RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541456.1

PRR4-209, Transcript of proline rich 4, human

TSL 3

Gene PRR4, Length 454 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRR4-209	ENST00000541456	MPZ	P25189	248 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	DPP4	P27487	766 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	CACNG1	Q06432	222 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	SSX2	Q16385	188 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	VPS36	Q86VN1	386 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	STH	Q8IWL8	128 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	BEST3	Q8N1M1	668 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	NCLN	Q969V3	563 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	ERGIC1	Q969X5	290 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	GUCD1	Q96NT3	240 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	TAAR6	Q96RI8	345 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	ALG12	Q9BV10	488 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	KLHL31	Q9H511	634 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	EXO5	Q9H790	373 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	ACTR8	Q9H981	624 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	4.68	□□□□□ -1.66	3e-6	■■■■■ 56.9
PRR4-209	ENST00000541456	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456		A0A075B6Q4	140 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	ZNF197	O14709	1029 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	PSMD3	O43242	534 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	GRID2	O43424	1007 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	SNX3	O60493	162 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	B4GALT2	O60909	372 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	UGT2B4	P06133	528 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	LIPF	P07098	398 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	APRT	P07741	180 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	TPM1	P09493	284 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	CLU	P10909	449 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	ATP6V1C1	P21283	382 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	TNFSF8	P32971	234 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	AVPR1A	P37288	418 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	CAPG	P40121	348 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	OR3A3	P47888	321 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	CD151	P48509	253 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	NAPA	P54920	295 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	CLDN15	P56746	228 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	TAS2R38	P59533	333 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	UBE2H	P62256	183 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	LINGO4	Q6UY18	593 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	CUZD1	Q86UP6	607 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	FAM131B	Q86XD5	332 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	PALB2	Q86YC2	1186 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	NECAB1	Q8N987	351 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	SMPDL3B	Q92485	455 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	HAS2	Q92819	552 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	FAM46B	Q96A09	425 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	GKN1	Q9NS71	199 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	BARHL2	Q9NY43	387 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	NARF	Q9UHQ1	456 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	TMEM94	Q12767	1356 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRR4-209	ENST00000541456	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		4.66	□□□□□ -1.66

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