RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 STARD3NLO95772 234 aa32.93■■■□□ 2.86
HTATSF1-202ENST00000425695 SYT17Q9BSW7 474 aa32.92■■■□□ 2.86
HTATSF1-202ENST00000425695 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa32.92■■■□□ 2.86
HTATSF1-202ENST00000425695 CANXP27824 592 aaKnown RBP32.91■■■□□ 2.86
HTATSF1-202ENST00000425695 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP32.91■■■□□ 2.86
HTATSF1-202ENST00000425695 MRS2Q9HD23 443 aa32.9■■■□□ 2.86
HTATSF1-202ENST00000425695 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa32.88■■■□□ 2.85
HTATSF1-202ENST00000425695 LMOD3Q0VAK6 560 aa32.88■■■□□ 2.85
HTATSF1-202ENST00000425695 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP32.88■■■□□ 2.85
HTATSF1-202ENST00000425695 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP32.88■■■□□ 2.85
HTATSF1-202ENST00000425695 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP32.87■■■□□ 2.85
HTATSF1-202ENST00000425695 USP16Q9Y5T5 823 aa32.86■■■□□ 2.85
HTATSF1-202ENST00000425695 A1BGP04217 495 aa32.85■■■□□ 2.85
HTATSF1-202ENST00000425695 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
HTATSF1-202ENST00000425695 GYS1P13807 737 aa32.85■■■□□ 2.85
HTATSF1-202ENST00000425695 APAF1O14727 1248 aa32.84■■■□□ 2.85
HTATSF1-202ENST00000425695 TRIM35Q9UPQ4 493 aa32.84■■■□□ 2.85
HTATSF1-202ENST00000425695 C4AP0C0L4 1744 aa32.84■■■□□ 2.85
HTATSF1-202ENST00000425695 NLGN1Q8N2Q7 840 aa32.83■■■□□ 2.85
HTATSF1-202ENST00000425695 MMP10P09238 476 aa32.82■■■□□ 2.84
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP32.82■■■□□ 2.84
HTATSF1-202ENST00000425695 ZPR1O75312 459 aa32.81■■■□□ 2.84
HTATSF1-202ENST00000425695 TSPYL4Q9UJ04 414 aa32.81■■■□□ 2.84
HTATSF1-202ENST00000425695 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP32.8■■■□□ 2.84
HTATSF1-202ENST00000425695 COL15A1P39059 1388 aa32.8■■■□□ 2.84
HTATSF1-202ENST00000425695 KDM3BQ7LBC6 1761 aa32.79■■■□□ 2.84
HTATSF1-202ENST00000425695 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP32.79■■■□□ 2.84
HTATSF1-202ENST00000425695 EIF5P55010 431 aaKnown RBP32.79■■■□□ 2.84
HTATSF1-202ENST00000425695 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP32.79■■■□□ 2.84
HTATSF1-202ENST00000425695 USPL1Q5W0Q7 1092 aa32.79■■■□□ 2.84
HTATSF1-202ENST00000425695 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa32.78■■■□□ 2.84
HTATSF1-202ENST00000425695 FKBP8Q14318 412 aa32.78■■■□□ 2.84
HTATSF1-202ENST00000425695 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP32.78■■■□□ 2.84
HTATSF1-202ENST00000425695 NLGN2Q8NFZ4 835 aa32.77■■■□□ 2.84
HTATSF1-202ENST00000425695 NARFQ9UHQ1 456 aa32.76■■■□□ 2.83
HTATSF1-202ENST00000425695 DCAF8L1A6NGE4 600 aa32.75■■■□□ 2.83
HTATSF1-202ENST00000425695 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP32.74■■■□□ 2.83
HTATSF1-202ENST00000425695 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP32.74■■■□□ 2.83
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A087WZG4 1122 aa32.73■■■□□ 2.83
HTATSF1-202ENST00000425695 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP32.73■■■□□ 2.83
HTATSF1-202ENST00000425695 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa32.73■■■□□ 2.83
HTATSF1-202ENST00000425695 PARP3Q9Y6F1 533 aa32.73■■■□□ 2.83
HTATSF1-202ENST00000425695 CD2APQ9Y5K6 639 aa32.72■■■□□ 2.83
HTATSF1-202ENST00000425695 BABAM1Q9NWV8 329 aa32.71■■■□□ 2.83
HTATSF1-202ENST00000425695 BCL2L12Q9HB09 334 aa32.69■■■□□ 2.82
HTATSF1-202ENST00000425695 NBPF26B4DH59 902 aa32.68■■■□□ 2.82
HTATSF1-202ENST00000425695 CHL1O00533 1208 aa32.68■■■□□ 2.82
HTATSF1-202ENST00000425695 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP32.68■■■□□ 2.82
HTATSF1-202ENST00000425695 NBPF15Q8N660 670 aa32.68■■■□□ 2.82
HTATSF1-202ENST00000425695 DDR1Q08345 913 aa32.67■■■□□ 2.82
HTATSF1-202ENST00000425695 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
HTATSF1-202ENST00000425695 TM4SF1P30408 202 aa32.66■■■□□ 2.82
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM9BQ8IZU0 186 aa32.66■■■□□ 2.82
HTATSF1-202ENST00000425695 NFIXQ14938 502 aa32.64■■■□□ 2.82
HTATSF1-202ENST00000425695 GPR162Q16538 588 aa32.64■■■□□ 2.82
HTATSF1-202ENST00000425695 BICDL1Q6ZP65 573 aa32.64■■■□□ 2.82
HTATSF1-202ENST00000425695 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP32.64■■■□□ 2.82
HTATSF1-202ENST00000425695 LAMB4A4D0S4 1761 aa32.63■■■□□ 2.81
HTATSF1-202ENST00000425695 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP32.63■■■□□ 2.81
HTATSF1-202ENST00000425695 NGEFQ8N5V2 710 aa32.63■■■□□ 2.81
HTATSF1-202ENST00000425695 KRT24Q2M2I5 525 aa32.62■■■□□ 2.81
HTATSF1-202ENST00000425695 CFAP44Q96MT7 982 aa32.62■■■□□ 2.81
HTATSF1-202ENST00000425695 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP32.61■■■□□ 2.81
HTATSF1-202ENST00000425695 CAMTA2O94983 1202 aa32.61■■■□□ 2.81
HTATSF1-202ENST00000425695 MYL6BP14649 208 aa32.59■■■□□ 2.81
HTATSF1-202ENST00000425695 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP32.59■■■□□ 2.81
HTATSF1-202ENST00000425695 TBC1D9BQ66K14 1250 aa32.59■■■□□ 2.81
HTATSF1-202ENST00000425695 NECTIN2Q92692 538 aa32.59■■■□□ 2.81
HTATSF1-202ENST00000425695 WWC3Q9ULE0 1092 aa32.59■■■□□ 2.81
HTATSF1-202ENST00000425695 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP32.59■■■□□ 2.81
HTATSF1-202ENST00000425695 MBIPQ9NS73 344 aa32.58■■■□□ 2.81
HTATSF1-202ENST00000425695 SERPINB2P05120 415 aa32.56■■■□□ 2.8
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF853P0CG23 659 aa32.56■■■□□ 2.8
HTATSF1-202ENST00000425695 GNAI1P63096 354 aa32.56■■■□□ 2.8
HTATSF1-202ENST00000425695 IFT57Q9NWB7 429 aa32.56■■■□□ 2.8
HTATSF1-202ENST00000425695 C10orf71Q711Q0 1435 aa32.55■■■□□ 2.8
HTATSF1-202ENST00000425695 SCN7AQ01118 1682 aa32.54■■■□□ 2.8
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A0G2JLW4 131 aa32.53■■■□□ 2.8
HTATSF1-202ENST00000425695 WWC1Q8IX03 1113 aa32.53■■■□□ 2.8
HTATSF1-202ENST00000425695 ANXA1P04083 346 aa32.52■■■□□ 2.8
HTATSF1-202ENST00000425695 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP32.52■■■□□ 2.8
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC27Q2M243 656 aa32.52■■■□□ 2.8
HTATSF1-202ENST00000425695 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.8
HTATSF1-202ENST00000425695 KIF13BQ9NQT8 1826 aa32.51■■■□□ 2.8
HTATSF1-202ENST00000425695 TGFB2P61812 414 aa32.51■■■□□ 2.79
HTATSF1-202ENST00000425695 TTLL7Q6ZT98 887 aa32.51■■■□□ 2.79
HTATSF1-202ENST00000425695 SETDB2Q96T68 719 aa32.51■■■□□ 2.79
HTATSF1-202ENST00000425695 DPEP1P16444 411 aa32.5■■■□□ 2.79
HTATSF1-202ENST00000425695 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP32.5■■■□□ 2.79
HTATSF1-202ENST00000425695 ERBB4Q15303 1308 aa32.5■■■□□ 2.79
HTATSF1-202ENST00000425695 PDIA6Q15084 440 aa32.49■■■□□ 2.79
HTATSF1-202ENST00000425695 HLFQ16534 295 aa32.49■■■□□ 2.79
HTATSF1-202ENST00000425695 PROSER3Q2NL68 480 aa32.49■■■□□ 2.79
HTATSF1-202ENST00000425695 DUSP27Q5VZP5 1158 aa32.49■■■□□ 2.79
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF652Q9Y2D9 606 aa32.49■■■□□ 2.79
HTATSF1-202ENST00000425695 BCORQ6W2J9 1755 aa32.49■■■□□ 2.79
HTATSF1-202ENST00000425695 PXDNLA1KZ92 1463 aa32.48■■■□□ 2.79
HTATSF1-202ENST00000425695 CLEC4GQ6UXB4 293 aa32.48■■■□□ 2.79
HTATSF1-202ENST00000425695 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP32.47■■■□□ 2.79
HTATSF1-202ENST00000425695 KIF6Q6ZMV9 814 aa32.47■■■□□ 2.79
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