RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 MSH5O43196 834 aa28.22■■■□□ 2.11
RALGPS1-212ENST00000472427 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
RALGPS1-212ENST00000472427 UBR3Q6ZT12 1888 aa28.22■■■□□ 2.11
RALGPS1-212ENST00000472427 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
RALGPS1-212ENST00000472427 MYH16Q9H6N6 1097 aa28.22■■■□□ 2.11
RALGPS1-212ENST00000472427 RPS6KA4O75676 772 aa28.21■■■□□ 2.11
RALGPS1-212ENST00000472427 PHF14O94880 888 aa28.21■■■□□ 2.11
RALGPS1-212ENST00000472427 ADRA2BP18089 450 aa28.21■■■□□ 2.11
RALGPS1-212ENST00000472427 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa28.2■■■□□ 2.11
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RALGPS1-212ENST00000472427 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
RALGPS1-212ENST00000472427 HOXB7P09629 217 aa28.18■■■□□ 2.1
RALGPS1-212ENST00000472427 GOLGA2Q08379 1002 aa28.18■■■□□ 2.1
RALGPS1-212ENST00000472427 TRAPPC3LQ5T215 181 aa28.18■■■□□ 2.1
RALGPS1-212ENST00000472427 CHMP4AQ9BY43 222 aa28.18■■■□□ 2.1
RALGPS1-212ENST00000472427 USP16Q9Y5T5 823 aa28.18■■■□□ 2.1
RALGPS1-212ENST00000472427 CASZ1Q86V15 1759 aa28.17■■■□□ 2.1
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RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF521Q96K83 1311 aa28.17■■■□□ 2.1
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RALGPS1-212ENST00000472427 SLC16A10Q8TF71 515 aa28.16■■■□□ 2.1
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RALGPS1-212ENST00000472427 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
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RALGPS1-212ENST00000472427 A0A087WZG4 1122 aa28.14■■■□□ 2.1
RALGPS1-212ENST00000472427 RFC4P35249 363 aa28.14■■■□□ 2.1
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RALGPS1-212ENST00000472427 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
RALGPS1-212ENST00000472427 ERBB4Q15303 1308 aa28.14■■■□□ 2.09
RALGPS1-212ENST00000472427 COL15A1P39059 1388 aa28.13■■■□□ 2.09
RALGPS1-212ENST00000472427 E9PSI1 815 aa28.13■■■□□ 2.09
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RALGPS1-212ENST00000472427 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
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RALGPS1-212ENST00000472427 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa28.11■■■□□ 2.09
RALGPS1-212ENST00000472427 MTFR1LQ9H019 292 aa28.11■■■□□ 2.09
RALGPS1-212ENST00000472427 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
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RALGPS1-212ENST00000472427 ZPR1O75312 459 aa28.08■■■□□ 2.09
RALGPS1-212ENST00000472427 ZBTB7AO95365 584 aa28.08■■■□□ 2.09
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RALGPS1-212ENST00000472427 C4AP0C0L4 1744 aa28.08■■■□□ 2.09
RALGPS1-212ENST00000472427 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
RALGPS1-212ENST00000472427 ARXQ96QS3 562 aa28.07■■■□□ 2.08
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RALGPS1-212ENST00000472427 C8orf58Q8NAV2 365 aa28.06■■■□□ 2.08
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RALGPS1-212ENST00000472427 NECTIN2Q92692 538 aa28.05■■■□□ 2.08
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RALGPS1-212ENST00000472427 NBPF26B4DH59 902 aa28.03■■■□□ 2.08
RALGPS1-212ENST00000472427 POLD1P28340 1107 aa28.03■■■□□ 2.08
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RALGPS1-212ENST00000472427 CCDC30Q5VVM6 783 aa28.03■■■□□ 2.08
RALGPS1-212ENST00000472427 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
RALGPS1-212ENST00000472427 NBPF15Q8N660 670 aa28.03■■■□□ 2.08
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RALGPS1-212ENST00000472427 NLGN1Q8N2Q7 840 aa28.01■■■□□ 2.07
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RALGPS1-212ENST00000472427 MSL1Q68DK7 614 aa28■■■□□ 2.07
RALGPS1-212ENST00000472427 TSPYL6Q8N831 410 aa28■■■□□ 2.07
RALGPS1-212ENST00000472427 CHPF2Q9P2E5 772 aa28■■■□□ 2.07
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RALGPS1-212ENST00000472427 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
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RALGPS1-212ENST00000472427 PDIA6Q15084 440 aa27.96■■■□□ 2.07
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RALGPS1-212ENST00000472427 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.95■■■□□ 2.06
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RALGPS1-212ENST00000472427 ANXA1P04083 346 aa27.94■■■□□ 2.06
RALGPS1-212ENST00000472427 PROSER3Q2NL68 480 aa27.94■■■□□ 2.06
RALGPS1-212ENST00000472427 VAMP4O75379 141 aa27.93■■■□□ 2.06
RALGPS1-212ENST00000472427 CAMTA2O94983 1202 aa27.93■■■□□ 2.06
RALGPS1-212ENST00000472427 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
RALGPS1-212ENST00000472427 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa27.92■■■□□ 2.06
RALGPS1-212ENST00000472427 ERVV-1B6SEH8 477 aa27.91■■■□□ 2.06
RALGPS1-212ENST00000472427 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
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