RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 CCND1P24385 295 aa23.36■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 CSNK1G2P78368 415 aa23.36■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 PAQR3Q6TCH7 311 aa23.36■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 KIAA0408Q6ZU52 694 aa23.36■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 CNTN4Q8IWV2 1026 aa23.36■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 OR1N1Q8NGS0 311 aa23.36■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 METTL21AQ8WXB1 218 aa23.36■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 LINGO1Q96FE5 620 aa23.36■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 CERS2Q96G23 380 aa23.36■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 ATG10Q9H0Y0 220 aa23.36■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 SH2B3Q9UQQ2 575 aa23.36■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 CLDN1O95832 211 aa23.35■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 CYC1P08574 325 aa23.35■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 IL1RNP18510 177 aa23.35■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 HIST1H2ADP20671 130 aa23.35■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 GABRB3P28472 473 aa23.35■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 EFNA3P52797 238 aa23.35■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 CDKN2DP55273 166 aa23.35■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 BBS9Q3SYG4 887 aa23.35■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 MFSD4BQ5TF39 518 aa23.35■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 PRSS41Q7RTY9 318 aa23.35■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 BCORP1Q8N888 145 aa23.35■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 CAMKVQ8NCB2 501 aa23.35■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 SLCO2A1Q92959 643 aa23.35■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa23.35■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 HIST1H2AJQ99878 128 aa23.35■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 H2AFJQ9BTM1 129 aa23.35■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 TUBB6Q9BUF5 446 aa23.35■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 VN1R1Q9GZP7 353 aa23.35■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 OLAHQ9NV23 265 aa23.35■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 PLA2G3Q9NZ20 509 aa23.35■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 TRAV17A0A0B4J275 112 aa23.34■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 JRKO75564 520 aa23.34■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 ICAM2P13598 275 aa23.34■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 GRK3P35626 688 aa23.34■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 BCL6P41182 706 aa23.34■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 TNFSF10P50591 281 aa23.34■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 NAE1Q13564 534 aa23.34■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 INAQ16352 499 aa23.34■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 PHKG1Q16816 387 aa23.34■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 MINDY4Q4G0A6 757 aa23.34■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 MSS51Q4VC12 460 aa23.34■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 LCTLQ6UWM7 567 aa23.34■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 ASPGQ86U10 573 aa23.34■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa23.34■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 HAS2Q92819 552 aa23.34■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 MACROD1Q9BQ69 325 aa23.34■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 SLX1AQ9BQ83 275 aa23.34■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 SGPP1Q9BX95 441 aa23.34■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 HCN3Q9P1Z3 774 aa23.34■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa23.33■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 FEZF1A0PJY2 475 aa23.33■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 AHSGP02765 367 aa23.33■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 ITGAMP11215 1152 aa23.33■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 CDH1P12830 882 aa23.33■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 GALNT7Q86SF2 657 aa23.33■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 OR51Q1Q8NH59 317 aa23.33■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 FAM129AQ9BZQ8 928 aa23.33■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 ANKHQ9HCJ1 492 aa23.33■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 SLC17A6Q9P2U8 582 aa23.33■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 OSGIN2Q9Y236 505 aa23.33■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 UNC79Q9P2D8 2635 aa23.32■■□□□ 1.32
ALYREF-203ENST00000511412 SLC35G6P0C7Q6 338 aa23.32■■□□□ 1.32
ALYREF-203ENST00000511412 TCP1P17987 556 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
ALYREF-203ENST00000511412 XCR1P46094 333 aa23.32■■□□□ 1.32
ALYREF-203ENST00000511412 IL2P60568 153 aa23.32■■□□□ 1.32
ALYREF-203ENST00000511412 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
ALYREF-203ENST00000511412 LANCL3Q6ZV70 420 aa23.32■■□□□ 1.32
ALYREF-203ENST00000511412 GPATCH11Q8N954 259 aa23.32■■□□□ 1.32
ALYREF-203ENST00000511412 TM4SF19Q96DZ7 209 aa23.32■■□□□ 1.32
ALYREF-203ENST00000511412 IMMP1LQ96LU5 166 aa23.32■■□□□ 1.32
ALYREF-203ENST00000511412 HAUS8Q9BT25 410 aa23.32■■□□□ 1.32
ALYREF-203ENST00000511412 RNF32Q9H0A6 362 aa23.32■■□□□ 1.32
ALYREF-203ENST00000511412 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
ALYREF-203ENST00000511412 ARL15Q9NXU5 204 aa23.32■■□□□ 1.32
ALYREF-203ENST00000511412 SGK494L7N484 410 aa23.31■■□□□ 1.32
ALYREF-203ENST00000511412 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
ALYREF-203ENST00000511412 TSPAN12O95859 305 aa23.31■■□□□ 1.32
ALYREF-203ENST00000511412 F10P00742 488 aa23.31■■□□□ 1.32
ALYREF-203ENST00000511412 PER3P56645 1201 aa23.31■■□□□ 1.32
ALYREF-203ENST00000511412 ABHD17BQ5VST6 288 aa23.31■■□□□ 1.32
ALYREF-203ENST00000511412 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
ALYREF-203ENST00000511412 SLC26A11Q86WA9 606 aa23.31■■□□□ 1.32
ALYREF-203ENST00000511412 IGDCC3Q8IVU1 814 aa23.31■■□□□ 1.32
ALYREF-203ENST00000511412 PDIK1LQ8N165 341 aa23.31■■□□□ 1.32
ALYREF-203ENST00000511412 KCT2Q8NC54 265 aa23.31■■□□□ 1.32
ALYREF-203ENST00000511412 SLC13A3Q8WWT9 602 aa23.31■■□□□ 1.32
ALYREF-203ENST00000511412 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
ALYREF-203ENST00000511412 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
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