RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445369.2

CLDN9-201, Transcript of claudin 9, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN9, Length 2,050 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9-201ENST00000445369 PLEKHG5O94827 1062 aa21.84■■□□□ 1.09
CLDN9-201ENST00000445369 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CLDN9-201ENST00000445369 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CLDN9-201ENST00000445369 ANXA1P04083 346 aa21.83■■□□□ 1.09
CLDN9-201ENST00000445369 CHMLP26374 656 aa21.83■■□□□ 1.09
CLDN9-201ENST00000445369 SSFA2P28290 1259 aa21.83■■□□□ 1.09
CLDN9-201ENST00000445369 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.83■■□□□ 1.09
CLDN9-201ENST00000445369 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.83■■□□□ 1.09
CLDN9-201ENST00000445369 ERBB3P21860 1342 aa21.83■■□□□ 1.09
CLDN9-201ENST00000445369 SCN11AQ9UI33 1791 aa21.83■■□□□ 1.08
CLDN9-201ENST00000445369 PTMSP20962 102 aa21.83■■□□□ 1.08
CLDN9-201ENST00000445369 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CLDN9-201ENST00000445369 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa21.82■■□□□ 1.08
CLDN9-201ENST00000445369 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa21.81■■□□□ 1.08
CLDN9-201ENST00000445369 SRGAP3O43295 1099 aa21.81■■□□□ 1.08
CLDN9-201ENST00000445369 SURF6O75683 361 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CLDN9-201ENST00000445369 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.81■■□□□ 1.08
CLDN9-201ENST00000445369 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.81■■□□□ 1.08
CLDN9-201ENST00000445369 RILPL2Q969X0 211 aa21.81■■□□□ 1.08
CLDN9-201ENST00000445369 UNC5CLQ8IV45 518 aa21.8■■□□□ 1.08
CLDN9-201ENST00000445369 COL18A1P39060 1754 aa21.8■■□□□ 1.08
CLDN9-201ENST00000445369 KIF1BPQ96EK5 621 aa21.79■■□□□ 1.08
CLDN9-201ENST00000445369 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.79■■□□□ 1.08
CLDN9-201ENST00000445369 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CLDN9-201ENST00000445369 MTX1Q13505 466 aa21.78■■□□□ 1.08
CLDN9-201ENST00000445369 PROSER3Q2NL68 480 aa21.78■■□□□ 1.08
CLDN9-201ENST00000445369 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CLDN9-201ENST00000445369 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.78■■□□□ 1.08
CLDN9-201ENST00000445369 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CLDN9-201ENST00000445369 ABCC6O95255 1503 aa21.78■■□□□ 1.08
CLDN9-201ENST00000445369 C5P01031 1676 aa21.78■■□□□ 1.08
CLDN9-201ENST00000445369 ALDH1L1O75891 902 aa21.78■■□□□ 1.08
CLDN9-201ENST00000445369 NUCB2P80303 420 aa21.78■■□□□ 1.08
CLDN9-201ENST00000445369 PI4K2BQ8TCG2 481 aa21.78■■□□□ 1.08
CLDN9-201ENST00000445369 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CLDN9-201ENST00000445369 IL17RAQ96F46 866 aa21.77■■□□□ 1.08
CLDN9-201ENST00000445369 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.77■■□□□ 1.08
CLDN9-201ENST00000445369 DCCP43146 1447 aa21.77■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 MCCP23508 829 aa21.76■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 ANAPC15P60006 121 aa21.76■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 KSR2Q6VAB6 950 aa21.76■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.76■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 BAG4O95429 457 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa21.76■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.75■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 HYPKQ9NX55 129 aa21.75■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 PALD1Q9ULE6 856 aa21.75■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.73■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 NEK4P51957 841 aa21.73■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 MEGF6O75095 1541 aa21.73■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 TMEM94Q12767 1356 aa21.73■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 MCM2P49736 904 aa21.72■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 IL25Q9H293 177 aa21.72■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 NPHP3Q7Z494 1330 aa21.72■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.71■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 ARXQ96QS3 562 aa21.71■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.71■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 ATF3P18847 181 aa21.71■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 MRE11P49959 708 aa21.71■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 PKP1Q13835 747 aa21.71■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 MRC1P22897 1456 aa21.71■■□□□ 1.07
CLDN9-201ENST00000445369 PDIA6Q15084 440 aa21.7■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.7■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.7■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 UTYO14607 1347 aa21.7■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 TTC41PQ6P2S7 1318 aa21.7■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF790Q6PG37 636 aa21.7■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 LINS1Q8NG48 757 aa21.7■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 TMX3Q96JJ7 454 aa21.7■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.7■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 PHKG2P15735 406 aa21.69■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.69■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 CNTROBQ8N137 903 aa21.68■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.68■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 HSPA4P34932 840 aa21.68■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 HSPA2P54652 639 aa21.68■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 CUL4AQ13619 759 aa21.68■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 PANK2Q9BZ23 570 aa21.68■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 GRPEL1Q9HAV7 217 aa21.68■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 SGSM2O43147 1006 aa21.67■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 KLHL40Q2TBA0 621 aa21.67■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 ZDHHC9Q9Y397 364 aa21.67■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 RAD50Q92878 1312 aa21.67■■□□□ 1.06
CLDN9-201ENST00000445369 GRM8O00222 908 aa21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms