RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551592.5

SENP1-208, Transcript of SUMO specific peptidase 1, human

TSL 3

Gene SENP1, Length 866 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SENP1-208	ENST00000551592	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	NAPB	Q9H115	298 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	TMEM245	Q9H330	911 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	CHST11	Q9NPF2	352 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	RIPK3	Q9Y572	518 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	TLR4	O00206	839 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	SLC22A2	O15244	555 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	TSHB	P01222	138 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	ALPL	P05186	524 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	MMP10	P09238	476 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	GOT1	P17174	413 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	ALDH4A1	P30038	563 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	SFTPD	P35247	375 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	GPC3	P51654	580 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	ART1	P52961	327 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	EVC	P57679	992 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	FKBP1B	P68106	108 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	OPCML	Q14982	345 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	ACKR1	Q16570	336 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	PIK3R3	Q92569	461 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	GGH	Q92820	318 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	IGSF21	Q96ID5	467 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	CARD9	Q9H257	536 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	ZNF197	O14709	1029 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	TXNL1	O43396	289 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	RAF1	P04049	648 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	SKIL	P12757	684 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	ACP1	P24666	158 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	SRD5A2	P31213	254 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	DCT	P40126	519 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	FMO5	P49326	533 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	HERV-K104	P61576	105 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	HTD2	P86397	168 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	ABR	Q12979	859 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	BATF2	Q8N1L9	274 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	TMEM99	Q8N816	258 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	LRTM2	Q8N967	370 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	MED30	Q96HR3	178 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	C4orf45	Q96LM5	186 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	KRT23	Q9C075	422 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592		H3BMM5	538 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	KRT33A	O76009	404 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	DFFB	O76075	338 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	REC8	O95072	547 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	NR3C1	P04150	777 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	YES1	P07947	543 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	ETS1	P14921	441 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	AREG	P15514	252 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	LHCGR	P22888	699 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	OR3A3	P47888	321 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	CLCN4	P51793	760 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	CLDN17	P56750	224 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	KEAP1	Q14145	624 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SENP1-208	ENST00000551592	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms