RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460278.5

ANKRD28-205, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-205ENST00000460278 I3L1I5 382 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 L7N2F9 121 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 M0QZ24 198 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 HIP1O00291 1037 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CTDSPLO15194 276 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC16A5O15375 505 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 MAGEB3O15480 346 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 AP5Z1O43299 807 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 PPIP5K2O43314 1243 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 MGRN1O60291 552 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CYTIPO60759 359 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 GMNNO75496 209 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SCGB2A1O75556 95 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ATP5HO75947 161 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SPDEFO95238 335 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 OR2T7P0C7T2 308 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 PRKAR1AP10644 381 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CHRNB1P11230 501 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 UNGP13051 313 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CPA3P15088 417 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 M6PRP20645 277 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 GLRA2P23416 452 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ITGA3P26006 1051 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 PSMA5P28066 241 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 NMBRP28336 390 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 PCSK6P29122 969 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CRABP2P29373 138 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 IFNA8P32881 189 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 PITPNBP48739 271 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 RAB14P61106 215 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 DGCR2P98153 550 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 PPP2R2BQ00005 443 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 GALK2Q01415 458 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SMARCB1Q12824 385 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CHIT1Q13231 466 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 PDE7AQ13946 482 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 DOC2AQ14183 400 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 DMC1Q14565 340 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC39A14Q15043 492 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 KARSQ15046 597 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 TSC22D1Q15714 1073 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 KIF19Q2TAC6 998 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 KLHL38Q2WGJ6 581 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 XKR9Q5GH70 373 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 TCTE1Q5JU00 501 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 DCAF12L2Q5VW00 463 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 TPGS2Q68CL5 300 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 PDPK2PQ6A1A2 396 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 OR6B2Q6IFH4 312 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM122CQ6P4D5 195 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ERICH5Q6P6B1 374 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 B3GLCTQ6Y288 498 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 MACC1Q6ZN28 852 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC29A4Q7RTT9 530 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 NRARPQ7Z6K4 114 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ERICH1Q86X53 443 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 UNC5CLQ8IV45 518 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CD302Q8IX05 232 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 DDIASQ8IXT1 998 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 RASGEF1CQ8N431 466 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 AMER3Q8N944 861 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 OR7G1Q8NGA0 311 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 OR56B2PQ8NGI1 322 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 LILRB4Q8NHJ6 448 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC26A7Q8TE54 656 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SGF29Q96ES7 293 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC47A1Q96FL8 570 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 NSMCE3Q96MG7 304 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 TCEANC2Q96MN5 208 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ATG101Q9BSB4 218 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CCDC28BQ9BUN5 200 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 SCNM1Q9BWG6 230 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ACPTQ9BZG2 426 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CCSER1Q9C0I3 900 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 GBA3Q9H227 469 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 XKR8Q9H6D3 395 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 DCTPP1Q9H773 170 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 MVB12BQ9H7P6 319 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 LRRC40Q9H9A6 602 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 UCK1Q9HA47 277 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 MAGEF1Q9HAY2 307 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 TRPC7Q9HCX4 862 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ARMC1Q9NVT9 282 aa3.28□□□□□ -1.88
ANKRD28-205ENST00000460278 ACSL5Q9ULC5 683 aa3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms