RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mrm1Q99J25 320 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cstf1Q99LC2 431 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mcm8Q9CWV1 833 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 HhatlQ9D1G3 503 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 B020011L13RikA0A087WQI7 412 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Itga8A2ARA8 1062 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 AU018091E9PWS4 684 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sbk2P0C5K1 362 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hoxb9P20615 250 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 BrafP28028 804 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Grik2P39087 908 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pld2P97813 933 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tfb2mQ3TL26 396 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q3USZ8 430 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hspa1aQ61696 641 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 HjurpQ6PG16 667 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cd99l2Q8BIF0 237 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cpsf4Q8BQZ5 211 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pp2d1Q8BVT6 620 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sall4Q8BX22 1067 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cadm4Q8R464 388 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Osgin1Q8VC10 478 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Noxo1Q8VCM2 349 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hspa14Q99M31 509 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prl7c1Q9CRB5 251 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fads3Q9JJE7 449 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ice1E9Q286 2241 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pcsk5Q04592 1877 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf143O70230 638 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mtnd5P03921 607 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ythdf1P59326 559 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 HnrnpkP61979 463 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dab1P97318 588 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kcna7Q17ST2 489 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem248Q3TBN1 314 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kcnk6Q3TBV4 313 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem38aQ3TMP8 298 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ffar3Q3UFD7 319 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dtx3lQ3UIR3 748 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Timm8a2Q4FZG7 97 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trpc1Q61056 793 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Foxs1Q61574 329 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dcaf13Q6PAC3 445 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Il20raQ6PHB0 546 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rps9Q6ZWN5 194 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mief1Q8BGV8 463 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Asrgl1Q8C0M9 326 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q8C3I9 435 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fbxl3Q8C4V4 428 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sidt2Q8CIF6 832 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r219Q8R271 312 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fitm1Q91V79 292 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc52a3Q9D6X5 460 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tnfsf13Q9D777 241 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Echdc3Q9D7J9 300 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 MecrQ9DCS3 373 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 ScelQ9EQG3 652 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Spag4Q9JJF2 443 aa11.3□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ndor1A2AI05 598 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr738L7N1X7 311 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Angpt1O08538 498 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Agpat1O35083 285 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Srsf5O35326 269 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rem1O35929 297 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 AladP10518 330 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ntrk2P15209 821 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Yipf3Q3UDR8 347 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hdgfl2Q3UMU9 669 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Itga2Q62469 1178 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rmnd5aQ80YQ8 391 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 GalpQ810H5 117 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 C1rbQ8CFG9 706 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 B3gnt7Q8K0J2 397 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Polr1eQ8K202 482 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r84Q8R284 318 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Chchd4Q8VEA4 139 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr801Q8VEU1 318 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr352Q8VGJ9 315 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr666Q8VH00 318 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc8b1Q925Q3 585 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prpf19Q99KP6 504 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 PigkQ9CXY9 395 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 C1qtnf2Q9D8U4 294 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 TectaO08523 2155 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plxna2P70207 1894 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rtn2O70622 471 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Htr3aP23979 487 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Oprd1P32300 372 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gfi1P70338 423 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cuzd1P70412 606 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fmo5P97872 533 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gsk3aQ2NL51 490 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nol9Q3TZX8 714 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrrc58Q3UGP9 366 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zmiz1Q6P1E1 1072 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dennd5aQ6PAL8 1287 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Thoc5Q8BKT7 683 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfpm2Q8CCH7 1151 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Spin4Q8K1L2 249 aa11.29□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pcdhb20Q91XZ9 799 aa11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.2 ms