RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402934.5

LTBP1-201, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene LTBP1, Length 4,948 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP1-201ENST00000402934 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 FUT10Q6P4F1 479 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 ARSKQ6UWY0 536 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 CCDC28AQ8IWP9 274 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 TMEM80Q96HE8 168 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 TBX5Q99593 518 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 LRRN3Q9H3W5 708 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 AKTIPQ9H8T0 292 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 RNF121Q9H920 327 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 Q9N2J8 555 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 NLGN3Q9NZ94 848 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 FAM170BA6NMN3 283 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 BPNT1O95861 308 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 CSN2P05814 226 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 IL3P08700 152 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 HTR2AP28223 471 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 RBMXP38159 391 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 PGDP52209 483 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 GNG2P59768 71 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 CHAF1BQ13112 559 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 NOGQ13253 232 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 SEMA3AQ14563 771 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 SGCBQ16585 318 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 FAM46DQ8NEK8 389 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 OSTF1Q92882 214 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 PCED1BQ96HM7 432 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 EBF4Q9BQW3 602 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 ASPNQ9BXN1 380 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 ACTR6Q9GZN1 396 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 OR10A4Q9H209 315 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 HSD3B7Q9H2F3 369 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 ACSS2Q9NR19 701 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 ENAMQ9NRM1 1142 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 PADI3Q9ULW8 664 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 ARL5CA6NH57 179 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 B8ZZF3 427 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 FLRT2O43155 660 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 RP2O75695 350 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 MT-ND2P03891 347 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 GJB1P08034 283 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 CD48P09326 243 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 BCKDHAP12694 445 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 SLC6A6P31641 620 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 GRIA2P42262 883 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 CLCN2P51788 898 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 FBXO48Q5FWF7 155 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 SPIN3Q5JUX0 258 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 PAQR3Q6TCH7 311 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 ZNF366Q8N895 744 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 RBP7Q96R05 134 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 PHB2Q99623 299 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 TM9SF2Q99805 663 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 OSBPL2Q9H1P3 480 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 SMURF1Q9HCE7 757 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 CRTAC1Q9NQ79 661 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 IFT52Q9Y366 437 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 CMAHPQ9Y471 501 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 CPQQ9Y646 472 aa8.3□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 C4AP0C0L4 1744 aa8.29□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 A0A1B0GVI7 797 aa8.29□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 CCL22O00626 93 aa8.29□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 TREHO43280 583 aa8.29□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 EOMESO95936 686 aa8.29□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 PLGP00747 810 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 MMP3P08254 477 aa8.29□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 ITGA5P08648 1049 aa8.29□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 HTR1AP08908 422 aa8.29□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 GKN3PP0CG01 181 aa8.29□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 S100PP25815 95 aa8.29□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 KCNC4Q03721 635 aa8.29□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 DNASE1L3Q13609 305 aa8.29□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa8.29□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 PLPP4Q5VZY2 271 aa8.29□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 VITQ6UXI7 678 aa8.29□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 HFE2Q6ZVN8 426 aa8.29□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 TMED4Q7Z7H5 227 aa8.29□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 NAT8LQ8N9F0 302 aa8.29□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 PLA2G15Q8NCC3 412 aa8.29□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 DENND1AQ8TEH3 1009 aa8.29□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 ZUFSPQ96AP4 578 aa8.29□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 SLC25A36Q96CQ1 311 aa8.29□□□□□ -1.08
LTBP1-201ENST00000402934 KCNC2Q96PR1 638 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms