RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031145.6

Pdcl2-201, Transcript of Phosducin-like protein 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdcl2, Length 1,181 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kirrel2Q7TSU7 700 aa11.24□□□□□ -0.61
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Psrc1Q9D0P7 329 aa11.24□□□□□ -0.61
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 LrgukQ9D5S7 820 aa11.24□□□□□ -0.61
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ccdc61Q3UJV1 511 aa11.23□□□□□ -0.61
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Usp40Q8BWR4 1235 aa11.23□□□□□ -0.61
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tmem2Q5FWI3 1383 aa11.23□□□□□ -0.61
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Abcc10Q8R4P9 1501 aa11.23□□□□□ -0.61
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Siglec1Q62230 1695 aa11.23□□□□□ -0.61
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa11.23□□□□□ -0.61
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 DgkhD3YXJ0 1156 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Zfp142G5E869 1843 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 InhbeO08717 350 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Hoxa10P31310 416 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Phf12Q5SPL2 1003 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Nxf1Q99JX7 618 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rgs17Q9QZB0 210 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tex14Q7M6U3 1450 aa11.21□□□□□ -0.61
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Adamts13Q769J6 1426 aa11.21□□□□□ -0.61
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fyb1O35601 819 aa11.21□□□□□ -0.61
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mdm2P23804 489 aa11.21□□□□□ -0.61
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cep120Q7TSG1 988 aa11.21□□□□□ -0.61
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa11.21□□□□□ -0.61
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tll2Q9WVM6 1012 aa11.21□□□□□ -0.61
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa11.21□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 MaddQ80U28 1577 aa11.2□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Wdr17E9Q271 1322 aa11.2□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rbm26Q6NZN0 1012 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Lrch3Q8BVU0 778 aa11.2□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Sugp2Q8CH09 1067 aa11.2□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cts7Q91ZF2 331 aa11.2□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Plekhg1F6S200 1446 aa11.19□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Adamts8P57110 905 aa11.19□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Siah2Q06986 325 aa11.19□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dixdc1Q80Y83 711 aa11.19□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa11.18□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pik3r2O08908 722 aa11.18□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 PtgdrP70263 357 aa11.18□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cdk19Q8BWD8 501 aa11.18□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Slc35g1Q8BY79 368 aa11.18□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mical1Q8VDP3 1048 aa11.18□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fgd1P52734 960 aa11.17□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Atxn7Q8R4I1 867 aa11.17□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gmpr2Q99L27 348 aa11.17□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Abcf1Q6P542 837 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa11.16□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Txnrd1Q9JMH6 613 aa11.16□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Usp32F8VPZ3 1604 aa11.16□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Atp7bQ64446 1462 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Msx1P13297 303 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tigd5Q499M4 642 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Plpp7Q91WB2 271 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fam135bQ9DAI6 1403 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Capn5O08688 640 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Epb42P49222 691 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tbc1d12Q6A039 696 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 PtpruB1AUH1 1446 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Polr3aB2RXC6 1390 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Atp10bB1AWN4 1474 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Irgm2A0A140LIF8 407 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Myo1bP46735 1107 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 HdgfP51859 237 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ccdc102aQ3TMW1 549 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa11.13□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Hsd17b7O88736 334 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rc3h1Q4VGL6 1130 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 ZgpatQ8VDM1 511 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 CenpjQ569L8 1344 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 C5P06684 1680 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 JundP15066 341 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dzip1Q8BMD2 852 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fam174aQ9D3L0 190 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 PaskQ8CEE6 1383 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rasa1E9PYG6 1038 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gigyf2Q6Y7W8 1291 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Trim47Q8C0E3 641 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kif1aP33173 1695 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Als2Q920R0 1651 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm21698A0A087WQP8 267 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm21671G3UY31 267 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gsto1O09131 240 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Card11Q8CIS0 1159 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Adgrg2Q8CJ12 1009 aa11.09□□□□□ -0.63
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Wnk3Q80XP9 1757 aa11.08□□□□□ -0.64
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Camta1A2A891 1682 aa11.08□□□□□ -0.64
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa11.08□□□□□ -0.64
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Atp2b4Q6Q477 1205 aa11.08□□□□□ -0.64
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Zbtb42Q811H0 420 aa11.08□□□□□ -0.64
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Srcin1Q9QWI6 1250 aa11.08□□□□□ -0.64
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ccdc6D3YZP9 469 aa11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.8 ms