RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Usp34Q6ZQ93 3582 aa14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stk31Q99MW1 1018 aa14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kif13bA0A286YCV9 1847 aa14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ppp1r1bQ60829 194 aa14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Col24a1Q30D77 1733 aa14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prr5lA2AVJ5 370 aa14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm12185Q5NCB2 835 aa14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ptf1aQ9QX98 324 aa14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfyve9A2A8R0 1397 aa14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Setdb1O88974 1307 aa14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rbm46P86049 533 aa14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Snai1Q02085 264 aa14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pdzph1Q8BGR1 1238 aa14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ptcd1Q8C2E4 695 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adcy9P51830 1353 aa14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arid3aQ62431 601 aa14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tsen2Q6P7W5 460 aa14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 DaglaQ6WQJ1 1044 aa14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nlrp6Q91WS2 869 aa14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa14.92□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prdm11A2AGX3 565 aa14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Btbd11Q6GQW0 1109 aa14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prkab2Q6PAM0 271 aa14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Unc5clQ6R653 518 aa14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc39a6Q8C145 765 aa14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dpf1Q9QX66 387 aa14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ddx60E9PZQ1 1711 aa14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tspoap1Q7TNF8 1846 aa14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MetP16056 1379 aa14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prim1P20664 417 aa14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bcl2l13P59017 434 aa14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adam1aQ60813 791 aa14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Esco1Q69Z69 843 aa14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp646Q6NV66 1788 aa14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 D830030K20RikE9PYQ5 218 aa14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm3043K7N693 218 aa14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm16440K7N6G6 218 aa14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm2244L7N2A3 218 aa14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm3278L7N2D2 218 aa14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm8271L7N2E2 218 aa14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cnnm1Q0GA42 951 aa14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stk32bQ9JJX8 414 aa14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cyp2c23E9Q5K4 494 aa14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GsdmaQ9EST1 446 aa14.88□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dok7Q18PE0 504 aa14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fhdc1Q3ULZ2 1149 aa14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Usp48Q3V0C5 1052 aa14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slf2Q6P9P0 1278 aa14.87□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Abcc12Q80WJ6 1366 aa14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mylk2Q8VCR8 613 aa14.86□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Myo5bP21271 1818 aa14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Csf1rP09581 977 aa14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dusp27Q148W8 1138 aa14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ifit1bl2Q3U687 466 aa14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ggnbp2Q5SV77 696 aa14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pdia6Q922R8 440 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ambra1A2AH22 1300 aa14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Usp19Q3UJD6 1360 aa14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Col5a2Q3U962 1497 aa14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nkx1-1G3UXB3 402 aa14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q4VA45 678 aa14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dbndd1Q9CZ00 160 aa14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CltaO08585 235 aa14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tnnt1O88346 262 aa14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdca7Q9D0M2 382 aa14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stox1B2RQL2 990 aa14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NpcdF8VQB8 469 aa14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dctn1O08788 1281 aa14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Igfbp6P47880 238 aa14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Iqsec3Q3TES0 1195 aa14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nlgn2Q69ZK9 836 aa14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Micall1Q8BGT6 870 aa14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Glis2Q8VDL9 521 aa14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Iqcf3Q9D498 203 aa14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NgdnQ9DB96 315 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lama4P97927 1816 aa14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr247E9PVJ7 320 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr819K7N727 320 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 VegfbP49766 207 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc51aQ8R000 340 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Plagl1Q9JLQ4 704 aa14.81□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PnnO35691 725 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpr101Q80T62 511 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rasgrp4Q8BTM9 673 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cyp2d12Q8BVD2 504 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SowahdQ8BY98 327 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Flad1Q8R123 492 aa14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc4a9E9PUP3 929 aa14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dcdc2bF7BCK0 340 aa14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Apaf1O88879 1249 aa14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lama2Q60675 3118 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nup188Q6ZQH8 1759 aa14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q7TT23 1179 aa14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.1 ms