RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.31□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 DHDDSQ86SQ9 333 aa6.31□□□□□ -1.4
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CNIH1-201ENST00000216416 LILRA2Q8N149 483 aa6.31□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 WDR20Q8TBZ3 569 aa6.31□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 FIG4Q92562 907 aa6.31□□□□□ -1.4
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CNIH1-201ENST00000216416 COL26A1Q96A83 441 aa6.31□□□□□ -1.4
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CNIH1-201ENST00000216416 MSRB3Q8IXL7 192 aa6.31□□□□□ -1.4
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CNIH1-201ENST00000216416 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
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CNIH1-201ENST00000216416 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.31□□□□□ -1.4
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CNIH1-201ENST00000216416 ME2P23368 584 aa6.3□□□□□ -1.4
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CNIH1-201ENST00000216416 LIPEQ05469 1076 aa6.3□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
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CNIH1-201ENST00000216416 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.3□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 IGF2RP11717 2491 aa6.3□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 ANKDD1BA6NHY2 528 aa6.3□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 PLPP1O14494 284 aa6.3□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 KELP23276 732 aa6.3□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 GSK3BP49841 420 aa6.3□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 VASPP50552 380 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 C2orf80Q0P641 193 aa6.3□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 ERV3-1Q14264 604 aa6.3□□□□□ -1.4
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CNIH1-201ENST00000216416 FBXO43Q4G163 708 aa6.3□□□□□ -1.4
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CNIH1-201ENST00000216416 HS3ST5Q8IZT8 346 aa6.3□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 GJD3Q8N144 294 aa6.3□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 OR5T3Q8NGG3 340 aa6.3□□□□□ -1.4
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CNIH1-201ENST00000216416 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 TMPRSS11DO60235 418 aa6.3□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 CLIC3O95833 236 aa6.3□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 VIPP01282 170 aa6.3□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 IL3P08700 152 aa6.3□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 AKT2P31751 481 aa6.3□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 YAP1P46937 504 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 RAB28P51157 221 aa6.3□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 GFERP55789 205 aa6.3□□□□□ -1.4
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