RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395564.8

UPP1-203, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-203ENST00000395564 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
UPP1-203ENST00000395564 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.32■■□□□ 1.32
UPP1-203ENST00000395564 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.32■■□□□ 1.32
UPP1-203ENST00000395564 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.32■■□□□ 1.32
UPP1-203ENST00000395564 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
UPP1-203ENST00000395564 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
UPP1-203ENST00000395564 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.32■■□□□ 1.32
UPP1-203ENST00000395564 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
UPP1-203ENST00000395564 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
UPP1-203ENST00000395564 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.31■■□□□ 1.32
UPP1-203ENST00000395564 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.31■■□□□ 1.32
UPP1-203ENST00000395564 GNPATO15228 680 aa23.3■■□□□ 1.32
UPP1-203ENST00000395564 RPS6KA4O75676 772 aa23.3■■□□□ 1.32
UPP1-203ENST00000395564 SSFA2P28290 1259 aa23.3■■□□□ 1.32
UPP1-203ENST00000395564 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
UPP1-203ENST00000395564 SLFN5Q08AF3 891 aa23.29■■□□□ 1.32
UPP1-203ENST00000395564 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
UPP1-203ENST00000395564 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.29■■□□□ 1.32
UPP1-203ENST00000395564 ADRA2BP18089 450 aa23.28■■□□□ 1.32
UPP1-203ENST00000395564 KRT24Q2M2I5 525 aa23.28■■□□□ 1.32
UPP1-203ENST00000395564 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.28■■□□□ 1.32
UPP1-203ENST00000395564 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.28■■□□□ 1.32
UPP1-203ENST00000395564 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.28■■□□□ 1.32
UPP1-203ENST00000395564 ERBB4Q15303 1308 aa23.28■■□□□ 1.32
UPP1-203ENST00000395564 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.27■■□□□ 1.32
UPP1-203ENST00000395564 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.31
UPP1-203ENST00000395564 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.31
UPP1-203ENST00000395564 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.27■■□□□ 1.31
UPP1-203ENST00000395564 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
UPP1-203ENST00000395564 A1BGP04217 495 aa23.26■■□□□ 1.31
UPP1-203ENST00000395564 TRAPPC3LQ5T215 181 aa23.25■■□□□ 1.31
UPP1-203ENST00000395564 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.25■■□□□ 1.31
UPP1-203ENST00000395564 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
UPP1-203ENST00000395564 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
UPP1-203ENST00000395564 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
UPP1-203ENST00000395564 EIF5P55010 431 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
UPP1-203ENST00000395564 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
UPP1-203ENST00000395564 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.24■■□□□ 1.31
UPP1-203ENST00000395564 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
UPP1-203ENST00000395564 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.23■■□□□ 1.31
UPP1-203ENST00000395564 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.23■■□□□ 1.31
UPP1-203ENST00000395564 CASZ1Q86V15 1759 aa23.22■■□□□ 1.31
UPP1-203ENST00000395564 A0A087WZG4 1122 aa23.22■■□□□ 1.31
UPP1-203ENST00000395564 NBPF26B4DH59 902 aa23.22■■□□□ 1.31
UPP1-203ENST00000395564 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
UPP1-203ENST00000395564 PHF14O94880 888 aa23.22■■□□□ 1.31
UPP1-203ENST00000395564 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
UPP1-203ENST00000395564 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
UPP1-203ENST00000395564 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
UPP1-203ENST00000395564 NBPF15Q8N660 670 aa23.22■■□□□ 1.31
UPP1-203ENST00000395564 TSPYL6Q8N831 410 aa23.22■■□□□ 1.31
UPP1-203ENST00000395564 COL15A1P39059 1388 aa23.22■■□□□ 1.31
UPP1-203ENST00000395564 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
UPP1-203ENST00000395564 VAMP4O75379 141 aa23.19■■□□□ 1.3
UPP1-203ENST00000395564 RFC4P35249 363 aa23.19■■□□□ 1.3
UPP1-203ENST00000395564 PDIA6Q15084 440 aa23.19■■□□□ 1.3
UPP1-203ENST00000395564 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.19■■□□□ 1.3
UPP1-203ENST00000395564 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.19■■□□□ 1.3
UPP1-203ENST00000395564 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
UPP1-203ENST00000395564 C4AP0C0L4 1744 aa23.18■■□□□ 1.3
UPP1-203ENST00000395564 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
UPP1-203ENST00000395564 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
UPP1-203ENST00000395564 SMIM5Q71RC9 77 aa23.17■■□□□ 1.3
UPP1-203ENST00000395564 NECTIN2Q92692 538 aa23.17■■□□□ 1.3
UPP1-203ENST00000395564 MSH5O43196 834 aa23.16■■□□□ 1.3
UPP1-203ENST00000395564 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
UPP1-203ENST00000395564 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.16■■□□□ 1.3
UPP1-203ENST00000395564 NARFQ9UHQ1 456 aa23.16■■□□□ 1.3
UPP1-203ENST00000395564 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
UPP1-203ENST00000395564 MYL6BP14649 208 aa23.15■■□□□ 1.3
UPP1-203ENST00000395564 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.15■■□□□ 1.3
UPP1-203ENST00000395564 ZNF428Q96B54 188 aa23.15■■□□□ 1.3
UPP1-203ENST00000395564 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
UPP1-203ENST00000395564 ZPR1O75312 459 aa23.14■■□□□ 1.3
UPP1-203ENST00000395564 MTFR1LQ9H019 292 aa23.14■■□□□ 1.3
UPP1-203ENST00000395564 HYPKQ9NX55 129 aa23.14■■□□□ 1.3
UPP1-203ENST00000395564 RGL2O15211 777 aa23.14■■□□□ 1.29
UPP1-203ENST00000395564 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
UPP1-203ENST00000395564 STK31Q9BXU1 1019 aa23.14■■□□□ 1.29
UPP1-203ENST00000395564 PROSER3Q2NL68 480 aa23.13■■□□□ 1.29
UPP1-203ENST00000395564 ANXA1P04083 346 aa23.11■■□□□ 1.29
UPP1-203ENST00000395564 GYS1P13807 737 aa23.11■■□□□ 1.29
UPP1-203ENST00000395564 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.11■■□□□ 1.29
UPP1-203ENST00000395564 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
UPP1-203ENST00000395564 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa23.11■■□□□ 1.29
UPP1-203ENST00000395564 CACNA1FO60840 1977 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-203ENST00000395564 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-203ENST00000395564 CAMTA2O94983 1202 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-203ENST00000395564 ZBTB7AO95365 584 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-203ENST00000395564 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-203ENST00000395564 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-203ENST00000395564 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-203ENST00000395564 SCN7AQ01118 1682 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-203ENST00000395564 BCORQ6W2J9 1755 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-203ENST00000395564 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-203ENST00000395564 COPS6Q7L5N1 327 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-203ENST00000395564 ARXQ96QS3 562 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-203ENST00000395564 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.08■■□□□ 1.29
UPP1-203ENST00000395564 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.08■■□□□ 1.29
UPP1-203ENST00000395564 SPON1Q9HCB6 807 aa23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.6 ms