RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
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RNU6-78P-201ENST00000362897 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP2.35□□□□□ -2.03
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