
SYF2-203ENST00000474160 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.8■■□□□ 1.56
SYF2-203ENST00000474160 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SYF2-203ENST00000474160 APAF1O14727 1248 aa24.79■■□□□ 1.56
SYF2-203ENST00000474160 ZPR1O75312 459 aa24.79■■□□□ 1.56
SYF2-203ENST00000474160 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SYF2-203ENST00000474160 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SYF2-203ENST00000474160 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.78■■□□□ 1.56
SYF2-203ENST00000474160 NARFQ9UHQ1 456 aa24.78■■□□□ 1.56
SYF2-203ENST00000474160 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.77■■□□□ 1.56
SYF2-203ENST00000474160 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SYF2-203ENST00000474160 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.77■■□□□ 1.56
SYF2-203ENST00000474160 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SYF2-203ENST00000474160 USP16Q9Y5T5 823 aa24.76■■□□□ 1.55
SYF2-203ENST00000474160 CHL1O00533 1208 aa24.75■■□□□ 1.55
SYF2-203ENST00000474160 MMP10P09238 476 aa24.74■■□□□ 1.55
SYF2-203ENST00000474160 CCDC27Q2M243 656 aa24.74■■□□□ 1.55
SYF2-203ENST00000474160 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.74■■□□□ 1.55
SYF2-203ENST00000474160 ERBB4Q15303 1308 aa24.73■■□□□ 1.55
SYF2-203ENST00000474160 RGL2O15211 777 aa24.73■■□□□ 1.55
SYF2-203ENST00000474160 A1BGP04217 495 aa24.73■■□□□ 1.55
SYF2-203ENST00000474160 CFAP44Q96MT7 982 aa24.73■■□□□ 1.55
SYF2-203ENST00000474160 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SYF2-203ENST00000474160 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.72■■□□□ 1.55
SYF2-203ENST00000474160 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.71■■□□□ 1.55
SYF2-203ENST00000474160 NGEFQ8N5V2 710 aa24.71■■□□□ 1.55
SYF2-203ENST00000474160 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.7■■□□□ 1.54
SYF2-203ENST00000474160 FKBP8Q14318 412 aa24.7■■□□□ 1.54
SYF2-203ENST00000474160 IFT57Q9NWB7 429 aa24.7■■□□□ 1.54
SYF2-203ENST00000474160 HOXB7P09629 217 aa24.68■■□□□ 1.54
SYF2-203ENST00000474160 ZNF853P0CG23 659 aa24.68■■□□□ 1.54
SYF2-203ENST00000474160 TM4SF1P30408 202 aa24.68■■□□□ 1.54
SYF2-203ENST00000474160 GNAI1P63096 354 aa24.68■■□□□ 1.54
SYF2-203ENST00000474160 KLHL34Q8N239 644 aa24.68■■□□□ 1.54
SYF2-203ENST00000474160 SCN7AQ01118 1682 aa24.66■■□□□ 1.54
SYF2-203ENST00000474160 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.66■■□□□ 1.54
SYF2-203ENST00000474160 NBPF26B4DH59 902 aa24.65■■□□□ 1.54
SYF2-203ENST00000474160 CCER2I3L3R5 266 aa24.65■■□□□ 1.54
SYF2-203ENST00000474160 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
SYF2-203ENST00000474160 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
SYF2-203ENST00000474160 NBPF15Q8N660 670 aa24.65■■□□□ 1.54
SYF2-203ENST00000474160 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.65■■□□□ 1.54
SYF2-203ENST00000474160 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
SYF2-203ENST00000474160 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
SYF2-203ENST00000474160 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.64■■□□□ 1.54
SYF2-203ENST00000474160 TGFB2P61812 414 aa24.64■■□□□ 1.54
SYF2-203ENST00000474160 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.64■■□□□ 1.54
SYF2-203ENST00000474160 IL16Q14005 1332 aa24.63■■□□□ 1.53
SYF2-203ENST00000474160 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SYF2-203ENST00000474160 CAMTA2O94983 1202 aa24.63■■□□□ 1.53
SYF2-203ENST00000474160 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.63■■□□□ 1.53
SYF2-203ENST00000474160 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.63■■□□□ 1.53
SYF2-203ENST00000474160 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.63■■□□□ 1.53
SYF2-203ENST00000474160 DDR1Q08345 913 aa24.62■■□□□ 1.53
SYF2-203ENST00000474160 NFIXQ14938 502 aa24.62■■□□□ 1.53
SYF2-203ENST00000474160 WWC1Q8IX03 1113 aa24.62■■□□□ 1.53
SYF2-203ENST00000474160 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.62■■□□□ 1.53
SYF2-203ENST00000474160 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.61■■□□□ 1.53
SYF2-203ENST00000474160 MBIPQ9NS73 344 aa24.61■■□□□ 1.53
SYF2-203ENST00000474160 BCORQ6W2J9 1755 aa24.61■■□□□ 1.53
SYF2-203ENST00000474160 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.59■■□□□ 1.53
SYF2-203ENST00000474160 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.58■■□□□ 1.53
SYF2-203ENST00000474160 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
SYF2-203ENST00000474160 WDR63Q8IWG1 891 aa24.58■■□□□ 1.53
SYF2-203ENST00000474160 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.58■■□□□ 1.52
SYF2-203ENST00000474160 SERPINB2P05120 415 aa24.57■■□□□ 1.52
SYF2-203ENST00000474160 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
SYF2-203ENST00000474160 SETDB2Q96T68 719 aa24.57■■□□□ 1.52
SYF2-203ENST00000474160 GPR162Q16538 588 aa24.56■■□□□ 1.52
SYF2-203ENST00000474160 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.56■■□□□ 1.52
SYF2-203ENST00000474160 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.56■■□□□ 1.52
SYF2-203ENST00000474160 GRIN3BO60391 1043 aa24.55■■□□□ 1.52
SYF2-203ENST00000474160 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.52
SYF2-203ENST00000474160 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.55■■□□□ 1.52
SYF2-203ENST00000474160 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.55■■□□□ 1.52
SYF2-203ENST00000474160 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.54■■□□□ 1.52
SYF2-203ENST00000474160 PDIA6Q15084 440 aa24.54■■□□□ 1.52
SYF2-203ENST00000474160 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.54■■□□□ 1.52
SYF2-203ENST00000474160 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.54■■□□□ 1.52
SYF2-203ENST00000474160 MYL6BP14649 208 aa24.53■■□□□ 1.52
SYF2-203ENST00000474160 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SYF2-203ENST00000474160 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms