RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243103.3

HOXC12-201, Transcript of homeobox C12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC12, Length 3,335 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12-201ENST00000243103 MAP2K3P46734 347 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 CLCN5P51795 746 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 SAXO2Q658L1 398 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 STAG3L4Q8TBR4 150 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 PANX1Q96RD7 426 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 IPPKQ9H8X2 491 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 SP110Q9HB58 689 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 TMEM184CQ9NVA4 438 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 C1orf109Q9NX04 203 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 RFXANKO14593 260 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 MYL12BO14950 172 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 MYL12AP19105 171 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 ARHGEF7Q14155 803 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 PKDCCQ504Y2 493 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 TIGD5Q53EQ6 642 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 LRRC73Q5JTD7 316 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 LCN1P1Q5VSP4 162 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 LINGO4Q6UY18 593 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 HDDC2Q7Z4H3 204 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 SNX20Q7Z614 316 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 ZFAND4Q86XD8 727 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 APOLD1Q96LR9 279 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 PRKD2Q9BZL6 878 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 CHD5Q8TDI0 1954 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 RAB19A4D1S5 217 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 PAGE1O75459 146 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 SIX6O95475 246 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 CBR1P16152 277 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 OR1G1P47890 313 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 KIAA1024LP59773 190 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 SLC39A12Q504Y0 691 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 ALKAL2Q6UX46 152 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 BBS7Q8IWZ6 715 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 OR56A4Q8NGH8 313 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 C2CD4CQ8TF44 421 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 UQCC2Q9BRT2 126 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 DUSP16Q9BY84 665 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 SGTAO43765 313 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 B4GALT3O60512 393 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 HPGDSO60760 199 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 CFDP00746 253 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 MSL3P1P0C860 447 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 NAGAP17050 411 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 ALAS2P22557 587 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 RAD51Q06609 339 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 HYAL2Q12891 473 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 DOC2BQ14184 412 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 ZFP82Q8N141 532 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 MRGPRX2Q96LB1 330 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 COPS8Q99627 209 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 ZNF556Q9HAH1 456 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 TRHDEQ9UKU6 1024 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 S1PR4O95977 384 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 CAPZA2P47755 286 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 RORCP51449 518 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 KANK2Q63ZY3 851 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 LRRTM3Q86VH5 581 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 PSMG2Q969U7 264 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 ZFP3Q96NJ6 502 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 SLC9A7Q96T83 725 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 TRMOQ9BU70 441 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 TMEM245Q9H330 911 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 NUDT15Q9NV35 164 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 ING4Q9UNL4 249 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 CMAHPQ9Y471 501 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 RPS12P25398 132 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 SRP9P49458 86 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 GEMP55040 296 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 ZNF484Q5JVG2 852 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 GPR142Q7Z601 462 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 LUZP2Q86TE4 346 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms