RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC27Q2M243 656 aa20.08■□□□□ 0.81
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PGGT1B-202ENST00000379615 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PGGT1B-202ENST00000379615 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PGGT1B-202ENST00000379615 CHL1O00533 1208 aa20.07■□□□□ 0.8
PGGT1B-202ENST00000379615 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PGGT1B-202ENST00000379615 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
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PGGT1B-202ENST00000379615 POLD1P28340 1107 aa20.05■□□□□ 0.8
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PGGT1B-202ENST00000379615 SYT17Q9BSW7 474 aa20.05■□□□□ 0.8
PGGT1B-202ENST00000379615 TJP1Q07157 1748 aa20.05■□□□□ 0.8
PGGT1B-202ENST00000379615 MIER1Q8N108 512 aa20.04■□□□□ 0.8
PGGT1B-202ENST00000379615 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PGGT1B-202ENST00000379615 SGIP1Q9BQI5 828 aa20.04■□□□□ 0.8
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PGGT1B-202ENST00000379615 UBR3Q6ZT12 1888 aa20.04■□□□□ 0.8
PGGT1B-202ENST00000379615 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A087WZG4 1122 aa20.03■□□□□ 0.8
PGGT1B-202ENST00000379615 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
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PGGT1B-202ENST00000379615 WWC1Q8IX03 1113 aa20.03■□□□□ 0.8
PGGT1B-202ENST00000379615 KLHL34Q8N239 644 aa20.03■□□□□ 0.8
PGGT1B-202ENST00000379615 USP16Q9Y5T5 823 aa20.03■□□□□ 0.8
PGGT1B-202ENST00000379615 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.02■□□□□ 0.8
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZPR1O75312 459 aa20.01■□□□□ 0.79
PGGT1B-202ENST00000379615 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
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PGGT1B-202ENST00000379615 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.01■□□□□ 0.79
PGGT1B-202ENST00000379615 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20■□□□□ 0.79
PGGT1B-202ENST00000379615 A1BGP04217 495 aa20■□□□□ 0.79
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF853P0CG23 659 aa20■□□□□ 0.79
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PGGT1B-202ENST00000379615 ARXQ96QS3 562 aa20■□□□□ 0.79
PGGT1B-202ENST00000379615 IL16Q14005 1332 aa20■□□□□ 0.79
PGGT1B-202ENST00000379615 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa19.99■□□□□ 0.79
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PGGT1B-202ENST00000379615 MBIPQ9NS73 344 aa19.98■□□□□ 0.79
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
PGGT1B-202ENST00000379615 COL15A1P39059 1388 aa19.97■□□□□ 0.79
PGGT1B-202ENST00000379615 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa19.97■□□□□ 0.79
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PGGT1B-202ENST00000379615 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
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PGGT1B-202ENST00000379615 DUSP27Q5VZP5 1158 aa19.92■□□□□ 0.78
PGGT1B-202ENST00000379615 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
PGGT1B-202ENST00000379615 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
PGGT1B-202ENST00000379615 NBPF15Q8N660 670 aa19.92■□□□□ 0.78
PGGT1B-202ENST00000379615 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa19.92■□□□□ 0.78
PGGT1B-202ENST00000379615 MMP10P09238 476 aa19.91■□□□□ 0.78
PGGT1B-202ENST00000379615 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
PGGT1B-202ENST00000379615 MYH16Q9H6N6 1097 aa19.91■□□□□ 0.78
PGGT1B-202ENST00000379615 KRT24Q2M2I5 525 aa19.9■□□□□ 0.78
PGGT1B-202ENST00000379615 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa19.9■□□□□ 0.78
PGGT1B-202ENST00000379615 PARP3Q9Y6F1 533 aa19.9■□□□□ 0.78
PGGT1B-202ENST00000379615 LAMB4A4D0S4 1761 aa19.89■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 RGL2O15211 777 aa19.89■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 MYL6BP14649 208 aa19.89■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 GOLGA2Q08379 1002 aa19.89■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 FKBP8Q14318 412 aa19.89■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 GPR162Q16538 588 aa19.89■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 COL24A1Q17RW2 1714 aa19.89■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 NLGN2Q8NFZ4 835 aa19.89■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF652Q9Y2D9 606 aa19.89■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 CLEC4GQ6UXB4 293 aa19.88■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP19.88■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 CHD4Q14839 1912 aa19.87■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 CAMTA2O94983 1202 aa19.87■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 KIF6Q6ZMV9 814 aa19.87■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 NECTIN2Q92692 538 aa19.87■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 C4AP0C0L4 1744 aa19.87■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF521Q96K83 1311 aa19.86■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 TM4SF1P30408 202 aa19.86■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 C8orf58Q8NAV2 365 aa19.86■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 CD2APQ9Y5K6 639 aa19.86■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 FANCIQ9NVI1 1328 aa19.85■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 ERVV-1B6SEH8 477 aa19.85■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 PDIA6Q15084 440 aa19.85■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC30Q5VVM6 783 aa19.85■□□□□ 0.77
PGGT1B-202ENST00000379615 BCL2L12Q9HB09 334 aa19.85■□□□□ 0.77
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