RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 AlplP09242 524 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mbl1P39039 239 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gli1P47806 1111 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rack1P68040 317 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 IgfalsP70389 603 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 DcstampQ7TNJ0 470 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adamtsl2Q7TSK7 957 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pi15Q8BS03 258 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Camk2gQ923T9 529 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ssr2Q9CPW5 183 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 CygbQ9CX80 190 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hapln2Q9ESM3 341 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Alms1Q8K4E0 3251 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ssxa1B1AUS7 101 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr652B9EHE6 318 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm20403G3UYB0 123 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 NelfeP19426 375 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Htr5bP31387 370 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ceacam1P31809 521 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc1a5P51912 553 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyp2j13Q3UNV4 503 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdk15Q3V3A1 433 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Clec18aQ7TSQ1 534 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf423Q80TS5 1292 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Creg2Q8BGC9 288 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zcchc9Q8R1J3 271 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1391Q8VFA4 311 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Klhdc8aQ91XA8 350 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ceacam2Q925P2 520 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wdr45bQ9CR39 344 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bud23Q9CY21 281 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Marveld3Q9D956 376 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cmpk1Q9DBP5 196 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pop7Q9DCH2 140 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 St6galnac1Q9QZ39 526 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm29776A0A286YEC0 699 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pgbd5D3YZI9 523 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp938E9Q9G3 579 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hk2O08528 917 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Grpel2O88396 224 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sh3pxd2aO89032 1124 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ruvbl1P60122 456 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 AbatP61922 500 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 ElocP83940 112 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc30a10Q3UVU3 470 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 UnklQ5FWH2 727 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Megf11Q80T91 1091 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rbbp8Q80YR6 893 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Snapc1Q8K0S9 389 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ankrd61Q9CQM6 421 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Haus5Q9D786 619 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wdr53Q9DB94 358 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dmrt1Q9QZ59 374 aa11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 VapaQ9WV55 249 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc25a54B1AUS6 473 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r97K7N6Z2 861 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r93L7N1Z9 857 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 PamP97467 979 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q3U7U4 132 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ube2zQ3UE37 356 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eif2s1Q6ZWX6 315 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam83eQ80XS7 481 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Amigo1Q80ZD8 492 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfand1Q8BFR6 268 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rcor1Q8CFE3 480 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Utp6Q8VCY6 597 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prps2Q9CS42 318 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 MINDY3Q9CV28 444 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm20547B8JJN0 1276 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r102L7N279 857 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 H2-Q1O19441 368 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 CfbP04186 761 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 GsnP13020 780 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Aqp1Q02013 269 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Glycam1Q02596 151 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arntl2Q2VPD4 579 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Xlr3cQ61806 226 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr813Q7TRH5 310 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Banf2Q8BVR0 90 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pomgnt2Q8BW41 605 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tprg1Q8CB49 279 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 DolkQ8R2Y3 534 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 McatQ8R3F5 381 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Diras1Q91Z61 198 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Frmd4bQ920B0 1035 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pdk3Q922H2 415 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cstf3Q99LI7 717 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gemin6Q9CX53 166 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wars2Q9CYK1 360 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pnp2Q9D8C9 305 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rsph9Q9D9V4 276 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tm9sf3Q9ET30 587 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfc3h1B2RT41 1992 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Golga4Q91VW5 2238 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hoxa2P31245 372 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ptpn21Q62136 1176 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 CishQ62225 257 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 DgkbQ6NS52 802 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bpifb2Q8C1E1 462 aa11.31□□□□□ -0.6
Herc3-201ENSMUST00000031823 EtfdhQ921G7 616 aa11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.9 ms