RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488196.5

STRADB-209, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 424 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-209ENST00000488196 RHBDF1Q96CC6 855 aa22.2■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 THAP11Q96EK4 314 aa22.2■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 YIPF2Q9BWQ6 316 aa22.2■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 DRC3Q9H069 523 aa22.2■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 SPNS1Q9H2V7 528 aa22.2■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 P4HTMQ9NXG6 502 aa22.2■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 CDC14AQ9UNH5 594 aa22.2■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 BAHCC1Q9P281 2608 aa22.2■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 A6NL46 340 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 PDGFAP04085 211 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 SLC35E2BP0CK96 405 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 PLA2G2AP14555 144 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 HNMTP50135 292 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 ATP6V0D1P61421 351 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 OCA2Q04671 838 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 DLG1Q12959 904 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 VWA2Q5GFL6 755 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 MROH9Q5TGP6 573 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 TCTN3Q6NUS6 607 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 GPSM1Q86YR5 675 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 AMER3Q8N944 861 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 MFSD9Q8NBP5 474 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 TM4SF19Q96DZ7 209 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 MVB12AQ96EY5 273 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 IP6K3Q96PC2 410 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 CYTH2Q99418 400 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 SLC25A23Q9BV35 468 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 ACSS3Q9H6R3 686 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 TRPC4Q9UBN4 977 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 DYRK1BQ9Y463 629 aa22.19■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 DOCK10Q96BY6 2186 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 HMX2A2RU54 273 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 PEX12O00623 359 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 OR1F1O43749 312 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 SLC28A2O43868 658 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 ZGLP1P0C6A0 271 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 MMP11P24347 488 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 SLC26A3P40879 764 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 KCNC1P48547 511 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 RRADP55042 308 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 KLC1Q07866 573 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 DSG2Q14126 1118 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 FAM53BQ14153 422 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 NDUFA9Q16795 377 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 SYT16Q17RD7 645 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 FBXO48Q5FWF7 155 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 COLEC12Q5KU26 742 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 PRSS41Q7RTY9 318 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 ASPGQ86U10 573 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 KCT2Q8NC54 265 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 CAMKVQ8NCB2 501 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 OR9A4Q8NGU2 314 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 SLC13A3Q8WWT9 602 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 MIEF2Q96C03 454 aa22.18■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 NUP210LQ5VU65 1888 aa22.17■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 TRBC2A0A5B9 178 aa22.17■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 TAPBPO15533 448 aa22.17■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 WDR47O94967 919 aa22.17■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 CRABP2P29373 138 aa22.17■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 SLC6A12P48065 614 aa22.17■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 DCAF10Q5QP82 559 aa22.17■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 NXPE4Q6UWF7 544 aa22.17■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 ASB18Q6ZVZ8 466 aa22.17■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 TMPRSS11BQ86T26 416 aa22.17■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 LAPTM4BQ86VI4 370 aa22.17■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 LRRN4CLQ8ND94 238 aa22.17■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa22.17■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 EXT2Q93063 718 aa22.17■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 KIAA1191Q96A73 305 aa22.17■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 ESAMQ96AP7 390 aa22.17■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 MOCOSQ96EN8 888 aa22.17■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 MESP1Q9BRJ9 268 aa22.17■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 CRB3Q9BUF7 120 aa22.17■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 NFU1Q9UMS0 254 aa22.17■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa22.17■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 KCNE2Q9Y6J6 123 aa22.17■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 NBASA2RRP1 2371 aa22.16■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa22.16■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 SOCS6O14544 535 aa22.16■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 SUV39H1O43463 412 aa22.16■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 CEACAM4O75871 244 aa22.16■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 RHOXF2BP0C7M4 288 aa22.16■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 IL1RNP18510 177 aa22.16■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 RAPSNQ13702 412 aa22.16■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 SHISA5Q8N114 240 aa22.16■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 FDCSPQ8NFU4 85 aa22.16■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa22.16■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 RHOXF2Q9BQY4 288 aa22.16■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 TMEM79Q9BSE2 394 aa22.16■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 SARGQ9BW04 601 aa22.16■■□□□ 1.14
STRADB-209ENST00000488196 FUT8Q9BYC5 575 aa22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms