RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484375.5

ARPC1B-218, Transcript of actin related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

TSL 3

Gene ARPC1B, Length 785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1B-218ENST00000484375 RAB40ALP0C0E4 278 aa21.49■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 TCN2P20062 427 aa21.49■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 CD22P20273 847 aa21.49■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 DLSTP36957 453 aa21.49■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 RPS15P62841 145 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 LCP2Q13094 533 aa21.49■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 TGIF1Q15583 401 aa21.49■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa21.49■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 UNC50Q53HI1 259 aa21.49■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa21.49■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 FKBP10Q96AY3 582 aa21.49■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 ANKHQ9HCJ1 492 aa21.49■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 ZBTB26Q9HCK0 441 aa21.49■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 PRM3Q9NNZ6 103 aa21.49■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 CROTQ9UKG9 612 aa21.49■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 SSUH2Q9Y2M2 353 aa21.49■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 A0A088AWK7 358 aa21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 UQCRHLA0A096LP55 91 aa21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 H0YIG0 161 aa21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 TAF4O00268 1085 aa21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 TRIM13O60858 407 aa21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 UQCRHP07919 91 aa21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 PIK3CBP42338 1070 aa21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 PKNOX1P55347 436 aa21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 CYP4F2P78329 520 aa21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 DNASE1L3Q13609 305 aa21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 PCLAFQ15004 111 aa21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 AGBL2Q5U5Z8 902 aa21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 C1orf189Q5VU69 101 aa21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 MILR1Q7Z6M3 343 aa21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 OR52B6Q8NGF0 335 aa21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 CT55Q8WUE5 264 aa21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 CCT6BQ92526 530 aa21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 ZNF382Q96SR6 550 aa21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 SLC6A16Q9GZN6 736 aa21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 CHST8Q9H2A9 424 aa21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 ZNF304Q9HCX3 659 aa21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 SLC17A7Q9P2U7 560 aa21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 TRPS1Q9UHF7 1281 aa21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa21.48■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa21.47■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 NSA2O95478 260 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 ALBP02768 609 aa21.47■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 TMPRSS3P57727 454 aa21.47■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 TLE3Q04726 772 aa21.47■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 TGM3Q08188 693 aa21.47■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 TRAF3Q13114 568 aa21.47■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 ARHGAP40Q5TG30 622 aa21.47■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 CCNYL1Q8N7R7 359 aa21.47■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 KCT2Q8NC54 265 aa21.47■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 OR7G3Q8NG95 312 aa21.47■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 TRPC4APQ8TEL6 797 aa21.47■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 CREB3L4Q8TEY5 395 aa21.47■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 GAL3ST3Q96A11 431 aa21.47■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 CENPKQ9BS16 269 aa21.47■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 TRMOQ9BU70 441 aa21.47■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 FER1L5A0AVI2 2057 aa21.47■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 PCNAP12004 261 aa21.46■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 LIFP15018 202 aa21.46■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 CREB1P16220 341 aa21.46■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 FBLP22087 321 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 NAGLUP54802 743 aa21.46■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 CDH13P55290 713 aa21.46■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 MC1RQ01726 317 aa21.46■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 DSG2Q14126 1118 aa21.46■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 NCF4Q15080 339 aa21.46■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 FRMD7Q6ZUT3 714 aa21.46■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 C10orf107Q8IVU9 208 aa21.46■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 OR4F6Q8NGB9 312 aa21.46■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 COL26A1Q96A83 441 aa21.46■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 RNF31Q96EP0 1072 aa21.46■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 WDR54Q9H977 334 aa21.46■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 KCNK9Q9NPC2 374 aa21.46■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 SNX6Q9UNH7 406 aa21.46■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 URB1O60287 2271 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
ARPC1B-218ENST00000484375 AGPSO00116 658 aa21.45■■□□□ 1.02
ARPC1B-218ENST00000484375 ENO1P06733 434 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
ARPC1B-218ENST00000484375 ALOX12P18054 663 aa21.45■■□□□ 1.02
ARPC1B-218ENST00000484375 PTPN4P29074 926 aa21.45■■□□□ 1.02
ARPC1B-218ENST00000484375 SERPINB5P36952 375 aa21.45■■□□□ 1.02
ARPC1B-218ENST00000484375 ETV4P43268 484 aa21.45■■□□□ 1.02
ARPC1B-218ENST00000484375 SLC18A1P54219 525 aa21.45■■□□□ 1.02
ARPC1B-218ENST00000484375 IFT88Q13099 833 aa21.45■■□□□ 1.02
ARPC1B-218ENST00000484375 ST3GAL2Q16842 350 aa21.45■■□□□ 1.02
ARPC1B-218ENST00000484375 TMEM35AQ53FP2 167 aa21.45■■□□□ 1.02
ARPC1B-218ENST00000484375 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa21.45■■□□□ 1.02
ARPC1B-218ENST00000484375 TRIM40Q6P9F5 258 aa21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms