RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 RHPN1Q8TCX5 695 aa19.24■□□□□ 0.67
CTDSP2-201ENST00000398073 ZFYVE9O95405 1425 aa19.24■□□□□ 0.67
CTDSP2-201ENST00000398073 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
CTDSP2-201ENST00000398073 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
CTDSP2-201ENST00000398073 PPFIBP1Q86W92 1011 aa19.24■□□□□ 0.67
CTDSP2-201ENST00000398073 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
CTDSP2-201ENST00000398073 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP19.23■□□□□ 0.67
CTDSP2-201ENST00000398073 TXLNAP40222 546 aa19.23■□□□□ 0.67
CTDSP2-201ENST00000398073 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
CTDSP2-201ENST00000398073 NACAP1Q9BZK3 213 aa19.23■□□□□ 0.67
CTDSP2-201ENST00000398073 TTLL5Q6EMB2 1281 aa19.23■□□□□ 0.67
CTDSP2-201ENST00000398073 CEP85Q6P2H3 762 aa19.23■□□□□ 0.67
CTDSP2-201ENST00000398073 CLIP2Q9UDT6 1046 aa19.23■□□□□ 0.67
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A1W2PP64 1363 aa19.23■□□□□ 0.67
CTDSP2-201ENST00000398073 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
CTDSP2-201ENST00000398073 CAVIN2O95810 425 aa19.22■□□□□ 0.67
CTDSP2-201ENST00000398073 NEMFO60524 1076 aa19.22■□□□□ 0.67
CTDSP2-201ENST00000398073 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
CTDSP2-201ENST00000398073 KIF18AQ8NI77 898 aa19.22■□□□□ 0.67
CTDSP2-201ENST00000398073 HYPKQ9NX55 129 aa19.22■□□□□ 0.67
CTDSP2-201ENST00000398073 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
CTDSP2-201ENST00000398073 CAGE1Q8TC20 777 aa19.21■□□□□ 0.67
CTDSP2-201ENST00000398073 ACEP12821 1306 aa19.21■□□□□ 0.67
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC69A6NI79 296 aa19.21■□□□□ 0.67
CTDSP2-201ENST00000398073 ATP8B2P98198 1209 aa19.21■□□□□ 0.67
CTDSP2-201ENST00000398073 USHBP1Q8N6Y0 703 aa19.21■□□□□ 0.67
CTDSP2-201ENST00000398073 UBXN4Q92575 508 aa19.21■□□□□ 0.67
CTDSP2-201ENST00000398073 MAST1Q9Y2H9 1570 aa19.21■□□□□ 0.67
CTDSP2-201ENST00000398073 PI4KAP2A4QPH2 592 aa19.2■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa19.2■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa19.2■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 ZMYM3Q14202 1370 aa19.2■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa19.2■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 PHACTR3Q96KR7 559 aa19.2■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 USP26Q9BXU7 913 aa19.2■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 TNNT1P13805 278 aa19.2■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF165P49910 485 aa19.19■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 CFAP100Q494V2 611 aa19.19■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa19.19■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 USP48Q86UV5 1035 aa19.19■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 HMG20BQ9P0W2 317 aa19.19■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa19.18■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 KDM5CP41229 1560 aa19.18■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 ADGBQ8N7X0 1667 aa19.18■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 GIMAP6Q6P9H5 292 aa19.18■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 ANKLE2Q86XL3 938 aa19.18■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 MYD88Q99836 296 aa19.18■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 KDM6BO15054 1643 aa19.18■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa19.17■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 WASF1Q92558 559 aa19.17■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 ERLIN1O75477 346 aa19.17■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 OFD1O75665 1012 aa19.17■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 CBX1P83916 185 aa19.17■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 LEKR1Q6ZMV7 388 aa19.17■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 C8orf76Q96K31 380 aa19.17■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa19.17■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIM35Q9UPQ4 493 aa19.16■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 CNPY2Q9Y2B0 182 aa19.16■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa19.16■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 POGZQ7Z3K3 1410 aa19.15■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 CDR1P51861 262 aa19.15■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 GSDMDP57764 484 aa19.15■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP19.15■□□□□ 0.666e-12■■■■□ 22.8
CTDSP2-201ENST00000398073 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 STX1AQ16623 288 aa19.15■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 PHF8Q9UPP1 1060 aa19.15■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 AKAP2Q9Y2D5 859 aa19.15■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 PDE4CQ08493 712 aa19.15■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 PTPRTO14522 1441 aa19.15■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 FSIP1Q8NA03 581 aa19.15■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
CTDSP2-201ENST00000398073 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
CTDSP2-201ENST00000398073 F13A1P00488 732 aa19.14■□□□□ 0.65
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM200AQ8TCP9 573 aa19.14■□□□□ 0.65
CTDSP2-201ENST00000398073 TTC21AQ8NDW8 1320 aa19.14■□□□□ 0.65
CTDSP2-201ENST00000398073 ZSCAN12O43309 604 aa19.14■□□□□ 0.65
CTDSP2-201ENST00000398073 NEK1Q96PY6 1258 aa19.14■□□□□ 0.65
CTDSP2-201ENST00000398073 ABCC10Q5T3U5 1492 aa19.14■□□□□ 0.65
CTDSP2-201ENST00000398073 NUP133Q8WUM0 1156 aa19.14■□□□□ 0.65
CTDSP2-201ENST00000398073 TMCO3Q6UWJ1 677 aa19.13■□□□□ 0.65
CTDSP2-201ENST00000398073 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
CTDSP2-201ENST00000398073 WDR7Q9Y4E6 1490 aa19.13■□□□□ 0.65
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM177BA6PVY3 158 aa19.13■□□□□ 0.65
CTDSP2-201ENST00000398073 STIM1Q13586 685 aa19.13■□□□□ 0.65
CTDSP2-201ENST00000398073 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa19.13■□□□□ 0.65
CTDSP2-201ENST00000398073 NPATQ14207 1427 aa19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms