RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 VASH2Q86V25 355 aa31.5■■■□□ 2.63
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa31.5■■■□□ 2.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 LAMA5O15230 3695 aa31.5■■■□□ 2.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLEC3AO75596 197 aa31.49■■■□□ 2.63
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4F6Q8NGB9 312 aa31.48■■■□□ 2.63
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CTDNEP1-209ENST00000574205 LCP2Q13094 533 aa31.47■■■□□ 2.63
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF382Q96SR6 550 aa31.47■■■□□ 2.63
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF304Q9HCX3 659 aa31.47■■■□□ 2.63
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RPS15P62841 145 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.63
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FRMD7Q6ZUT3 714 aa31.45■■■□□ 2.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC22A11Q9NSA0 550 aa31.45■■■□□ 2.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1B0GTL3 188 aa31.44■■■□□ 2.62
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