RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404287.2

MESTP1-201, Transcript of mesoderm specific transcript pseudogene 1, humanhuman

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Gene MESTP1, Length 994 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESTP1-201ENST00000404287 ADRA2BP18089 450 aa25.37■■□□□ 1.65
MESTP1-201ENST00000404287 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.37■■□□□ 1.65
MESTP1-201ENST00000404287 MSL1Q68DK7 614 aa25.37■■□□□ 1.65
MESTP1-201ENST00000404287 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.36■■□□□ 1.65
MESTP1-201ENST00000404287 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
MESTP1-201ENST00000404287 USP16Q9Y5T5 823 aa25.35■■□□□ 1.65
MESTP1-201ENST00000404287 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
MESTP1-201ENST00000404287 STARD3NLO95772 234 aa25.33■■□□□ 1.65
MESTP1-201ENST00000404287 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
MESTP1-201ENST00000404287 ARXQ96QS3 562 aa25.32■■□□□ 1.64
MESTP1-201ENST00000404287 A1BGP04217 495 aa25.31■■□□□ 1.64
MESTP1-201ENST00000404287 GYS1P13807 737 aa25.31■■□□□ 1.64
MESTP1-201ENST00000404287 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
MESTP1-201ENST00000404287 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.31■■□□□ 1.64
MESTP1-201ENST00000404287 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
MESTP1-201ENST00000404287 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
MESTP1-201ENST00000404287 CHL1O00533 1208 aa25.3■■□□□ 1.64
MESTP1-201ENST00000404287 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
MESTP1-201ENST00000404287 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.3■■□□□ 1.64
MESTP1-201ENST00000404287 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
MESTP1-201ENST00000404287 COL15A1P39059 1388 aa25.3■■□□□ 1.64
MESTP1-201ENST00000404287 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
MESTP1-201ENST00000404287 POLD1P28340 1107 aa25.29■■□□□ 1.64
MESTP1-201ENST00000404287 RFC4P35249 363 aa25.29■■□□□ 1.64
MESTP1-201ENST00000404287 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.28■■□□□ 1.64
MESTP1-201ENST00000404287 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
MESTP1-201ENST00000404287 ZNF853P0CG23 659 aa25.27■■□□□ 1.64
MESTP1-201ENST00000404287 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.26■■□□□ 1.63
MESTP1-201ENST00000404287 NBPF26B4DH59 902 aa25.26■■□□□ 1.63
MESTP1-201ENST00000404287 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
MESTP1-201ENST00000404287 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
MESTP1-201ENST00000404287 NBPF15Q8N660 670 aa25.26■■□□□ 1.63
MESTP1-201ENST00000404287 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.26■■□□□ 1.63
MESTP1-201ENST00000404287 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
MESTP1-201ENST00000404287 SYT17Q9BSW7 474 aa25.25■■□□□ 1.63
MESTP1-201ENST00000404287 FKBP8Q14318 412 aa25.24■■□□□ 1.63
MESTP1-201ENST00000404287 CFAP44Q96MT7 982 aa25.24■■□□□ 1.63
MESTP1-201ENST00000404287 NARFQ9UHQ1 456 aa25.24■■□□□ 1.63
MESTP1-201ENST00000404287 CCDC27Q2M243 656 aa25.23■■□□□ 1.63
MESTP1-201ENST00000404287 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.23■■□□□ 1.63
MESTP1-201ENST00000404287 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.23■■□□□ 1.63
MESTP1-201ENST00000404287 NLGN1Q8N2Q7 840 aa25.23■■□□□ 1.63
MESTP1-201ENST00000404287 MMP10P09238 476 aa25.22■■□□□ 1.63
MESTP1-201ENST00000404287 KRT24Q2M2I5 525 aa25.22■■□□□ 1.63
MESTP1-201ENST00000404287 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
MESTP1-201ENST00000404287 WWC1Q8IX03 1113 aa25.2■■□□□ 1.62
MESTP1-201ENST00000404287 MBIPQ9NS73 344 aa25.2■■□□□ 1.62
MESTP1-201ENST00000404287 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
MESTP1-201ENST00000404287 CCER2I3L3R5 266 aa25.19■■□□□ 1.62
MESTP1-201ENST00000404287 TM4SF1P30408 202 aa25.19■■□□□ 1.62
MESTP1-201ENST00000404287 DDR1Q08345 913 aa25.19■■□□□ 1.62
MESTP1-201ENST00000404287 IFT57Q9NWB7 429 aa25.19■■□□□ 1.62
MESTP1-201ENST00000404287 SCN7AQ01118 1682 aa25.19■■□□□ 1.62
MESTP1-201ENST00000404287 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
MESTP1-201ENST00000404287 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.18■■□□□ 1.62
MESTP1-201ENST00000404287 A0A087WZG4 1122 aa25.17■■□□□ 1.62
MESTP1-201ENST00000404287 ZPR1O75312 459 aa25.17■■□□□ 1.62
MESTP1-201ENST00000404287 CAMTA2O94983 1202 aa25.17■■□□□ 1.62
MESTP1-201ENST00000404287 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.17■■□□□ 1.62
MESTP1-201ENST00000404287 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.16■■□□□ 1.62
MESTP1-201ENST00000404287 GNAI1P63096 354 aa25.15■■□□□ 1.62
MESTP1-201ENST00000404287 PDIA6Q15084 440 aa25.15■■□□□ 1.62
MESTP1-201ENST00000404287 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
MESTP1-201ENST00000404287 BCORQ6W2J9 1755 aa25.14■■□□□ 1.62
MESTP1-201ENST00000404287 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
MESTP1-201ENST00000404287 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
MESTP1-201ENST00000404287 NFIXQ14938 502 aa25.14■■□□□ 1.62
MESTP1-201ENST00000404287 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.14■■□□□ 1.62
MESTP1-201ENST00000404287 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
MESTP1-201ENST00000404287 ERBB4Q15303 1308 aa25.12■■□□□ 1.61
MESTP1-201ENST00000404287 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.12■■□□□ 1.61
MESTP1-201ENST00000404287 PROSER3Q2NL68 480 aa25.12■■□□□ 1.61
MESTP1-201ENST00000404287 MIER1Q8N108 512 aa25.12■■□□□ 1.61
MESTP1-201ENST00000404287 KLHL34Q8N239 644 aa25.12■■□□□ 1.61
MESTP1-201ENST00000404287 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
MESTP1-201ENST00000404287 IL16Q14005 1332 aa25.11■■□□□ 1.61
MESTP1-201ENST00000404287 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.1■■□□□ 1.61
MESTP1-201ENST00000404287 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.1■■□□□ 1.61
MESTP1-201ENST00000404287 HOXB7P09629 217 aa25.1■■□□□ 1.61
MESTP1-201ENST00000404287 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
MESTP1-201ENST00000404287 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.1■■□□□ 1.61
MESTP1-201ENST00000404287 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.1■■□□□ 1.61
MESTP1-201ENST00000404287 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.09■■□□□ 1.61
MESTP1-201ENST00000404287 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
MESTP1-201ENST00000404287 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.09■■□□□ 1.61
MESTP1-201ENST00000404287 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
MESTP1-201ENST00000404287 ZNF521Q96K83 1311 aa25.09■■□□□ 1.61
MESTP1-201ENST00000404287 ANXA1P04083 346 aa25.08■■□□□ 1.61
MESTP1-201ENST00000404287 MYL6BP14649 208 aa25.08■■□□□ 1.61
MESTP1-201ENST00000404287 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.08■■□□□ 1.61
MESTP1-201ENST00000404287 C8orf58Q8NAV2 365 aa25.08■■□□□ 1.61
MESTP1-201ENST00000404287 NECTIN2Q92692 538 aa25.08■■□□□ 1.61
MESTP1-201ENST00000404287 WDR63Q8IWG1 891 aa25.07■■□□□ 1.6
MESTP1-201ENST00000404287 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
MESTP1-201ENST00000404287 RGL2O15211 777 aa25.06■■□□□ 1.6
MESTP1-201ENST00000404287 HLFQ16534 295 aa25.06■■□□□ 1.6
MESTP1-201ENST00000404287 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.06■■□□□ 1.6
MESTP1-201ENST00000404287 UTRNP46939 3433 aa25.05■■□□□ 1.6
MESTP1-201ENST00000404287 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
MESTP1-201ENST00000404287 NGEFQ8N5V2 710 aa25.05■■□□□ 1.6
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