RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	23.28	■■□□□ 1.32
USP19-210	ENST00000465902	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	23.28	■■□□□ 1.32
USP19-210	ENST00000465902	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	23.27	■■□□□ 1.32
USP19-210	ENST00000465902	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		23.26	■■□□□ 1.31
USP19-210	ENST00000465902	RFC4	P35249	363 aa		23.26	■■□□□ 1.31
USP19-210	ENST00000465902	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		23.26	■■□□□ 1.31
USP19-210	ENST00000465902	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		23.26	■■□□□ 1.31
USP19-210	ENST00000465902	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		23.26	■■□□□ 1.31
USP19-210	ENST00000465902	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	23.26	■■□□□ 1.31
USP19-210	ENST00000465902	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		23.25	■■□□□ 1.31
USP19-210	ENST00000465902	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	23.25	■■□□□ 1.31
USP19-210	ENST00000465902	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	23.25	■■□□□ 1.31
USP19-210	ENST00000465902	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		23.25	■■□□□ 1.31
USP19-210	ENST00000465902	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	23.24	■■□□□ 1.31
USP19-210	ENST00000465902	ADRA2B	P18089	450 aa		23.24	■■□□□ 1.31
USP19-210	ENST00000465902	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		23.23	■■□□□ 1.31
USP19-210	ENST00000465902	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	23.22	■■□□□ 1.31
USP19-210	ENST00000465902	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		23.21	■■□□□ 1.31
USP19-210	ENST00000465902	YY1	P25490	414 aa		23.21	■■□□□ 1.31
USP19-210	ENST00000465902	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	23.21	■■□□□ 1.31
USP19-210	ENST00000465902	KLHL34	Q8N239	644 aa		23.21	■■□□□ 1.31
USP19-210	ENST00000465902	USP16	Q9Y5T5	823 aa		23.21	■■□□□ 1.31
USP19-210	ENST00000465902	C4A	P0C0L4	1744 aa		23.21	■■□□□ 1.31
USP19-210	ENST00000465902	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	23.2	■■□□□ 1.3
USP19-210	ENST00000465902	UTRN	P46939	3433 aa		23.2	■■□□□ 1.3
USP19-210	ENST00000465902	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	23.19	■■□□□ 1.3
USP19-210	ENST00000465902	A1BG	P04217	495 aa		23.19	■■□□□ 1.3
USP19-210	ENST00000465902	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	23.19	■■□□□ 1.3
USP19-210	ENST00000465902	ZPR1	O75312	459 aa		23.17	■■□□□ 1.3
USP19-210	ENST00000465902	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		23.17	■■□□□ 1.3
USP19-210	ENST00000465902	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	23.17	■■□□□ 1.3
USP19-210	ENST00000465902	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	23.17	■■□□□ 1.3
USP19-210	ENST00000465902	COL15A1	P39059	1388 aa		23.16	■■□□□ 1.3
USP19-210	ENST00000465902	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	23.16	■■□□□ 1.3
USP19-210	ENST00000465902	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	23.16	■■□□□ 1.3
USP19-210	ENST00000465902	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		23.15	■■□□□ 1.3
USP19-210	ENST00000465902	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	23.15	■■□□□ 1.3
USP19-210	ENST00000465902	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		23.15	■■□□□ 1.3
USP19-210	ENST00000465902	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	23.14	■■□□□ 1.3
USP19-210	ENST00000465902	CHL1	O00533	1208 aa		23.14	■■□□□ 1.29
USP19-210	ENST00000465902	GYS1	P13807	737 aa		23.14	■■□□□ 1.29
USP19-210	ENST00000465902		A0A087WZG4	1122 aa		23.13	■■□□□ 1.29
USP19-210	ENST00000465902	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	23.13	■■□□□ 1.29
USP19-210	ENST00000465902	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	23.13	■■□□□ 1.29
USP19-210	ENST00000465902	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		23.13	■■□□□ 1.29
USP19-210	ENST00000465902	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		23.13	■■□□□ 1.29
USP19-210	ENST00000465902	CFAP44	Q96MT7	982 aa		23.13	■■□□□ 1.29
USP19-210	ENST00000465902	MMP10	P09238	476 aa		23.12	■■□□□ 1.29
USP19-210	ENST00000465902	NARF	Q9UHQ1	456 aa		23.12	■■□□□ 1.29
USP19-210	ENST00000465902	CCER2	I3L3R5	266 aa		23.11	■■□□□ 1.29
USP19-210	ENST00000465902	GNAI1	P63096	354 aa		23.11	■■□□□ 1.29
USP19-210	ENST00000465902	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		23.11	■■□□□ 1.29
USP19-210	ENST00000465902	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		23.11	■■□□□ 1.29
USP19-210	ENST00000465902	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	23.1	■■□□□ 1.29
USP19-210	ENST00000465902	FKBP8	Q14318	412 aa		23.1	■■□□□ 1.29
USP19-210	ENST00000465902	GPR162	Q16538	588 aa		23.1	■■□□□ 1.29
USP19-210	ENST00000465902	WWC1	Q8IX03	1113 aa		23.09	■■□□□ 1.29
USP19-210	ENST00000465902	MBIP	Q9NS73	344 aa		23.09	■■□□□ 1.29
USP19-210	ENST00000465902	IFT57	Q9NWB7	429 aa		23.09	■■□□□ 1.29
USP19-210	ENST00000465902	CCDC27	Q2M243	656 aa		23.08	■■□□□ 1.29
USP19-210	ENST00000465902	KRT24	Q2M2I5	525 aa		23.08	■■□□□ 1.29
USP19-210	ENST00000465902	NGEF	Q8N5V2	710 aa		23.08	■■□□□ 1.29
USP19-210	ENST00000465902	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		23.08	■■□□□ 1.29
USP19-210	ENST00000465902	NBPF26	B4DH59	902 aa		23.07	■■□□□ 1.28
USP19-210	ENST00000465902	MYL6B	P14649	208 aa		23.07	■■□□□ 1.28
USP19-210	ENST00000465902	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	23.07	■■□□□ 1.28
USP19-210	ENST00000465902	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	23.07	■■□□□ 1.28
USP19-210	ENST00000465902	MIER1	Q8N108	512 aa		23.07	■■□□□ 1.28
USP19-210	ENST00000465902	NBPF15	Q8N660	670 aa		23.07	■■□□□ 1.28
USP19-210	ENST00000465902	NECTIN2	Q92692	538 aa		23.07	■■□□□ 1.28
USP19-210	ENST00000465902	ZNF853	P0CG23	659 aa		23.06	■■□□□ 1.28
USP19-210	ENST00000465902	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	23.06	■■□□□ 1.28
USP19-210	ENST00000465902	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		23.04	■■□□□ 1.28
USP19-210	ENST00000465902	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	23.03	■■□□□ 1.28
USP19-210	ENST00000465902	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	23.03	■■□□□ 1.28
USP19-210	ENST00000465902	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		23.03	■■□□□ 1.28
USP19-210	ENST00000465902	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	23.02	■■□□□ 1.28
USP19-210	ENST00000465902	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		23.02	■■□□□ 1.28
USP19-210	ENST00000465902	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	23.02	■■□□□ 1.28
USP19-210	ENST00000465902	SCN7A	Q01118	1682 aa		23.02	■■□□□ 1.28
USP19-210	ENST00000465902	GRIN3B	O60391	1043 aa		23.01	■■□□□ 1.27
USP19-210	ENST00000465902	CAMTA2	O94983	1202 aa		23.01	■■□□□ 1.27
USP19-210	ENST00000465902	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	23.01	■■□□□ 1.27
USP19-210	ENST00000465902	NFIX	Q14938	502 aa		23.01	■■□□□ 1.27
USP19-210	ENST00000465902	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		23	■■□□□ 1.27
USP19-210	ENST00000465902	TM4SF1	P30408	202 aa		23	■■□□□ 1.27
USP19-210	ENST00000465902	DDR1	Q08345	913 aa		23	■■□□□ 1.27
USP19-210	ENST00000465902	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		23	■■□□□ 1.27
USP19-210	ENST00000465902	ERBB4	Q15303	1308 aa		23	■■□□□ 1.27
USP19-210	ENST00000465902	ANXA1	P04083	346 aa		22.99	■■□□□ 1.27
USP19-210	ENST00000465902	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		22.99	■■□□□ 1.27
USP19-210	ENST00000465902	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		22.99	■■□□□ 1.27
USP19-210	ENST00000465902	WDR63	Q8IWG1	891 aa		22.99	■■□□□ 1.27
USP19-210	ENST00000465902	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		22.99	■■□□□ 1.27
USP19-210	ENST00000465902	IL16	Q14005	1332 aa		22.99	■■□□□ 1.27
USP19-210	ENST00000465902	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	22.98	■■□□□ 1.27
USP19-210	ENST00000465902	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	22.98	■■□□□ 1.27
USP19-210	ENST00000465902	HOXB7	P09629	217 aa		22.98	■■□□□ 1.27
USP19-210	ENST00000465902	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	22.98	■■□□□ 1.27
USP19-210	ENST00000465902	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		22.97	■■□□□ 1.27

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