RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.84■■□□□ 1.89
IMP4-209ENST00000462357 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.84■■□□□ 1.89
IMP4-209ENST00000462357 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
IMP4-209ENST00000462357 NGEFQ8N5V2 710 aa26.83■■□□□ 1.89
IMP4-209ENST00000462357 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
IMP4-209ENST00000462357 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
IMP4-209ENST00000462357 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
IMP4-209ENST00000462357 SGIP1Q9BQI5 828 aa26.82■■□□□ 1.88
IMP4-209ENST00000462357 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
IMP4-209ENST00000462357 MSL1Q68DK7 614 aa26.81■■□□□ 1.88
IMP4-209ENST00000462357 CFAP44Q96MT7 982 aa26.81■■□□□ 1.88
IMP4-209ENST00000462357 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa26.81■■□□□ 1.88
IMP4-209ENST00000462357 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
IMP4-209ENST00000462357 CCER2I3L3R5 266 aa26.8■■□□□ 1.88
IMP4-209ENST00000462357 GNAI1P63096 354 aa26.8■■□□□ 1.88
IMP4-209ENST00000462357 CCDC27Q2M243 656 aa26.8■■□□□ 1.88
IMP4-209ENST00000462357 AMIGO3Q86WK7 504 aa26.8■■□□□ 1.88
IMP4-209ENST00000462357 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.8■■□□□ 1.88
IMP4-209ENST00000462357 CHL1O00533 1208 aa26.79■■□□□ 1.88
IMP4-209ENST00000462357 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
IMP4-209ENST00000462357 SMIM5Q71RC9 77 aa26.79■■□□□ 1.88
IMP4-209ENST00000462357 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
IMP4-209ENST00000462357 USP16Q9Y5T5 823 aa26.79■■□□□ 1.88
IMP4-209ENST00000462357 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
IMP4-209ENST00000462357 EIF5P55010 431 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
IMP4-209ENST00000462357 NARFQ9UHQ1 456 aa26.78■■□□□ 1.88
IMP4-209ENST00000462357 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
IMP4-209ENST00000462357 A1BGP04217 495 aa26.77■■□□□ 1.88
IMP4-209ENST00000462357 IFT57Q9NWB7 429 aa26.77■■□□□ 1.88
IMP4-209ENST00000462357 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.77■■□□□ 1.88
IMP4-209ENST00000462357 COL15A1P39059 1388 aa26.76■■□□□ 1.87
IMP4-209ENST00000462357 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
IMP4-209ENST00000462357 KLHL34Q8N239 644 aa26.76■■□□□ 1.87
IMP4-209ENST00000462357 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.76■■□□□ 1.87
IMP4-209ENST00000462357 UBR3Q6ZT12 1888 aa26.76■■□□□ 1.87
IMP4-209ENST00000462357 UBR2Q8IWV8 1755 aa26.76■■□□□ 1.87
IMP4-209ENST00000462357 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
IMP4-209ENST00000462357 GYS1P13807 737 aa26.75■■□□□ 1.87
IMP4-209ENST00000462357 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
IMP4-209ENST00000462357 TJP1Q07157 1748 aa26.73■■□□□ 1.87
IMP4-209ENST00000462357 MMP10P09238 476 aa26.73■■□□□ 1.87
IMP4-209ENST00000462357 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.73■■□□□ 1.87
IMP4-209ENST00000462357 SYT17Q9BSW7 474 aa26.73■■□□□ 1.87
IMP4-209ENST00000462357 ERBB4Q15303 1308 aa26.72■■□□□ 1.87
IMP4-209ENST00000462357 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.72■■□□□ 1.87
IMP4-209ENST00000462357 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26.71■■□□□ 1.87
IMP4-209ENST00000462357 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26.71■■□□□ 1.87
IMP4-209ENST00000462357 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.7■■□□□ 1.86
IMP4-209ENST00000462357 HOXB7P09629 217 aa26.7■■□□□ 1.86
IMP4-209ENST00000462357 WWC1Q8IX03 1113 aa26.7■■□□□ 1.86
IMP4-209ENST00000462357 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
IMP4-209ENST00000462357 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
IMP4-209ENST00000462357 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
IMP4-209ENST00000462357 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
IMP4-209ENST00000462357 WDR63Q8IWG1 891 aa26.68■■□□□ 1.86
IMP4-209ENST00000462357 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.68■■□□□ 1.86
IMP4-209ENST00000462357 IL16Q14005 1332 aa26.67■■□□□ 1.86
IMP4-209ENST00000462357 RGL2O15211 777 aa26.67■■□□□ 1.86
IMP4-209ENST00000462357 ZNF853P0CG23 659 aa26.67■■□□□ 1.86
IMP4-209ENST00000462357 FKBP8Q14318 412 aa26.67■■□□□ 1.86
IMP4-209ENST00000462357 MBIPQ9NS73 344 aa26.67■■□□□ 1.86
IMP4-209ENST00000462357 CLEC4GQ6UXB4 293 aa26.66■■□□□ 1.86
IMP4-209ENST00000462357 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.65■■□□□ 1.86
IMP4-209ENST00000462357 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
IMP4-209ENST00000462357 TM4SF1P30408 202 aa26.63■■□□□ 1.85
IMP4-209ENST00000462357 SETDB2Q96T68 719 aa26.63■■□□□ 1.85
IMP4-209ENST00000462357 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.62■■□□□ 1.85
IMP4-209ENST00000462357 NBPF26B4DH59 902 aa26.62■■□□□ 1.85
IMP4-209ENST00000462357 MYL6BP14649 208 aa26.62■■□□□ 1.85
IMP4-209ENST00000462357 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
IMP4-209ENST00000462357 NBPF15Q8N660 670 aa26.62■■□□□ 1.85
IMP4-209ENST00000462357 NPHP1O15259 732 aa26.61■■□□□ 1.85
IMP4-209ENST00000462357 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
IMP4-209ENST00000462357 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.61■■□□□ 1.85
IMP4-209ENST00000462357 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.61■■□□□ 1.85
IMP4-209ENST00000462357 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.6■■□□□ 1.85
IMP4-209ENST00000462357 TGFB2P61812 414 aa26.6■■□□□ 1.85
IMP4-209ENST00000462357 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
IMP4-209ENST00000462357 CAMTA2O94983 1202 aa26.59■■□□□ 1.85
IMP4-209ENST00000462357 NFIXQ14938 502 aa26.59■■□□□ 1.85
IMP4-209ENST00000462357 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.59■■□□□ 1.85
IMP4-209ENST00000462357 COL24A1Q17RW2 1714 aa26.59■■□□□ 1.85
IMP4-209ENST00000462357 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.58■■□□□ 1.85
IMP4-209ENST00000462357 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.85
IMP4-209ENST00000462357 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
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IMP4-209ENST00000462357 GOLGA2Q08379 1002 aa26.57■■□□□ 1.84
IMP4-209ENST00000462357 GPR162Q16538 588 aa26.57■■□□□ 1.84
IMP4-209ENST00000462357 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.57■■□□□ 1.84
IMP4-209ENST00000462357 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.56■■□□□ 1.84
IMP4-209ENST00000462357 HYPKQ9NX55 129 aa26.56■■□□□ 1.84
IMP4-209ENST00000462357 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.55■■□□□ 1.84
IMP4-209ENST00000462357 MIER1Q8N108 512 aa26.55■■□□□ 1.84
IMP4-209ENST00000462357 NECTIN2Q92692 538 aa26.55■■□□□ 1.84
IMP4-209ENST00000462357 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26.54■■□□□ 1.84
IMP4-209ENST00000462357 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.54■■□□□ 1.84
IMP4-209ENST00000462357 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.54■■□□□ 1.84
IMP4-209ENST00000462357 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.54■■□□□ 1.84
IMP4-209ENST00000462357 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
IMP4-209ENST00000462357 DDR1Q08345 913 aa26.53■■□□□ 1.84
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