RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516208.1

RNU6-1194P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1194, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1194P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SPDL1Q96EA4 605 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1194P-201ENST00000516208 CMTM3Q96MX0 182 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1194P-201ENST00000516208 KLHL5Q96PQ7 755 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1194P-201ENST00000516208 CDRT15Q96T59 188 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1194P-201ENST00000516208 MUC13Q9H3R2 512 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1194P-201ENST00000516208 LIME1Q9H400 295 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1194P-201ENST00000516208 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1194P-201ENST00000516208 Q9H8V8 135 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1194P-201ENST00000516208 GKN1Q9NS71 199 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1194P-201ENST00000516208 NLGN3Q9NZ94 848 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PKD2L2Q9NZM6 624 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1194P-201ENST00000516208 EHD2Q9NZN4 543 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1194P-201ENST00000516208 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1194P-201ENST00000516208 CLEC4EQ9ULY5 219 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SPATA2Q9UM82 520 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ABCG2Q9UNQ0 655 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1194P-201ENST00000516208 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ITGB4P16144 1822 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa0.4□□□□□ -2.34
RNU6-1194P-201ENST00000516208 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa0.4□□□□□ -2.34
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PTCH1Q13635 1447 aa0.4□□□□□ -2.34
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 A0A1W2PPM1 405 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 H3BMM5 538 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SLC1A7O00341 560 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ARPC2O15144 300 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ADAMDEC1O15204 470 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TSPAN1O60635 241 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PRAMEF11O60813 436 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PEX14O75381 377 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 KBTBD11O94819 623 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 IGHG1P01857 330 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 RB1P06400 928 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 DANCRP0C864 163 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ZNF853P0CG23 659 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PRKAR1AP10644 381 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 NR2C1P13056 603 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 AADACP22760 399 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TNFRSF4P43489 277 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 CRYBA2P53672 197 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ADARP55265 1226 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 CDH8P55286 799 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 RIPPLY3P57055 190 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 DCDC1P59894 354 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 KRTAP12-3P60328 96 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 VEZF1Q14119 521 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 EBI3Q14213 229 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 CCL14Q16627 93 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TMEM266Q2M3C6 531 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 IGSF11Q5DX21 431 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ZNF506Q5JVG8 444 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TMEM154Q6P9G4 183 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 IKBIPQ70UQ0 350 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PIGWQ7Z7B1 504 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 LINC00346Q8IVM7 164 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ENTHD1Q8IYW4 607 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SLC22A15Q8IZD6 547 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 GPC2Q8N158 579 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 NDUFAF2Q8N183 169 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 Q8N9L7 120 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ZNRF1Q8ND25 227 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 OR6F1Q8NGZ6 308 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 MORC4Q8TE76 937 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 TRIM63Q969Q1 353 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 LURAP1Q96LR2 239 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 CFAP57Q96MR6 1250 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 NCAPGQ9BPX3 1015 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 CHRDL1Q9BU40 450 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PAXXQ9BUH6 204 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 HRH4Q9H3N8 390 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 KCNK15Q9H427 330 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 MARCH7Q9H992 704 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PREBQ9HCU5 417 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 UBN1Q9NPG3 1134 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 SENP1Q9P0U3 644 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PDP2Q9P2J9 529 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 POLLQ9UGP5 575 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 PGAP2Q9UHJ9 254 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1194P-201ENST00000516208 RSPH14Q9UHP6 348 aa0.4□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms