Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF0

Cd99l2, CD99 antigen-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd99l2Q8BIF0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Cd99l2Q8BIF0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cd99l2Q8BIF0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cd99l2Q8BIF0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cd99l2Q8BIF0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cd99l2Q8BIF0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cd99l2Q8BIF0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Cd99l2Q8BIF0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Cd99l2Q8BIF0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Cd99l2Q8BIF0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Cd99l2Q8BIF0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Cd99l2Q8BIF0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cd99l2Q8BIF0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Cd99l2Q8BIF0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Cd99l2Q8BIF0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cd99l2Q8BIF0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cd99l2Q8BIF0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Cd99l2Q8BIF0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Cd99l2Q8BIF0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cd99l2Q8BIF0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cd99l2Q8BIF0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cd99l2Q8BIF0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cd99l2Q8BIF0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cd99l2Q8BIF0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Cd99l2Q8BIF0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cd99l2Q8BIF0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cd99l2Q8BIF0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cd99l2Q8BIF0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cd99l2Q8BIF0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cd99l2Q8BIF0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cd99l2Q8BIF0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cd99l2Q8BIF0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cd99l2Q8BIF0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Cd99l2Q8BIF0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cd99l2Q8BIF0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cd99l2Q8BIF0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cd99l2Q8BIF0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cd99l2Q8BIF0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cd99l2Q8BIF0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cd99l2Q8BIF0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cd99l2Q8BIF0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cd99l2Q8BIF0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cd99l2Q8BIF0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cd99l2Q8BIF0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cd99l2Q8BIF0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cd99l2Q8BIF0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cd99l2Q8BIF0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cd99l2Q8BIF0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Cd99l2Q8BIF0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cd99l2Q8BIF0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cd99l2Q8BIF0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cd99l2Q8BIF0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cd99l2Q8BIF0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cd99l2Q8BIF0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cd99l2Q8BIF0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cd99l2Q8BIF0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cd99l2Q8BIF0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cd99l2Q8BIF0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cd99l2Q8BIF0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cd99l2Q8BIF0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Cd99l2Q8BIF0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cd99l2Q8BIF0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cd99l2Q8BIF0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cd99l2Q8BIF0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cd99l2Q8BIF0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cd99l2Q8BIF0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cd99l2Q8BIF0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Cd99l2Q8BIF0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cd99l2Q8BIF0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cd99l2Q8BIF0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cd99l2Q8BIF0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cd99l2Q8BIF0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cd99l2Q8BIF0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cd99l2Q8BIF0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cd99l2Q8BIF0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cd99l2Q8BIF0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cd99l2Q8BIF0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cd99l2Q8BIF0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cd99l2Q8BIF0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cd99l2Q8BIF0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cd99l2Q8BIF0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cd99l2Q8BIF0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cd99l2Q8BIF0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cd99l2Q8BIF0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cd99l2Q8BIF0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cd99l2Q8BIF0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cd99l2Q8BIF0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cd99l2Q8BIF0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Cd99l2Q8BIF0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cd99l2Q8BIF0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cd99l2Q8BIF0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cd99l2Q8BIF0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cd99l2Q8BIF0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cd99l2Q8BIF0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cd99l2Q8BIF0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cd99l2Q8BIF0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cd99l2Q8BIF0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cd99l2Q8BIF0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cd99l2Q8BIF0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cd99l2Q8BIF0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms