RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541869.5

POLR1B-217, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

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Gene POLR1B, Length 5,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-217ENST00000541869 G6PC3Q9BUM1 346 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 SEC61A2Q9H9S3 476 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 TPRKBQ9Y3C4 175 aa9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 LINC01565O15544 149 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 TNFSF15O95150 251 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 TP53P04637 393 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
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POLR1B-217ENST00000541869 TSPAN19P0C672 248 aa9.95□□□□□ -0.82
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POLR1B-217ENST00000541869 KIR2DS3Q14952 304 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 GPR68Q15743 365 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM201Q5SNT2 666 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 SLC30A6Q6NXT4 461 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 GALNT12Q8IXK2 581 aa9.95□□□□□ -0.82
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POLR1B-217ENST00000541869 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 PRSS38A1L453 326 aa9.95□□□□□ -0.82
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POLR1B-217ENST00000541869 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
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POLR1B-217ENST00000541869 C3orf18Q9UK00 162 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
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POLR1B-217ENST00000541869 CCDC187A0A096LP49 1063 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 SCO2O43819 266 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
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POLR1B-217ENST00000541869 PIK3CBP42338 1070 aa9.95□□□□□ -0.82
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POLR1B-217ENST00000541869 TMEM154Q6P9G4 183 aa9.95□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa9.95□□□□□ -0.82
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POLR1B-217ENST00000541869 IFI44Q8TCB0 444 aa9.94□□□□□ -0.82
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POLR1B-217ENST00000541869 SERHL2Q9H4I8 314 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 MAU2Q9Y6X3 613 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 MYO7AQ13402 2215 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 EDN1P05305 212 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 ACADLP28330 430 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 SLC6A4P31645 630 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 HSD17B7P56937 341 aa9.94□□□□□ -0.82
POLR1B-217ENST00000541869 CTBSQ01459 385 aa9.94□□□□□ -0.82
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