RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 P2RY12Q9H244 342 aa4.49□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 CPVLQ9H3G5 476 aa4.49□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 TLE6Q9H808 572 aa4.49□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 LMAN1LQ9HAT1 526 aa4.49□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 SDF2L1Q9HCN8 221 aa4.49□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 SIX2Q9NPC8 291 aa4.49□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 CHST11Q9NPF2 352 aa4.49□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 NGBQ9NPG2 151 aa4.49□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
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CCL20-204ENST00000489160 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
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CCL20-204ENST00000489160 PMS2P5A8MQ11 134 aa4.48□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa4.48□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 TEX28O15482 410 aa4.48□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 RIPK2O43353 540 aa4.48□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 ATP9AO75110 1047 aa4.48□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 ATP6V1G1O75348 118 aa4.48□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 GLCEO94923 617 aa4.48□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 TGFAP01135 160 aa4.48□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 C9P02748 559 aa4.48□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 CPA3P15088 417 aa4.48□□□□□ -1.69
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CCL20-204ENST00000489160 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
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CCL20-204ENST00000489160 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa4.48□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 AFTPHQ6ULP2 937 aa4.48□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 ELMOD2Q8IZ81 293 aa4.48□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 KIAA0895Q8NCT3 520 aa4.48□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa4.48□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 THRSPQ92748 146 aa4.48□□□□□ -1.69
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CCL20-204ENST00000489160 SGF29Q96ES7 293 aa4.48□□□□□ -1.69
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CCL20-204ENST00000489160 CARD6Q9BX69 1037 aa4.48□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 NT5C3AQ9H0P0 336 aa4.48□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 RAB17Q9H0T7 212 aa4.48□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 NAPBQ9H115 298 aa4.48□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 RIBC2Q9H4K1 309 aa4.48□□□□□ -1.69
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CCL20-204ENST00000489160 TMOD2Q9NZR1 351 aa4.48□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 ANKMY1Q9P2S6 941 aa4.48□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 TSPAN16Q9UKR8 245 aa4.48□□□□□ -1.69
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CCL20-204ENST00000489160 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa4.48□□□□□ -1.69
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CCL20-204ENST00000489160 ZNF197O14709 1029 aa4.47□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 NME6O75414 186 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
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CCL20-204ENST00000489160 NGFP01138 241 aa4.47□□□□□ -1.69
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CCL20-204ENST00000489160 PRG2P13727 222 aa4.47□□□□□ -1.69
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CCL20-204ENST00000489160 RAET1GQ6H3X3 334 aa4.47□□□□□ -1.69
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CCL20-204ENST00000489160 CYB5D1Q6P9G0 228 aa4.47□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 PODNL1Q6PEZ8 512 aa4.47□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 NHLRC1Q6VVB1 395 aa4.47□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 SH2D5Q6ZV89 423 aa4.47□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 SLC16A9Q7RTY1 509 aa4.47□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 PIGZQ86VD9 579 aa4.47□□□□□ -1.69
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CCL20-204ENST00000489160 CLEC1AQ8NC01 280 aa4.47□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 OR13C3Q8NGS6 347 aa4.47□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 TMEM186Q96B77 213 aa4.47□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 GIMAP5Q96F15 307 aa4.47□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 PANX3Q96QZ0 392 aa4.47□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 MAP3K3Q99759 626 aa4.47□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 FAM213AQ9BRX8 229 aa4.47□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 PITPNM3Q9BZ71 974 aa4.47□□□□□ -1.69
CCL20-204ENST00000489160 CUEDC2Q9H467 287 aa4.47□□□□□ -1.69
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