RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562553.5

CCNDBP1-203, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 736 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-203ENST00000562553 SLC25A18Q9H1K4 315 aa14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 EPB41L4BQ9H329 900 aa14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 WDR54Q9H977 334 aa14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 NUDT4Q9NZJ9 180 aa14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 TUBD1Q9UJT1 453 aa14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 DOCK10Q96BY6 2186 aa14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 SUPT3HB4E1H0 165 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 K7EM74 188 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 RIPK2O43353 540 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 PRAMEF4O60810 478 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 SUPT3HO75486 399 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 NR1D1P20393 614 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 GCAP28676 217 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 TYK2P29597 1187 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 SLC26A3P40879 764 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 MSH2P43246 934 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 MAGEA12P43365 314 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 SCTRP47872 440 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 CDC16Q13042 620 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 DSG2Q14126 1118 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 FAM53BQ14153 422 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 NDUFA9Q16795 377 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 VWA2Q5GFL6 755 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 TCAIMQ8N3R3 496 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 ANKRD53Q8N9V6 530 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 ISL2Q96A47 359 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 GPR78Q96P69 363 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 MESP1Q9BRJ9 268 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 VPS11Q9H270 941 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 ACSS2Q9NR19 701 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 DNAJC11Q9NVH1 559 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 TRPC4Q9UBN4 977 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 CDC14AQ9UNH5 594 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 IKBKGQ9Y6K9 419 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 TRIM49D1C9J1S8 452 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 NDUFS4O43181 175 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 SLC28A2O43868 658 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 STK16O75716 305 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 IPO13O94829 963 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 PDGFAP04085 211 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 S100BP04271 92 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 SERPIND1P05546 499 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 ZGLP1P0C6A0 271 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 SLC35G6P0C7Q6 338 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 MTHFD2P13995 350 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 AGTR2P50052 363 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 SERPINB9P50453 376 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 CCL11P51671 97 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 KLC1Q07866 573 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 FAM83EQ2M2I3 478 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 CCDC91Q7Z6B0 441 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 LAPTM4BQ86VI4 370 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 PDSS2Q86YH6 399 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 SNX31Q8N9S9 440 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 MIEF2Q96C03 454 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 AIF1LQ9BQI0 150 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 CRB3Q9BUF7 120 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 YIPF2Q9BWQ6 316 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 ZNF358Q9NW07 568 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 P4HTMQ9NXG6 502 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 ZFP69BQ9UJL9 534 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 ZNF180Q9UJW8 692 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-203ENST00000562553 MKRN2OSH3BPM6 223 aa14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1-203ENST00000562553 SGK494L7N484 410 aa14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1-203ENST00000562553 SOCS6O14544 535 aa14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1-203ENST00000562553 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1-203ENST00000562553 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1-203ENST00000562553 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1-203ENST00000562553 ALOX12BO75342 701 aa14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1-203ENST00000562553 KRT38O76015 456 aa14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1-203ENST00000562553 KLHL2O95198 593 aa14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1-203ENST00000562553 NSA2O95478 260 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1-203ENST00000562553 B3GALT4O96024 378 aa14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1-203ENST00000562553 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1-203ENST00000562553 GNAZP19086 355 aa14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1-203ENST00000562553 EPORP19235 508 aa14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1-203ENST00000562553 MMP11P24347 488 aa14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1-203ENST00000562553 AVPR1BP47901 424 aa14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1-203ENST00000562553 EFNA3P52797 238 aa14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1-203ENST00000562553 OCA2Q04671 838 aa14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1-203ENST00000562553 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1-203ENST00000562553 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1-203ENST00000562553 ATG9BQ674R7 924 aa14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1-203ENST00000562553 TAOK1Q7L7X3 1001 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms