RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 GorabQ8BRM2 368 aa18.38■□□□□ 0.53
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mrps27Q8BK72 415 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ppm1mQ8BU27 406 aa18.37■□□□□ 0.53
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Map3k2Q61083 619 aa18.36■□□□□ 0.53
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Irf9Q61179 399 aa18.36■□□□□ 0.53
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Col22a1E9Q7P1 1613 aa18.36■□□□□ 0.53
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccdc155Q80VJ8 648 aa18.36■□□□□ 0.53
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Exoc6bA6H5Z3 810 aa18.36■□□□□ 0.53
Eftud2-202ENSMUST00000107060 DaxxO35613 739 aa18.35■□□□□ 0.53
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cct4P80315 539 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Brinp3Q499E0 766 aa18.35■□□□□ 0.53
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mum1Q6DID5 682 aa18.35■□□□□ 0.53
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Q9D2X8 372 aa18.35■□□□□ 0.53
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Asic4Q7TNS7 539 aa18.34■□□□□ 0.53
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Abcc4E9Q236 1325 aa18.34■□□□□ 0.53
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cadps2Q8BYR5 1297 aa18.34■□□□□ 0.53
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slx1bQ8BX32 270 aa18.34■□□□□ 0.53
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igfbp6P47880 238 aa18.33■□□□□ 0.53
Eftud2-202ENSMUST00000107060 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa18.33■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Chmp7Q8R1T1 451 aa18.33■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rsph3aQ3UFY4 516 aa18.33■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tgfb1i1Q62219 461 aa18.33■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prune1Q8BIW1 454 aa18.33■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zranb3Q6NZP1 1069 aa18.32■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa18.32■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Unc5clQ6R653 518 aa18.31■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cyp27a1Q9DBG1 533 aa18.31■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ank1Q02357 1862 aa18.31■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zkscan16A2ALW2 728 aa18.31■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hmox1P14901 289 aa18.31■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Plekhd1B2RPU2 505 aa18.3■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rfx1P48377 963 aa18.3■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tceal9Q9DD24 104 aa18.3■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Casz1Q9CWL2 1761 aa18.29■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Bicc1Q99MQ1 977 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Col4a1P02463 1669 aa18.29■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Anapc15P60007 132 aa18.29■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Grm8P47743 908 aa18.28■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Irx6Q9ER75 438 aa18.28■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Bcl2l13P59017 434 aa18.28■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CalcaP70160 136 aa18.28■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Brpf1B2RRD7 1212 aa18.28■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 VgfQ0VGU4 617 aa18.28■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 TefQ9JLC6 301 aa18.28■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nlrp9bQ66X22 1003 aa18.27■□□□□ 0.52
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ms4a2P20490 235 aa18.26■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ssh1Q76I79 1042 aa18.26■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Bcl11aQ9QYE3 773 aa18.26■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam50bQ9WTJ8 334 aa18.26■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 MypnQ5DTJ9 1315 aa18.26■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Map3k13Q1HKZ5 959 aa18.26■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam228bQ497Q6 232 aa18.26■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 ZgpatQ8VDM1 511 aa18.26■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 LlphQ9D945 130 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Casq1O09165 405 aa18.25■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mrc1Q61830 1456 aa18.25■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PigbQ9JJQ0 542 aa18.25■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa18.24■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vwa3bJ9JI28 736 aa18.24■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prkab2Q6PAM0 271 aa18.24■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pard3Q99NH2 1333 aa18.24■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ttll7A4Q9F0 912 aa18.24■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Erbb4Q61527 1308 aa18.24■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa18.23■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trim52Q8CDV4 233 aa18.23■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Taf5lQ91WQ5 589 aa18.23■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zbtb3Q91X45 518 aa18.23■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa18.23■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dmrtc1Q9D9R7 182 aa18.23■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Txnrd1Q9JMH6 613 aa18.23■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa18.23■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ripor2Q80U16 1078 aa18.23■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ints5Q8CHT3 1018 aa18.23■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ric1Q69ZJ7 1422 aa18.23■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Abca3Q8R420 1704 aa18.22■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mcm4P49717 862 aa18.22■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pip4k2bQ80XI4 416 aa18.22■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Efcab2Q9CQ46 164 aa18.21■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cnnm1Q0GA42 951 aa18.21■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 AceP09470 1312 aa18.21■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 AnlnQ8K298 1121 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccdc7Q9D541 371 aa18.21■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rad50P70388 1312 aa18.21■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 InsrrQ9WTL4 1300 aa18.21■□□□□ 0.51
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Akap11E9Q777 1895 aa18.21■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zpr1Q62384 459 aa18.2■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zkscan1Q8BGS3 561 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc5a1Q8C3K6 665 aa18.2■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ankle2Q6P1H6 964 aa18.19■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa18.19■□□□□ 0.5
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Arap2Q8BZ05 1703 aa18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.6 ms