Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJE7

Fads3, Fatty acid desaturase 3, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fads3Q9JJE7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
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Fads3Q9JJE7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Fads3Q9JJE7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Fads3Q9JJE7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Fads3Q9JJE7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Fads3Q9JJE7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Fads3Q9JJE7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Fads3Q9JJE7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Fads3Q9JJE7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Fads3Q9JJE7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Fads3Q9JJE7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Fads3Q9JJE7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fads3Q9JJE7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fads3Q9JJE7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fads3Q9JJE7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fads3Q9JJE7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Fads3Q9JJE7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Fads3Q9JJE7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
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Fads3Q9JJE7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fads3Q9JJE7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fads3Q9JJE7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fads3Q9JJE7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fads3Q9JJE7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fads3Q9JJE7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Fads3Q9JJE7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fads3Q9JJE7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fads3Q9JJE7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fads3Q9JJE7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fads3Q9JJE7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fads3Q9JJE7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fads3Q9JJE7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fads3Q9JJE7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Fads3Q9JJE7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fads3Q9JJE7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fads3Q9JJE7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Fads3Q9JJE7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fads3Q9JJE7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fads3Q9JJE7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fads3Q9JJE7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fads3Q9JJE7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
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Fads3Q9JJE7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fads3Q9JJE7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fads3Q9JJE7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
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Fads3Q9JJE7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
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Fads3Q9JJE7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fads3Q9JJE7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
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Fads3Q9JJE7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Fads3Q9JJE7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Fads3Q9JJE7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
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Fads3Q9JJE7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fads3Q9JJE7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fads3Q9JJE7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
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Fads3Q9JJE7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
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Fads3Q9JJE7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
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Fads3Q9JJE7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fads3Q9JJE7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fads3Q9JJE7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fads3Q9JJE7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fads3Q9JJE7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
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Fads3Q9JJE7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fads3Q9JJE7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fads3Q9JJE7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fads3Q9JJE7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fads3Q9JJE7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fads3Q9JJE7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fads3Q9JJE7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fads3Q9JJE7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fads3Q9JJE7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Fads3Q9JJE7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fads3Q9JJE7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fads3Q9JJE7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fads3Q9JJE7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fads3Q9JJE7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fads3Q9JJE7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fads3Q9JJE7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fads3Q9JJE7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fads3Q9JJE7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fads3Q9JJE7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
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