RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000095062.9

Lmbrd1-201, Transcript of Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Lmbrd1, Length 5,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Ints3Q7TPD0 1041 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Ssfa2Q922B9 1252 aa8.34□□□□□ -1.07
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Stard3nlQ9DCI3 235 aa8.34□□□□□ -1.07
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Aplp1Q03157 653 aa8.34□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Tmem87bQ8BKU8 555 aa8.34□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Nfat5Q9WV30 1534 aa8.33□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa8.33□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 MecomP14404 1042 aa8.33□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Rfx1P48377 963 aa8.33□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Rnf20Q5DTM8 973 aa8.33□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Phf23Q8BSN5 401 aa8.33□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Grm8P47743 908 aa8.33□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Bcl2l13P59017 434 aa8.33□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Ppp6r3Q922D4 844 aa8.33□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Brpf1B2RRD7 1212 aa8.33□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Znf692Q3U381 531 aa8.33□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Bend3Q6PAL0 825 aa8.33□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 SympkQ80X82 1284 aa8.33□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Plcd4Q8K3R3 807 aa8.33□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Zap70P43404 618 aa8.32□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Tubb6Q922F4 447 aa8.32□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Bcar3Q9QZK2 820 aa8.32□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Fam50bQ9WTJ8 334 aa8.32□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Mctp2Q5RJH2 878 aa8.32□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Q8C5K5 320 aa8.32□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 LlphQ9D945 130 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa8.32□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Ccdc155Q80VJ8 648 aa8.32□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Arfgef2A2A5R2 1792 aa8.32□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Atp10bB1AWN4 1474 aa8.31□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Pnmal2G3X9N3 661 aa8.31□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Hap1O35668 628 aa8.31□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Iqsec3Q3TES0 1195 aa8.31□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Gnat3Q3V3I2 354 aa8.31□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Strn4P58404 760 aa8.31□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Ddx19aQ61655 478 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Fkbp5Q64378 456 aa8.31□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Psma5Q9Z2U1 241 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Prr29B1ARI9 187 aa8.3□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Pde4dQ01063 747 aa8.3□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Sf3a1Q8K4Z5 791 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Col15a1O35206 1367 aa8.3□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Znf326O88291 580 aa8.3□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Irx3P81067 507 aa8.3□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Top1mtQ8R4U6 593 aa8.3□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 RestQ8VIG1 1082 aa8.3□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa8.3□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Efcab2Q9CQ46 164 aa8.29□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Map3k13Q1HKZ5 959 aa8.29□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa8.29□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Pnpla7A2AJ88 1352 aa8.29□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Flt4P35917 1363 aa8.29□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa8.29□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Catsper2A2ARP9 588 aa8.29□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Ppp4r3aQ6P2K6 820 aa8.29□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Asic4Q7TNS7 539 aa8.29□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Cyp2d12Q8BVD2 504 aa8.29□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Bicc1Q99MQ1 977 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Alpk3Q924C5 1678 aa8.29□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 PtprvP70289 1705 aa8.28□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 AppP12023 770 aa8.28□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Bag3Q9JLV1 577 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Rnf123Q5XPI3 1314 aa8.28□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa8.28□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Ppfia1B2RXQ2 1266 aa8.28□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Ginm1Q91WR6 327 aa8.28□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Brf1Q8CFK2 676 aa8.28□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Chmp3Q9CQ10 224 aa8.28□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa8.28□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa8.27□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Gsdma2Q32M21 443 aa8.27□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Slx1bQ8BX32 270 aa8.27□□□□□ -1.08
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Abcc4E9Q236 1325 aa8.27□□□□□ -1.09
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Phactr2B1AVP0 632 aa8.27□□□□□ -1.09
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Trim44Q9QXA7 346 aa8.27□□□□□ -1.09
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Ssh1Q76I79 1042 aa8.27□□□□□ -1.09
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Jakmip1Q8BVL9 626 aa8.27□□□□□ -1.09
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Wnk3Q80XP9 1757 aa8.27□□□□□ -1.09
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 RgmbQ7TQ33 436 aa8.27□□□□□ -1.09
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Cwc25Q9DBF7 416 aa8.27□□□□□ -1.09
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Slit1Q80TR4 1531 aa8.27□□□□□ -1.09
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Nol8Q3UHX0 1147 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 GpkowQ56A08 488 aa8.26□□□□□ -1.09
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Soga3Q6NZL0 945 aa8.26□□□□□ -1.09
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Slc26a8Q8R0C3 999 aa8.26□□□□□ -1.09
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 AceP09470 1312 aa8.26□□□□□ -1.09
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Jmjd4Q8BFT6 427 aa8.26□□□□□ -1.09
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Siglec1Q62230 1695 aa8.26□□□□□ -1.09
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa8.26□□□□□ -1.09
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 R3hcc1Q8BSI6 488 aa8.26□□□□□ -1.09
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Zbtb3Q91X45 518 aa8.26□□□□□ -1.09
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Q9D9S1 216 aa8.26□□□□□ -1.09
Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 Robo1O89026 1612 aa8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.4 ms