RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267176.8

SBNO1-201, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SBNO1, Length 11,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-201ENST00000267176 UBAC1Q9BSL1 405 aa7.37□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 CPLX3Q8WVH0 158 aa7.37□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 PIBF1Q8WXW3 757 aa7.37□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 IDH1O75874 414 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 SPA17Q15506 151 aa7.37□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC82Q8N4S0 544 aa7.37□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 ATP2B2Q01814 1243 aa7.36□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 TSHZ3Q63HK5 1081 aa7.36□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 TMX3Q96JJ7 454 aa7.36□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa7.36□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 CYB5RLQ6IPT4 315 aa7.36□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa7.36□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa7.36□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 CCT2P78371 535 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 KRT222Q8N1A0 295 aa7.36□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 INCENPQ9NQS7 918 aa7.36□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 NCAPD3P42695 1498 aa7.36□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 WASF1Q92558 559 aa7.36□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 DNA2P51530 1060 aa7.36□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.36□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 ATF3P18847 181 aa7.36□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 NUCB1Q02818 461 aa7.36□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 ANO6Q4KMQ2 910 aa7.36□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 MPHOSPH8Q99549 860 aa7.36□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 CABP4P57796 275 aa7.35□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 UVSSAQ2YD98 709 aa7.35□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa7.35□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 AIDAQ96BJ3 306 aa7.35□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 CEP126Q9P2H0 1117 aa7.35□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 STX1AQ16623 288 aa7.35□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 CTR9Q6PD62 1173 aa7.35□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 TTC22Q5TAA0 569 aa7.35□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa7.35□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 ARFGAP3Q9NP61 516 aa7.35□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 JADE2Q9NQC1 790 aa7.35□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 SPECC1Q5M775 1068 aa7.35□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 USP48Q86UV5 1035 aa7.35□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 LRP2BPQ9P2M1 347 aa7.35□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 GRIN2BQ13224 1484 aa7.35□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 MAPKBP1O60336 1514 aa7.35□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 SOGA3Q5TF21 947 aa7.35□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 FSIP1Q8NA03 581 aa7.34□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 ABCF2Q9UG63 623 aa7.34□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF213O14771 459 aa7.34□□□□□ -1.23
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SBNO1-201ENST00000267176 CCDC141Q6ZP82 1450 aa7.34□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 PTPRCP08575 1304 aa7.34□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 TICAM2Q86XR7 235 aa7.34□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 TAF4BQ92750 862 aa7.34□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 CNPY2Q9Y2B0 182 aa7.34□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 GNG11P61952 73 aa7.34□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 FAM107BQ9H098 131 aa7.34□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa7.34□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 IGSF3O75054 1194 aa7.34□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 LUZP1Q86V48 1076 aa7.34□□□□□ -1.23
SBNO1-201ENST00000267176 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa7.34□□□□□ -1.23
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SBNO1-201ENST00000267176 SKILP12757 684 aa7.34□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 MNAT1P51948 309 aa7.34□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 CAVIN2O95810 425 aa7.33□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 PPFIA3O75145 1194 aa7.33□□□□□ -1.24
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SBNO1-201ENST00000267176 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 ARHGEF11O15085 1522 aa7.33□□□□□ -1.24
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SBNO1-201ENST00000267176 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 MICALCLQ6ZW33 695 aa7.33□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC186Q7Z3E2 898 aa7.33□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 EVI5LQ96CN4 794 aa7.33□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 FAM135AQ9P2D6 1515 aa7.33□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 ABCC11Q96J66 1382 aa7.33□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 IFFO1Q0D2I5 559 aa7.33□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC178Q5BJE1 867 aa7.33□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 FKBP15Q5T1M5 1219 aa7.33□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 DISP3Q9P2K9 1392 aa7.33□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
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